福建甘薯病毒病病原鉴定及主要病毒多样性

福建甘薯病毒病病原鉴定及主要病毒多样性

论文摘要

【背景】病毒病是甘薯的一种重要病害,给甘薯生产带来了严重的经济损失,而生产中甘薯病毒病病原种类复杂多样。【目的】明确福建甘薯病毒病种类、分布及流行,对主要病毒进行多样性分析。【方法】从福建主要甘薯种植区采集病毒病样品,利用PCR/RT-PCR的方法对采集的样品进行病原检测,获得病毒序列,利用MEGA 6.0构建系统进化树进行遗传分析。【结果】从福建7个甘薯产区鉴定12种甘薯病毒,包括9种RNA病毒:甘薯羽状斑驳病毒(Sweet potato feathery mottle virus,SPFMV)、甘薯褪绿矮化病毒(Sweet potato chlorotic stunt virus,SPCSV)、甘薯G病毒(Sweet potato virus G,SPVG)、甘薯C病毒(Sweet potato virus C,SPVC)、甘薯2号病毒(Sweet potato virus 2)、甘薯褪绿斑病毒(Sweet potato chlorotic fleck virus,SPCFV)、甘薯潜隐病毒(Sweet potato latent virus,SPLV)、甘薯轻型斑点病毒(Sweetpotatomildspeakingvirus,SPMSV)、黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV),3种DNA病毒:甘薯卷叶病毒(Sweet potato leaf curl virus,SPLCV),甘薯无症状1号病毒(Sweet potato symptomless virus 1,SPSMV-1),甘薯杆状DNA病毒B (SPBV-B)。SPFMV、SPCSV、SPVG和SPLCV检出率最高,分别为50.28%、41.90%、35.75%和24.58%,CMV检出率最低,为2.79%,未检测到甘薯C-6病毒(SweetpotatoC-6)和甘薯轻型斑驳病毒(Sweetpotatomild mottle virus,SPMMV)。福建甘薯主要以2-6种病毒复合侵染为主,单一侵染率占14.39%,2种以上复合侵染占85.61%。福建SPFMV分离物存在EA、O和RC3种株系,SPCSV分离物存在WA1种株系,未发现EA株系,甘薯卷叶病毒分属于2个不同的株系群。【结论】福建甘薯病毒种类多样,以复合侵染为主,且存在多种株系,遗传结构复杂。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 供试材料、主要试剂和仪器
  •   1.2 甘薯病毒的检测
  •     1.2.1 植物总RNA与总DNA的提取
  •     1.2.2 cDNA合成
  •     1.2.3 引物的设计
  •     1.2.4 PCR和RT-PCR扩增
  •     1.2.5 PCR产物的克隆及序列分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 甘薯病毒病的田间症状及发生趋势
  •   2.2 甘薯的病毒种类检测
  •   2.3 福建省甘薯病毒检出率及分布
  •   2.4 甘薯病毒病的复合侵染
  •   2.5 主要病毒遗传多样性分析
  • 3 讨论与结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 李华伟,刘中华,张鸿,李国良,林赵淼,邱思鑫

    关键词: 甘薯病毒病,鉴定,复合侵染,遗传多样性

    来源: 微生物学通报 2019年12期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,农业科技

    专业: 植物保护

    单位: 福建省农业科学院作物研究所农业部南方薯类科学观测实验站/福建省特色旱作物品种选育工程技术研究中心

    基金: 福建省公益类科研专项(2017R1026-4),现代农业产业技术体系(CARS-10-B14),福建省种业创新与产业化工程项目(fjzycxny2017005),福建省农业科学院创新团队项目(STIT2017-2-3)~~

    分类号: S435.31

    DOI: 10.13344/j.microbiol.china.190538

    页码: 3267-3277

    总页数: 11

    文件大小: 1928K

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