导读:本文包含了基因表达系列性分析论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:基因,系列,差异,家蚕,序列,基因组,结肠。
基因表达系列性分析论文文献综述
田勇,卢立志[1]（2012）在《基因表达系列分析技术在动物科学中的研究进展》一文中研究指出基因表达系列分析(serial analysis of gene expression,SAGE)是一种快速分析特定组织或细胞内基因表达信息的技术,不但可以比较不同组织细胞在不同时间、空间条件下基因表达的差异,还能发现新基因。近几年来,SAGE技术在动物基因表达研究中的应用取得了飞速发展。就SAGE技术的原理、实验路线、优缺点和改进以及SAGE在动物科学研究中的研究现状及应用前景作一简要介绍。(本文来源于《生命科学》期刊2012年10期）
鲍忠赞,张彩霞,徐世清,周前凯,魏广兵[2]（2012）在《应用基因表达系列分析(SAGE)技术研究高温处理前后家蚕的基因表达差异》一文中研究指出高温对家蚕的生理和免疫能力有明显影响。为从分子水平上探究家蚕抗高温机制,应用基因表达系列分析(SAGE)技术获得家蚕5龄雌蚕高温处理前后中肠、丝腺和脂肪体组织的基因表达谱,构建高温组(34℃)和常温组(26℃)2个家蚕SAGE文库。2个家蚕SAGE文库分别包含3555107和3580976个原始标签,其中的标签种类分别为113684和131 296个,清洁标签的种类分别为45972和49467。比较2个文库清洁标签获得65 535种差异标签,共注释4249个基因,其中有1 062个差异表达的基因(P<0.05,错误检测率FDR≤0.001并且拷贝数的差异在2倍以上)。经GO分析发现2个文库中基因的分布极其相似,表明这些基因在不同的环境温度下有类似的生物学功能并参与类似的生理代谢过程。KEGG pathway分析显示有732个基因涉及176个KEGG路径,其中有40个为差异表达基因显着富集的路径(P<0.05),超过一半的路径与代谢、生物合成和信号传导有关。上述结果有助于对家蚕抗高温基因的鉴定以及探究基因调控的网络关系。(本文来源于《蚕业科学》期刊2012年03期）
张彩霞,鲍忠赞,徐世清,周前凯,魏广兵[3]（2012）在《家蚕正反交组合F_1代的基因表达系列分析(SAGE)文库构建》一文中研究指出家蚕杂交组合存在普遍的正反交遗传表型差异现象,为探讨引起正反交组合遗传差异的分子机制,构建家蚕品种75新×7532正交F1代雌雄个体和7532×75新反交F1代雌雄个体共4个基因表达系列分析(SAGE)文库。通过正反交组合同性别子代样本间的比较,显示低表达的标签在种类上占大多数,而高表达的标签在数量上占绝对优势。以错误检测率(FDR)≤0.001且拷贝数倍数差异在2倍以上作为比较样本筛选差异表达基因(DEGs)的条件,在7532×75新的雄性样本里面有298个上调基因和46个下调基因,而在雌性样本里有453个上调基因和240个下调基因。进一步对差异表达基因进行GO和KEGG路径功能分析,筛选出在显着性富集路径中的差异表达基因,其中参与新陈代谢途径、氧化磷酸化途径以及信号传导途径的差异基因在反交组合的子代中表达明显上调。(本文来源于《蚕业科学》期刊2012年02期）
殷朝敏,雷靖行,陈叶叶,马爱民[4]（2011）在《基因表达系列分析技术在真菌功能基因组学中的应用》一文中研究指出基因表达系列分析(SAGE)是一种在mRNA水平上高通量、快速、灵敏分析细胞或组织基因表达信息,并在基因组学研究中广泛应用的技术。该技术不仅能够全面地分析特定组织或细胞表达的基因,比较不同时空条件下基因表达的差异,还可以在全基因组范围内获得基因的表达谱,从而发现新基因。综述基因表达系列分析技术在材料用量、标签长度、技术流程和标签测序等方面的研究进展及该技术在病原真菌、工业真菌和食用真菌功能基因组学中的应用。(本文来源于《生物技术通报》期刊2011年12期）
苏洪全,朱义胜,姜玉梅[5]（2010）在《基于多分类支持向量机的基因表达系列分析》一文中研究指出基因表达系列分析(Serial analysis of gene expression,SAGE)是一种基因表达数据,反映了细胞内的动态变化。模式识别和可视化方法是分析SAGE数据的基本工具,但是由于缺乏描述数据的统计特性,传统的聚类分析技术不适用于SAGE数据的分析。本文提出了一种基于多分类和支持向量机的SAGE数据的分析法。经过对模拟数据和人类癌症SAGE数据的分析,基于径向基核函数的多分类支持向量机算法"一对一"(one-against-one,OAO)算法提供了比PoissonC和PoissonS更好的分类结果。(本文来源于《生物信息学》期刊2010年04期）
樊军卫,唐华美,严东旺,王兆文,王晓亮[6]（2010）在《结肠癌实质细胞长标签基因表达系列分析文库的建立及应用》一文中研究指出目的:应用长标签基因表达系列分析(long serialan alysis of gene expression,LongSAGE)技术定量分析结肠癌实质细胞转录组,并筛选肿瘤相关基因。方法:应用激光捕获显微切割(laser capture microdissection,LCM)、RNA提取和线性扩增方法得到结肠癌实质细胞及其相应正常结肠上皮细胞的反义RNA(antisense RNA,aRNA)样品,构建LongSAGE文库;然后应用SAGE2000软件对所得序列文本进行分析,筛选肿瘤相关基因;最后采用RT-PCR方法验证该差异表达基因。结果:结肠癌细胞LongSAGE文库标签体总数为50542个,识别出基因总数为16497个。正常结肠细胞LongSAGE文库标签体总数为50124个,识别出基因总数为16417个。LongSAGE文库筛选出结肠癌差异表达基因705个(P<0.05)。转化生长因子β诱导基因(transforming growth factor β-induced gene,TGFBI)为LongSAGE文库筛选出的结肠癌相关基因,RT-PCR检测验证了其在结肠癌组织标本中表达上调。结论:LCM-LongSAGE是对结肠癌实质细胞进行定量转录组研究的可行流程。(本文来源于《肿瘤》期刊2010年06期）
张振乾,谭太龙,肖钢,官春云[7]（2009）在《基因表达系列分析法(SAGE)的改进及其在植物功能基因组研究中的应用》一文中研究指出基因表达系列分析方法(SAGE)是一种新的基因表达分析方法,与基因芯片技术一样具有高通量的特点,可测定特定组织的基因表达水平,在全基因组水平上同时定量检测数万个基因表达模式;可在未知目的基因的前提下,分析来自一个细胞的全部转录本信息;对已知或未知基因表达进行定性和定量分析。目前,虽然在疾病、发育、细胞凋亡、药物筛选等多个领域已有利用SAGE方法进行的研究,但该方法在植物功能基因组研究中的应用相对较少。本文主要综述了该方法在RNA用量、PCR循环次数、SAGE效能和可靠性、标签长度和未知标签分析等方面的改进及其在植物中构建SAGE文库、筛选新基因、基因表达图谱分析等方面的应用,从而为其在植物功能基因组研究中的进一步应用提供理论参考。(本文来源于《基因组学与应用生物学》期刊2009年06期）
梁光萍,苏踊跃,罗向东[8]（2009）在《基因表达系列分析的原理、进展及在肿瘤研究中的应用》一文中研究指出基因表达系列分析(SAGE)技术不仅能够全面地分析特定组织或细胞内表达的基因,还可以比较不同组织在不同时间、空间条件下基因表达的差异,从而发现新基因。SAGE技术在肿瘤研究中的应用发展很快。本文综述了SAGE技术的原理、应用及其近年来的发近几年展与演变。(本文来源于《现代生物医学进展》期刊2009年17期）
杨学,刘丽艳,关凤芝,李柱刚,吴广文[9]（2009）在《基因表达系列分析技术在植物基因表达中的研究进展》一文中研究指出基因表达系列分析(Serial analysis of gene expression,SAGE)是一种研究真核细胞表达基因信息的高通量检测技术,它能对细胞内所有表达基因进行定性与定量分析。SAGE技术在植物方面的应用相对较少,但在植物抗病性研究中的应用近几年发展很快。综述介绍了SAGE技术的原理与操作、实施的方法与步骤、SAGE技术的主要优点及在植物基因表达分析中的应用。明确SAGE的优势与它的缺陷,在实际应用中加以完善及采取必要的辅助方案,这样就可以构建较完美的设计思想。(本文来源于《中国麻业科学》期刊2009年04期）
王大力,黄大鹏[10]（2009）在《基因表达系列分析技术研究进展》一文中研究指出基因表达系列分析技术是一种以测序为基础,采用数字化分析手段,在转录物水平上研究细胞或组织基因表达模式的有效工具。该技术不仅能够全面地分析特定组织或细胞表达的基因,获得这些基因表达丰度的数量信息,还可比较不同组织、不同时空条件下基因表达的差异,具有高通量、高效性的特点,并能发现新基因。论文就基因表达系列分析技术的原理、特点及其改进进行综述。(本文来源于《动物医学进展》期刊2009年04期）
基因表达系列性分析论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
高温对家蚕的生理和免疫能力有明显影响。为从分子水平上探究家蚕抗高温机制,应用基因表达系列分析(SAGE)技术获得家蚕5龄雌蚕高温处理前后中肠、丝腺和脂肪体组织的基因表达谱,构建高温组(34℃)和常温组(26℃)2个家蚕SAGE文库。2个家蚕SAGE文库分别包含3555107和3580976个原始标签,其中的标签种类分别为113684和131 296个,清洁标签的种类分别为45972和49467。比较2个文库清洁标签获得65 535种差异标签,共注释4249个基因,其中有1 062个差异表达的基因(P<0.05,错误检测率FDR≤0.001并且拷贝数的差异在2倍以上)。经GO分析发现2个文库中基因的分布极其相似,表明这些基因在不同的环境温度下有类似的生物学功能并参与类似的生理代谢过程。KEGG pathway分析显示有732个基因涉及176个KEGG路径,其中有40个为差异表达基因显着富集的路径(P<0.05),超过一半的路径与代谢、生物合成和信号传导有关。上述结果有助于对家蚕抗高温基因的鉴定以及探究基因调控的网络关系。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
基因表达系列性分析论文参考文献
[1].田勇,卢立志.基因表达系列分析技术在动物科学中的研究进展[J].生命科学.2012
[2].鲍忠赞,张彩霞,徐世清,周前凯,魏广兵.应用基因表达系列分析(SAGE)技术研究高温处理前后家蚕的基因表达差异[J].蚕业科学.2012
[3].张彩霞,鲍忠赞,徐世清,周前凯,魏广兵.家蚕正反交组合F_1代的基因表达系列分析(SAGE)文库构建[J].蚕业科学.2012
[4].殷朝敏,雷靖行,陈叶叶,马爱民.基因表达系列分析技术在真菌功能基因组学中的应用[J].生物技术通报.2011
[5].苏洪全,朱义胜,姜玉梅.基于多分类支持向量机的基因表达系列分析[J].生物信息学.2010
[6].樊军卫,唐华美,严东旺,王兆文,王晓亮.结肠癌实质细胞长标签基因表达系列分析文库的建立及应用[J].肿瘤.2010
[7].张振乾,谭太龙,肖钢,官春云.基因表达系列分析法(SAGE)的改进及其在植物功能基因组研究中的应用[J].基因组学与应用生物学.2009
[8].梁光萍,苏踊跃,罗向东.基因表达系列分析的原理、进展及在肿瘤研究中的应用[J].现代生物医学进展.2009
[9].杨学,刘丽艳,关凤芝,李柱刚,吴广文.基因表达系列分析技术在植物基因表达中的研究进展[J].中国麻业科学.2009
[10].王大力,黄大鹏.基因表达系列分析技术研究进展[J].动物医学进展.2009
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