布鲁氏菌介导的mmu-miR-671-5p的靶基因预测与功能富集性分析

论文摘要

为进行布鲁氏菌介导的mmu-miR-671-5p的靶基因预测,本试验利用布鲁氏菌（Brucella）感染RAW264.7细胞后,分别运用miRanda和TargetScan软件进行差异表达的mmu-miR-671-5p靶基因的预测,预测的靶基因分别有11 953和9 252个,将预测结果取交集进行韦恩（Venn）分析,重叠部分的靶基因有3 681个;利用GO与KEGG进行功能富集性分析,再利用PicTar软件进一步对mmu-miR-671-5p的靶基因进行预测,将预测结果与Venn分析结果进一步取交集,结果显示,mmu-miR-671-5p的预测靶基因有7个;实时荧光定量PCR分别验证7个预测靶基因的相对表达量发现,Tnfrsf1b与Tnip1基因相对表达量极显著降低（P<0.01）;在RAW264.7细胞中转染mmu-miR-671-5p inhibitors,分别验证7个预测靶基因的相对表达量发现,Tnfrsf1b与Tnip1基因的相对表达量极显著升高（P<0.01）;对mmu-miR-671-5p与Tnfrsf1b和Tnip1的3′非翻译区（3′UTR）结合靶位点分别进行预测,结果初步表明,mmu-miR-671-5p的靶基因为Tnfrsf1b与Tnip1,其预测结合靶位点均只有1个,分别位于Tnfrsf1b和Tnip1 3′UTR全长位置的91和305 bp。本研究结果为进一步揭示mmu-miR-671-5p在布鲁氏菌感染RAW264.7细胞过程中的功能提供科学依据。

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 赵宇,罗艺晨,顾国靖,李博文,李文杰,周志雄,帅学宏,伍莉,陈吉轩,黄庆洲,焦寒伟

关键词: 布鲁氏菌,细胞,靶基因预测,功能富集性分析

来源: 中国畜牧兽医 2019年10期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,畜牧与动物医学

单位: 西南大学动物科学学院兽医科学工程研究中心

基金: 国家自然科学基金青年基金项目(31802215),重庆市自然科学基金项目(cstc2018jcyjA0807),中央高校基本科研业务费项目(XDJK2019C024,XDJK2019D013)

分类号: Q78;S852.61

DOI: 10.16431/j.cnki.1671-7236.2019.10.004

页码: 2843-2850

总页数: 8

文件大小: 3541K

下载量: 130

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