大葱ALS基因的克隆及其CRISPR/Cas9载体的构建

大葱ALS基因的克隆及其CRISPR/Cas9载体的构建

论文摘要

大葱(Allium fistulosum L., 2n=16)的生长周期长,杂草发生较为严重,目前针对大葱还没有安全有效的除草剂。作物ALS (Acetolactate synthetase)基因发生的氨基酸突变可能是导致其对ALS抑制剂类除草剂产生抗性的重要原因之一。本研究克隆了大葱的乙酰乳酸合成酶基因ALS,并对其进行了生物信息学分析;同时采用CRISPR/Cas9编辑技术,构建了表达载体。结果表明,ALS基因的长度为1 953 bp,编码650个氨基酸,并且基因中无内含子;其晶体结构包含二聚体,与酵母等大多数真核生物的晶体结构类似,并且包含有3个完整的结构域TPP enzyme N、TPP enzyme M、TPP enzyme C;系统进化树分析表明大葱除与天门冬科的芦笋有较近的亲缘关系,与其它物种差异相对较大。本研究为培育抗除草剂大葱提供理论指导。

论文目录

  • 1 结果与分析
  •   1.1 大葱ALS基因的克隆和分析
  •   1.2 ALS基因的生物信息学分析
  •     1.2.1 氨基酸序列比对
  •     1.2.2 同源性分析及系统进化树分析
  •     1.2.3 ALS蛋白的二级结构和晶体结构预测分析
  •   1.3 ALS基因表达载体的构建
  • 2 讨论
  • 3 材料与方法
  •   3.1 实验材料
  •   3.2 大葱总RNA的提取和cDNA合成
  •   3.3 ALS基因的PCR扩增及克隆
  •   3.4 生物信息学分析
  •   3.5 CRISPR表达载体的构建
  • 作者贡献
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 戴艳丽,刘倩纯,张雨菲,王永勤,刘乐承

    关键词: 大葱,乙酰乳酸合成酶,生物信息学分析,载体

    来源: 分子植物育种 2019年16期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,园艺

    单位: 长江大学园艺园林学院,北京市农林科学院蔬菜研究中心,中国科学院海洋研究所,中国科学院大学

    基金: 国家自然基金项目(31572119),北京市农林科学院科技创新能力建设专项基金项目(KJCX20170102-7,KJCX-20180427)共同资助

    分类号: S633.1;Q943.2

    DOI: 10.13271/j.mpb.017.005314

    页码: 5314-5319

    总页数: 6

    文件大小: 2485K

    下载量: 314

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