木香花抗黑斑病基因RbRdr1的克隆及表达分析

木香花抗黑斑病基因RbRdr1的克隆及表达分析

论文摘要

月季黑斑病是月季露地栽培的第一大病害。是世界性的病害,发生普遍且严重,较难防治,其病原菌为蔷薇盘二孢(Marssoninarosae)。伴随着月季定向选育工作的开展,其病原菌易产生各类生理小种,导致月季的抗病性逐渐变弱;目前,喷施化学药剂的方法可以用来预防和抑制病原菌的产生,但化学药剂的大量使用不仅增加了生产成本,还会导致生态环境的恶化。分子生物学的深入发展,使得从植物本身去寻找抗逆性变为可能。木香花为优质的野生资源,是高抗黑斑病种。本研究以木香花为研究对象,采用TA克隆法和RACE技术,获得抗黑斑病基因RbRdr1全长序列,并对其进行生物信息学分析;采用实时荧光定量PCR法对该基因在木香花的不同组织部位,以及木香花成熟叶片受黑斑病菌侵染不同时期的时空表达进行分析。主要研究结果如下:1.克隆获得1个全长基因,为3462bp。其包含了 1个33bp的5’-UTR,1个3396bp的ORF,1 个33bp的3’-UTR,将其命名为RbRdr1 GenBank注册号MK584935。2.该基因的亚细胞定位于线粒体及过氧化物酶体,不具有信号肽及跨膜结构域,a-螺旋及无规卷曲为主要二级结构。氨基酸同源序列多重比对发现,木香花RbRdr1与野蔷薇和玫瑰具有较高的同源性,其中与野蔷薇同源性为86%,玫瑰同源性为84%。3.通过实时荧光定量PCR对RbRdr1在木香花不同组织部位,以及木香花成熟叶片受黑斑病菌侵染不同时期的时空表达进行分析。结果显示,在不同的组织部位中RbRdr1的表达量差异显著,在幼叶和成熟叶中的相对表达量较高,在根、茎及花瓣中的相对表达量较低。该候选基因在受黑斑病菌侵染不同时期,其相对表达量均诱导积极上调,且在6h最高。这表明该候选基因可能参与了早期寄主——黑斑病菌的互作过程。该研究结果为进一步研究和利用蔷薇属抗黑斑病基因奠定了基础。

论文目录

  • 中文摘要
  • Abstract
  • 缩列词表
  • 第一章 研究背景
  •   1 月季简介
  •   2 月季黑斑病概述
  •     2.1 发病症状及危害
  •     2.2 黑斑病菌的分类
  •     2.3 黑斑病菌的形态
  •     2.4 发病原因及发病规律
  •       2.4.1 发病原因
  •       2.4.2 发病规律
  •     2.5 月季黑斑病的致病概述
  •   3 月季品种的抗性
  •     3.1 月季抗黑斑病的超微结构
  •     3.2 黑斑病的生理生化机制
  •     3.3 抗性遗传
  •   4 月季抗黑斑病的分子水平研究
  •     4.1 抗黑斑病基因Rdr1的概述
  •     4.2 月季遗传图谱构建
  •   5 本研究的目的意义及技术路线
  •     5.1 目的及意义
  •     5.2 技术路线
  • 第二章 木香花抗黑斑病基因RbRdr1全长克隆
  •   1 实验材料
  •     1.1 植物材料
  •     1.2 主要仪器与试剂
  •     1.3 培养基
  •     1.4 引物序列
  •   2 实验方法
  •     2.1 木香花总RNA的提取
  •     2.2 总RNA完整性、浓度及纯度检测
  •     2.3 cDNA第一条链的合成
  •     2.4 目的片段PCR克隆
  •     2.5 目的片段琼脂糖凝胶回收及纯化
  •     2.6 连接与转化
  •   3 结果与分析
  •     3.1 总RNA的提取
  •     3.2 木香花抗黑斑病基因cDNA全长的获得
  • 第三章 木香花RbRdr1基因序列的生物信息学分析
  •   1 材料与方法
  •     1.1 数据来源
  •     1.2 RbRdr1蛋白的结构特征分析
  •     1.3 系统进行分析
  •   2 结果与分析
  •     2.1 RbRdr1蛋白的理化性质
  •     2.2 RbRdr1蛋白的信号肽、亚细胞定位及跨膜分析
  •     2.3 RbRdr1蛋白的二级结构及三级结构预测
  •     2.4 系统进化分析
  •   3 讨论
  • 第四章 木香花RbRdr1基因的时空表达分析
  •   1 实验材料
  •     1.1 植物材料
  •     1.2 引物序列
  •     1.3 主要仪器与试剂
  •   2 实验方法
  •     2.1 木香花成熟叶电镜扫描
  •     2.2 总RNA的提取
  •     2.3 cDNA的反转录
  •     2.4 RbRdr1基因qRT-PCR表达分析
  •   3 结果与分析
  •     3.1 木香花成熟叶扫描分析
  •     3.2 引物特异性扩增分析
  •     3.3 RbRdr1在木香花不同组织部位的表达分析
  •     3.4 抗黑斑病候选基因RbRdr1的qRT-PCR表达分析
  •   4 讨论
  • 第五章 结论及后续工作建议
  •   1 主要研究结果
  •   2 后续工作建议
  • 参考文献
  • 附图
  • 攻读硕士学位期间完成的科研成果及获奖情况
  • 致谢
  • 文章来源

    类型: 硕士论文

    作者: 张真建

    导师: 唐开学

    关键词: 木香花,基因克隆,黑斑病,生物信息学分析,实时定量

    来源: 云南大学

    年度: 2019

    分类: 基础科学,农业科技

    专业: 生物学,生物学,植物保护,园艺

    单位: 云南大学

    分类号: S436.8;Q943.2

    总页数: 60

    文件大小: 4456K

    下载量: 40

    相关论文文献

    • [1].雨季的木香花[J]. 思维与智慧 2017(18)
    • [2].牵起你的手,做你倾听的左耳[J]. 现代妇女 2017(05)
    • [3].牵起你的手,做你倾听的左耳[J]. 微型小说选刊 2017(15)
    • [4].牵起你的手,做你倾听的左耳[J]. 情感读本 2017(04)
    • [5].木香花开满庭芳[J]. 花木盆景(花卉园艺) 2013(05)
    • [6].做一个木香花藤架[J]. 中国花卉盆景 2010(09)
    • [7].木香花湿雨沉沉[J]. 江淮法治 2014(14)
    • [8].木香花挥发油组分的定量结构-保留相关性[J]. 湖北农业科学 2016(11)
    • [9].牵起你的手,做你倾听的左耳[J]. 人生与伴侣(上半月版) 2016(08)
    • [10].翩翩少年是我的风景[J]. 知识窗(教师版) 2010(08)
    • [11].花之“俏”[J]. 作文成功之路(中) 2011(09)
    • [12].十七岁的天空[J]. 词刊 2010(12)
    • [13].花逢知音[J]. 食品与生活 2019(05)
    • [14].让生命芬芳[J]. 作文成功之路(高中) 2010(Z1)
    • [15].木香花挥发性组分的定量结构-色谱保留关系研究[J]. 林产化学与工业 2009(04)
    • [16].白木香花和果实挥发油成分的GC-MS分析[J]. 热带亚热带植物学报 2009(03)
    • [17].记一忘三二 散文[J]. 滇池 2019(07)
    • [18].12个月的自然观察笔记 梨花风起正清明[J]. 知识就是力量 2019(04)
    • [19].咖啡馆之歌[J]. 延安文学 2019(06)
    • [20].扇动花香的翅膀[J]. 中国校园文学 2016(12)
    • [21].云南木香花天然居群的表型多样性研究[J]. 云南大学学报(自然科学版) 2010(02)
    • [22].闫永敏作品[J]. 诗选刊 2008(04)
    • [23].张昆华:让云雀为孩子歌唱[J]. 语文世界(初中版) 2008(04)
    • [24].木香花开时[J]. 意林(原创版) 2020(12)
    • [25].在熟悉的生活中找“米”[J]. 作文成功之路(上) 2011(01)
    • [26].野地之花[J]. 大理文化 2012(08)
    • [27].如何写出叙事类文章“我”的味道[J]. 求学 2019(19)
    • [28].2种木香花的自然香气成分分析与香型评价[J]. 上海交通大学学报(农业科学版) 2013(04)
    • [29].下期要目[J]. 林产化学与工业 2009(03)

    标签:;  ;  ;  ;  ;  

    木香花抗黑斑病基因RbRdr1的克隆及表达分析
    下载Doc文档

    猜你喜欢