导读:本文包含了核苷酸全序列测定论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:序列,基因,病毒,核苷酸,基因组,线粒体,亚型。
核苷酸全序列测定论文文献综述
刘亚刚,孙凯,王妍,王盼盼,王荣[1]（2012）在《牦牛病毒性黏膜病病毒结构蛋白核苷酸的序列测定与分析》一文中研究指出对首次从牦牛体内分离出的BVDV进行结构蛋白的研究与分析具有重要的理论价值和学术意义,本研究参考GenBank中发表的BVDV毒株的基因组序列设计四对对引物,利用PCR扩增出预期的2700bp目的片段.扩增产物克隆至pMD19-T Vector,经质粒PCR鉴定及酶切鉴定获得阳性重组质粒并对其进行测序.测序结果经DNNMAN同源性比较分析,克隆得到的结构蛋白基因与NADL株同源性最高,但核苷酸同源性仅为70.1%,推导氨基酸同源性仅为74.4%,证明牦牛株BVDV结构蛋白基因存在较大的变异.生物信息学分析表明结构序列中有片段高度疏水,蛋白基因推导氨基酸序列亲水性与抗原性成平行相关,亲水性和抗原性与标准毒株很相似.(本文来源于《西南民族大学学报(自然科学版)》期刊2012年04期）
闭福银,谭毅,韦增良,杨进业[2]（2010）在《广西汉坦病毒全S基因核苷酸序列测定》一文中研究指出目的查明广西汉坦病毒的基因型及其基因亚型。方法用夹夜法捕获宿主动物,用免疫吸附试验(ELISA)检测鼠肺标本,对汉坦病毒抗原阳性标本用RT-PCR法扩增,产物直接测序,拼接后获得全S基因序列,用生物软件进行核苷酸及氨基酸系列分析和病毒的系统进化分析。结果应用ELISA法检测鼠肺抗原792份,阳性6份,RT-PCR测定其中5毒株,基因型为汉城病毒,进一步的核苷酸序列分析均为S2亚型。结论广西汉坦病毒基因型为汉城型汉坦病毒,亚型为S2。(本文来源于《应用预防医学》期刊2010年06期）
邵爱华,杜建,陈葵,盛烨,郑峰丰[3]（2010）在《暗纹东方鲀线粒体基因组核苷酸全序列测定与分析》一文中研究指出以暗纹东方鲀(Takifugu fasciatus)肝的线粒体DNA为模板,参照红鳍东方鲀(T.rubripes)等近源鱼类的线粒体基因组DNA序列,设计合成14对特异引物,进行PCR扩增并测序,首次获得了暗纹东方鲀线粒体基因组全序列。结果表明,暗纹东方鲀线粒体基因组序列全长16 444 bp(GenBank登录号为GQ409967),A+T含量为55.8%,其mtDNA结构与其他脊椎动物相似,由22个tRNA基因、2个rRNA基因、13个蛋白质编码基因和1段819 bp非编码的控制区(D-loop)所组成。蛋白质基因除COⅠ和ND6的起始密码子为GTG、CCT以外,均为典型的起始密码子ATG。ND1、ATPase8、COⅢ、ND4L、ND5、Cyt b使用典型的终止密码子TAA,其他的使用不完全终止密码子。除ND6和tRNAGln、tRNAAla、tRNAAsn、tRNACys、tRNATyr、tRNASer、tRNAGlu、tRNAPro在L-链上编码之外,其余基因均在H-链编码。基因排列顺序与已测定的鲀类一致,这显示了鲀类线粒体基因排列顺序上的保守性。tRNA基因核苷酸长度为64～73nt,预测了22个tRNA基因的二级结构,均呈较为典型的叁叶草状。基于19种鲀类mtDNA全序列构建的进化树表明,暗纹东方鲀与红鳍东方鲀、中华东方鲀(T.chinensis)聚成一个姊妹群。结果还支持东方鲀属鱼类为一单系类群。(本文来源于《动物学杂志》期刊2010年05期）
王敏,周源,陈帆,王怡仲,许茹[4]（2009）在《云南和山西无偿献血人群HCV部分基因的核苷酸序列测定及基因分型》一文中研究指出目的了解云南和山西2地无偿献血人群丙型肝炎病毒(HCV)的基因型分布及其差异。方法采用荧光定量PCR(Q-PCR),对所收集的203份ELISA检测抗-HCV阳性的无偿献血者标本(云南102份,山西101份)做核酸检测,对核酸阳性的标本做E1基因扩增和测序;E1基因阴性者,进一步做NS5B基因扩增;采用DNASTAR、Bi-oedit和Mega4等软件对E1、NS5B基因进行分析及分子进化研究。结果203份ELISA检测抗-HCV阳性的无偿献血者标本中,云南102份标本经Q-PCR检测出核酸阳性55份,从中扩增出E1基因43份,补做NS5B基因扩增获得阳性结果8份;山西省101份标本经Q-PCR检测出阳性46份,从中扩增出E1基因33份,补做NS5B基因扩增获得阳性结果6份。云南省献血者HCV基因型(亚型)可分为7种:1b[7.84%(4/51)]、2a[13.73%(7/51)]、3a[17.65%(9/51)]、3b[41.18%(21/51)]、6a[7.84%(4/51)]、6n[9.80%(5/51)]和6v[1.96%(1/51)];山西省献血者HCV基因型(亚型)较简单,可分为3种:1b[89.74%(35/39)]、2a[7.69%(3/39)]和3b[2.56%(1/39)]。结论我国云南和山西2地无偿献血人群中的HCV基因型(亚型)的分布存在明显的差异。(本文来源于《中国输血杂志》期刊2009年11期）
赵耀,赵晓东[5]（2009）在《核苷酸序列测定法定量评价病毒相对适合度》一文中研究指出目的:评价核苷酸序列测定法定量检测病毒相对适合度的可靠性。方法:用RT-PCR法扩增此前筛选获得的Palivizu mab逃逸株F基因片断(分别于F基因第816位和828位带有区别于原型株的遗传标志)。RT-PCR产物经纯化、定量并调节至相同浓度,按不同比例混合后进行核苷酸序列测定。用ABI公司EDIT软件分析序列双峰部位不同RT-PCR产物所占比例,代表病毒适合度水平,用分子克隆法定量验证序列分析定量评估病毒相对适合度的可靠性。结果:按不同比例预混得RSVA2原型株和Palivizumab逃逸株(MP4和F212)分别在F基因第816位和828位出现双峰。峰高测定所获RT-PCR产物比例与预混比例十分接近。采用分子克隆法获得的RT-PCR产物比例亦与序列测定定量分析结果基本一致。结论:序列测定定量分析法评估病毒相对适合度(Relative fitness)结果稳定可靠,简便易行,适用于临床检测HIV等病毒感染性疾病耐药毒株是否出现及其适合度变化。(本文来源于《重庆医科大学学报》期刊2009年07期）
雷永良,王晓光,陈秀英,叶碧峰,柳付明[6]（2009）在《肠道病毒71型浙江毒株全基因组核苷酸序列测定分析》一文中研究指出目的:了解肠道病毒71型在浙江的流行和变异情况以及目前中国流行株的遗传学背景。方法:RT-PCR反应测定EV71型浙江病毒株(Zhejiang08)全基因组核苷酸序列,并进行序列的同源性比较和种系发生分析。结果:Zhe-jiang08株病毒全基因组核苷酸序列长度为7406 bp,与中国大陆安徽阜阳毒株17.08/1和17.08/3整个基因组核苷酸同源性为98.2%和98.3%,氨基酸同源性均为99.4%;与广东深圳毒株SHZH98和SHZH03基因组核苷酸同源性为90.9%和94.2%,氨基酸同源性为98.8%和98.5%;与EV71国际标准株MS/7423/87和BrCr基因组核苷酸同源性仅为81.7%和79.7%,氨基酸同源性为95.7%和96.1%。对外壳蛋白VP1编码区进行种系发生分析显示中国大陆分离的5株EV71病毒与中国台湾4株病毒进化关系较近,与国际标准株以及东南亚毒株进化关系较远,其中浙江与安徽毒株进化关系最近。结论:EV71型病毒Zhejiang08株全基因组的组成和结构符合肠道病毒特征,与其它EV71型病毒具有相同的基因组结构,Zhejiang08株与中国大陆阜阳和深圳毒株亲缘关系最近,与台湾流行株亲缘关系较近,而与新加坡、马来西亚流行株的差别较为明显,与国际标准株则有较大的差异;Zhejiang08株与安徽阜阳毒株具有共同的进化途径,推断Zhe-jiang08株与阜阳毒株可能共同来源于近年来在广东深圳地区流行的EV71病毒株甚至有可能来源于EV71病毒1998年在台湾大规模流行时的毒株。(本文来源于《中国卫生检验杂志》期刊2009年01期）
孔义波,张兴晓,姜世金,赵钦,孙亚妮[7]（2007）在《从SPF鸡胚中检出内源性白血病病毒及SD0501株全基因组核苷酸序列测定与分析》一文中研究指出禽白血病病毒(Avian leukosis viruses,ALVs)是以主要引起禽各种造血细胞肿瘤性增生为特征的一类反转录病毒群。研究表明 ALV 对人类健康可能存在潜在的威胁。ALV 与其它免疫抑制性病毒混合感染(本文来源于《第15届世界禽病大会、中国畜牧兽医学会2007年学术年会论文集》期刊2007-09-01）
李书光,沈志强,单虎,管宇,肖跃强[8]（2007）在《大肠杆菌菌毛抗原K99与耐热肠毒素STⅠ融合基因的克隆与核苷酸序列测定》一文中研究指出采用PCR技术,从大肠杆菌K99中扩增出0.54kb的K99菌毛抗原基因,然后将其克隆到pUCm-T载体上,用BglⅡ鉴定K99插入的方向并测序。选择目的基因片段插入方向正确的重组质粒经BamHⅠ和SalⅠ双酶切后,通过T4连接酶与同样经BamHⅠ和SalⅠ双酶切合成的耐热肠毒素STⅠ核苷酸序列连接,通过PCR方法鉴定分析和核苷酸序列测序分析,证明插入的K99-STⅠ融合基因片段具有正确的核苷酸序列。(本文来源于《中国兽药杂志》期刊2007年04期）
张建新,吴云锋,王睿,罗朝鹏[9]（2007）在《西瓜花叶病毒中国分离株全基因组核苷酸序列测定》一文中研究指出Watermelon and melon mosaic disease is the important disease in agricultural production,mostly caused by watermelon mosaic virus.In this paper,the complete nucleotide sequence of watermelon mosaic virus Chinese isolate(WMV-Ch)was firstly determined.Excluding the 3'-terminal poly(A)tail,the genome was 10037 nt long,containing 5'-and 3'-terminal untranslated regions and a large open reading frame.The genome encoded a polyprotein of 3217 amino acids with a predicted Mr of 365.8 kD.Based on comparison with the proposed location of cleavage sites of other potyvirus polyproteins,10 mature proteins were predicted.There were 92.5% nucleotide and 96.4% amino acid identities over entire genome between WMV-Ch and France isolate(WMV-Fr),respectively.The nucleotide identity of the coat protein genes among WMV-Ch and WMV from different countries was all less than 95%,and phylogenetic tree revealed that WMV-Ch was most close to Japanese isolate.(本文来源于《病毒学报》期刊2007年02期）
赵晓东[10]（2006）在《核苷酸序列测定法定量评价病毒相对适合度》一文中研究指出目的:病毒适合度代表某一病毒在一特定环境中的生长复制能力。适合度高低与病毒组织嗜性、耐药毒株出现及病情程度密切相关,是近来临床病毒学研究的热点。本研究评价核苷酸序列测定定量检测病毒相对适合度的可行性与可靠性。方法:用RT-PCR法扩增此前筛选获得的Palivizumab逃逸株F基因片断(分别于F基因第816位和828位带有区别于原型株的遗传标志)。RT-PCR产物经纯化、定量并调节至相同浓度,按不同比例混合后进行核苷酸序列测定。用ABI EDIT软件分析序列双峰部位不同(本文来源于《中华医学会第十四次全国儿科学术会议论文汇编》期刊2006-11-01）
核苷酸全序列测定论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
目的查明广西汉坦病毒的基因型及其基因亚型。方法用夹夜法捕获宿主动物,用免疫吸附试验(ELISA)检测鼠肺标本,对汉坦病毒抗原阳性标本用RT-PCR法扩增,产物直接测序,拼接后获得全S基因序列,用生物软件进行核苷酸及氨基酸系列分析和病毒的系统进化分析。结果应用ELISA法检测鼠肺抗原792份,阳性6份,RT-PCR测定其中5毒株,基因型为汉城病毒,进一步的核苷酸序列分析均为S2亚型。结论广西汉坦病毒基因型为汉城型汉坦病毒,亚型为S2。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
核苷酸全序列测定论文参考文献
[1].刘亚刚,孙凯,王妍,王盼盼,王荣.牦牛病毒性黏膜病病毒结构蛋白核苷酸的序列测定与分析[J].西南民族大学学报(自然科学版).2012
[2].闭福银,谭毅,韦增良,杨进业.广西汉坦病毒全S基因核苷酸序列测定[J].应用预防医学.2010
[3].邵爱华,杜建,陈葵,盛烨,郑峰丰.暗纹东方鲀线粒体基因组核苷酸全序列测定与分析[J].动物学杂志.2010
[4].王敏,周源,陈帆,王怡仲,许茹.云南和山西无偿献血人群HCV部分基因的核苷酸序列测定及基因分型[J].中国输血杂志.2009
[5].赵耀,赵晓东.核苷酸序列测定法定量评价病毒相对适合度[J].重庆医科大学学报.2009
[6].雷永良,王晓光,陈秀英,叶碧峰,柳付明.肠道病毒71型浙江毒株全基因组核苷酸序列测定分析[J].中国卫生检验杂志.2009
[7].孔义波,张兴晓,姜世金,赵钦,孙亚妮.从SPF鸡胚中检出内源性白血病病毒及SD0501株全基因组核苷酸序列测定与分析[C].第15届世界禽病大会、中国畜牧兽医学会2007年学术年会论文集.2007
[8].李书光,沈志强,单虎,管宇,肖跃强.大肠杆菌菌毛抗原K99与耐热肠毒素STⅠ融合基因的克隆与核苷酸序列测定[J].中国兽药杂志.2007
[9].张建新,吴云锋,王睿,罗朝鹏.西瓜花叶病毒中国分离株全基因组核苷酸序列测定[J].病毒学报.2007
[10].赵晓东.核苷酸序列测定法定量评价病毒相对适合度[C].中华医学会第十四次全国儿科学术会议论文汇编.2006
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