论文摘要
目的采用生物信息学方法分析帕金森病（Parkinson disease,PD）患者额叶组织的基因表达谱,来探索PD抑郁相关的机制。方法从Gene Expression Omnibus（GEO）数据库中使用"Parkinson disease"进行检索,并限定组织来源为人类（Homo sapiens）及检测方法为表达谱芯片（Expression profiling by array）,获取2019年3月20日前GEO数据库中的所有生物信息数据。使用ImaGEO（Integrative Gene Expression Meta-Analysis from GEO database）、DAVID（the Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery）、STRING在线工具及Cytoscape 3.6.1软件进行数据分析。结果根据检索条件,获得了2个数据集,共45个样本（PD组24个,健康对照组21个）。与健康对照组相比,PD组的额叶中总共有236个基因表达存在差异,其中146个基因表达水平增高,90个基因表达水平下降。根据基因本体论分析及京都基因和基因组数据库分析,该差异基因主要富集在突触后膜、细胞膜成分、突触后膜密集区、髓鞘等结构。差异基因参与了和PD发生有关的多巴胺能、谷氨酸能及γ-氨基丁酸能等神经突触的生物过程、抑郁的发生过程和多条信号通路（如:丝裂原激活蛋白激酶信号通路、p53信号通路及Wnt信号通路）;其中关键蛋白是NFKBIA、NRXN1和RPL35A。结论 PD患者额叶的基因表达与PD抑郁发生有关。该研究为进一步理解PD抑郁的发病机制提供了理论依据。
论文目录
文章来源
类型: 期刊论文
作者: 吴欣桐,洪培伟
关键词: 帕金森病,额叶,非运动症状,抑郁,生物信息学
来源: 华西医学 2019年10期
年度: 2019
分类: 医药卫生科技,基础科学
专业: 生物学,神经病学,生物医学工程
单位: 四川大学华西医院神经内科,四川大学华西公共卫生学院/华西第四医院老年医学/神经内科
分类号: R742.5;Q811.4
页码: 1117-1125
总页数: 9
文件大小: 2837K
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