青海地区喜马拉雅旱獭疫源地鼠疫菌基因组时空演变及其生态适应分析

论文摘要

目的探索青海地区喜马拉雅旱獭疫源地鼠疫菌基因组时空演变及其影响因素。方法采用判断抽样选取青海地区喜马拉雅旱獭疫源地自然分离到的鼠疫菌556株,对其基因组型DFR数据进行分析,采用鼠疫菌基因组分型和空间流行病学方法,绘制鼠疫菌基因组DFR时空演变专题地图,综合分析鼠疫菌基因组时空演变特征及其趋势,探索鼠疫菌基因组时空演变影响因素。结果青海地区喜马拉雅旱獭鼠疫疫源地鼠疫菌DFR分型存在着明显的时空差异。在空间尺度上,5型和8型分布广泛,其中5型主要分布在玉树和唐古拉地区,8型主要分布在海南、海西和海北等地;32型仅存在唐古拉地区,44型则分布在海北的祁连、门源2个地区。在时间尺度上,各地分离到的鼠疫菌基因组DFR型别均有不同程度的种群替代,这一特点在玉树地区表象尤为明显。结论鼠疫菌基因组型时空分布及其演变受鼠疫疫源地所在的生态环境的综合影响,而气候因素是其中的一个重要环节,这将为基于生态流行病学和基因组流行病学的现代鼠疫防治和学科建设提供参考依据。

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 张爱萍,熊浩明,杨晓燕,郑谊,戴瑞霞,金丽霞,田富彰,王梅,何建,金泳,李存香,辛有全,赵海红,李翔,魏荣杰,张雪飞

关键词: 喜马拉雅旱獭鼠疫疫源地,鼠疫菌,时空演变,生态适应

来源: 中国病原生物学杂志 2019年12期

年度: 2019

分类: 医药卫生科技

专业: 基础医学

单位: 青海省地方病预防控制所青海省鼠疫防控与研究重点实验室国家卫生健康委(共建)重点实验室(2019PT310004)

基金: 青海省基础应用研究项目(No.2013-Z-747)

分类号: R378.61

DOI: 10.13350/j.cjpb.191209

页码: 1409-1414

总页数: 6

文件大小: 1607K

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标签：喜马拉雅旱獭鼠疫疫源地论文;  鼠疫菌论文;  时空演变论文;  生态适应论文;