蛋白质组学论文_李运洁,黄鑫,邓婕,段东

导读:本文包含了蛋白质组学论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:蛋白质,同位素,蛋白,晚疫病,赤霉病,标记,耳蜗。

蛋白质组学论文文献综述

李运洁,黄鑫,邓婕,段东[1](2019)在《基于iTRAQ技术的碘难治型甲状腺癌与分化型甲状腺癌的比较蛋白质组学研究》一文中研究指出目的寻找碘难治型甲状腺癌和分化型甲状腺癌之间的差异蛋白,探讨碘难治型甲状腺癌发生的机制,探索可能的核素分子治疗靶点。方法收集2018年6月至2019年3月本科收治的碘难治型甲状腺癌和分化型甲状腺癌患者颈部转移淋巴结各3例,利用iTRAQ技术联合质谱分析得到差异蛋白,并通过生物信息学方法对差异蛋白进行GO功能注释、KEGG通路分析,并利用TCGA、TCPA数据库对部分差异蛋白进行验证。结果鉴定得到的差异蛋白共665个,其中显着上调的蛋白327个,显着下调的蛋白338个。ECM1、CHI3L1、LAMA5、14-3-3 eta、CDC42、RAC2、MYL9等差异蛋白广泛参与肿瘤血管生成、侵袭转移及细胞失分化过程。同时,差异蛋白富集于包括代谢通路、黏着斑及其他多条信号通路。结论碘难治型甲状腺癌和分化型甲状腺癌的差异蛋白较多,其主要功能涉及调节转运体活性及酶活性等,参与细胞代谢等多个生物过程。ECM1、CHI3L1及CDC42通过与MAPK通路中部分蛋白相互作用促进肿瘤发展,可能成为核素治疗的潜在靶点。(本文来源于《第叁军医大学学报》期刊2019年24期)

朱天地,李静雯,叶春雷,陈军,王立光[2](2019)在《蛋白质组学及其在啤酒大麦和麦芽研究中的应用综述》一文中研究指出啤酒的酿造和质量直接受到啤酒大麦品质的影响。随着系统生物学和生物信息学的发展,啤酒大麦和麦芽的蛋白质组学正日益成为研究热点。对蛋白质组学及研究方法,及其在啤酒大麦品种鉴定、质量分析、麦芽制造和品质影响研究中的应用进展进行了概述,展望啤酒大麦及麦芽中蛋白质组今后的研究方向进行。(本文来源于《甘肃农业科技》期刊2019年12期)

乔阳,陈群,杨光,曹迎亚,鲁卫华[3](2019)在《基于iTRAQ技术的脓毒症脑病的蛋白质组学研究》一文中研究指出目的:应用同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)技术分析脓毒症大鼠脑皮质组织差异性蛋白的表达。方法:选取雄性Wistar大鼠30只随机分为脓毒症组(n=15)和对照组(n=15)。造模前3 d放置脑电监测电极,采用盲肠结扎穿孔术(CLP)制备大鼠脓毒症模型,造模48 h后处死大鼠,提取脑皮质蛋白,采用iTRAQ技术筛选出两组间差异蛋白,分析表达差异蛋白与脓毒症脑病之间的关系。结果:与对照组比较,脓毒症组大鼠脑组织共筛选出91个出现差异表达的蛋白。其中表达上调者68个,表达下调者23个。与凝血、细胞信号转导、物质运输、免疫反应、细胞物质能量代谢等方面的相关蛋白功能有关。结论:脓毒症大鼠脑组织出现一系列蛋白表达异常,用iTRAQ技术可快速分析。(本文来源于《中国临床药理学与治疗学》期刊2019年11期)

谢遇春,奈日乐,杨峰,马丽娜,米璐[4](2019)在《基于非标记蛋白质组学技术筛选影响察哈尔羊肌肉品质的重要分子标记》一文中研究指出为研究察哈尔羊不同部位肌肉蛋白质组成差异及差异蛋白功能,通过数据信息依赖性获取与SWATH非标记蛋白组学定量技术,对察哈尔羊背最长肌和臀肌进行蛋白质鉴定和定量分析,并对其进行生物信息学分析。结果表明:察哈尔羊背最长肌和臀肌肌肉中共检测到蛋白质1 073个,筛选出差异蛋白140个,其中背最长肌中高表达差异蛋白116个,低表达差异蛋白24个;背最长肌中高表达差异蛋白GO(gene ontology)功能富集分析结果表明,在细胞组分中,富集于细胞外外泌体中的蛋白质最多,其次富集于细胞膜内,在分子功能中,蛋白质主要参与分子内转移酶活性、聚RNA结合和L-乳酸脱氢酶活性过程,在生物学进程中,蛋白质主要参与碳水化合物代谢过程、肌节组织和肌肉收缩过程;通过差异蛋白的网络互作分析发现,肌纤维组成模块包括肌球蛋白-11、肌球蛋白-1(myosin-1,MYH1)、肌间蛋白-1、肌球蛋白-2(myosin-2,MYH2)、肌球蛋白-8(myosin-8,MYH8)、肌球蛋白轻链激酶-2、肌球蛋白轻链-2、肌钙蛋白T-3、视松蛋白和肌球蛋白结合蛋白C等蛋白质,肌球蛋白MYH1、MYH2、MYH8有望成为影响肉品质的重要分子标记。(本文来源于《肉类研究》期刊2019年11期)

王彪,李学峰,陈武英,孔令让[5](2019)在《小麦抗赤霉病基因Fhb7近等基因系蛋白质组学分析》一文中研究指出[研究背景]小麦赤霉病是麦类作物上的毁灭性病害,不仅可以造成粮食严重减产,而且受侵染的籽粒中产生真菌毒素,严重威胁食品安全和生命健康。[材料与方法]本研究利用比较蛋白质组学分析了抗赤霉病基因Fhb7近等基因系(A061-3和A061-4)的抗赤霉病相关蛋白质;[结果与分析]在接种后的四个时间点,从抗病材料A061-3中鉴定出11,070个蛋白质和762个差异表达蛋白质。GO注释的差异表达蛋白质参与了18个生物学过程,KEGG注释发现主要有10个通路与抗病过程密切相关。实时荧光定量分析表明,在抗病初期,选择的8个重要差异表达基因的转录模式与蛋白质表达模式是一致的。赤霉菌侵染诱导产生的病程相关蛋白在小麦对病原菌抗病反应过程中发挥作用;[结论]本研究从整体上描绘了小麦赤霉病抗性蛋白质网络图,为进一步探讨Fhb7赤霉病抗性机制奠定了基础。(本文来源于《科技创新与绿色生产——2019年山东省作物学会学术年会论文集》期刊2019-11-29)

余萍,董超,姚春馨,丁玉梅,周晓罡[6](2019)在《基于Label free定量蛋白质组学技术对马铃薯晚疫病菌氮饥饿条件下分泌蛋白组初步分析》一文中研究指出【目的】探讨氮源是否影响马铃薯晚疫病菌分泌蛋白的致病性。【方法】应用蛋白质组学Label-free技术,对受氮饥饿处理24 h和未处理的马铃薯晚疫病菌分泌蛋白进行鉴定,并对其鉴定蛋白进行生物信息学分析。【结果】共发现61个蛋白质的表达量存在显着差异,其中41个蛋白质表达量上调,20个蛋白质表达量下调。经生物信息学分析表明它们95%定位于细胞核、细胞质、线粒体和分泌型,主要参与碳代谢、氨基酸的生物合成和核糖体代谢,参与的生物过程主要是细胞过程、代谢过程和细胞成分组织或生物起源。【结论】氮源提高致病性蛋白的分泌,影响马铃薯晚疫病菌的致病性。(本文来源于《西南农业学报》期刊2019年10期)

何敬,彭斌,易斌[7](2019)在《年龄相关性听力减退小鼠耳蜗核iTRAQ定量蛋白质组学研究》一文中研究指出目的研究年龄相关性听力减退小鼠耳蜗核蛋白质组学随增龄产生的差异,探讨低级听觉中枢在老年性耳聋发病机理中的作用。方法运用脑干电反应测听(ABR)检测2月龄及12月龄C57BL/6J小鼠的听阈,结合同位素标记的相对与绝对定量(iTRAQ)和Q Exactive质谱及生物信息学等多重技术分析两组之间耳蜗核差异蛋白。结果两组中总共鉴定到5 919个蛋白质,39 269个唯一肽段。符合表达差异倍数大于1.2倍且P<0.05筛选标准的差异表达蛋白质70个。其中上调差异表达蛋白44个,下调差异表达蛋白26个。结论 iTRAQ定量蛋白质组学技术可有效地运用于组织蛋白鉴定和相对与绝对定量;采用该技术获得了年龄相关性听力减退小鼠耳蜗核蛋白质组差异表达图谱;深层次研究这些蛋白的分子机制将有助于阐明老年性耳聋尤其是中枢性老年性耳聋的发病机理及发现潜在的标志物,为老年性耳聋的诊断和治疗提供新的分子靶位。(本文来源于《中国耳鼻咽喉颅底外科杂志》期刊2019年05期)

倪志勇,刘娜,张海燕,郭忠军,刘鹏鹏[8](2019)在《棉花种质资源的抗旱性评价及蛋白质组学研究》一文中研究指出【研究背景】棉花是世界性重要的经济作物。随着全球水资源短缺、土壤盐渍化、频繁的极端天气等威胁,以及粮棉争地矛盾的日益突出,对棉花耐逆能力的要求越来越高。严重的非生物胁迫使棉花正常的生长发育受到抑制,导致棉株减产甚至死亡。干旱对植物造成的损失在所有非生物胁迫中占首位,特别在棉花主产区新疆,干旱仍是限制其产量的主要因素。但由于棉花的抗旱性十分复杂,抗旱机理尚不清楚,这给棉花抗旱育种带来很大困难,目前尚缺乏可以在干旱地大面积推广应用的抗旱品种,因此,研究棉花抗旱机制,发掘抗逆优异基因资源,创制抗逆新材料显得尤为重要和紧迫;【材料与方法】选择37个棉花品种设干旱胁迫和正常灌水2个处理,成熟期考查与抗旱性相关的农艺性状,采用综合抗旱系数与隶属函数相结合的方法,对各品种抗旱性进行分级评价;采用蛋白质组双向电泳技术对干旱胁迫0 h、12 h、24 h、48 h和72 h的抗旱性强的棉花品种"KK1543"叶片,干旱胁迫0 h和24 h的抗旱强的棉花品种"KK1543"和敏旱棉花品种"新陆早26"根进行差异表达蛋白分析;采用遗传学和分子生物学方法对差异表达的蛋白质编码基因GhHSP70-26和GhVHA-A在干旱胁迫应答中的功能进行分析;【结果与分析】根据抗旱性量度值(D值)的聚类结果,将供试棉花品种划分为3个大类,其中1级抗旱型32份,2级3份,3级1份;1级中又分为4个小类,其中强抗2份、抗5份、中抗23份、弱抗2份;在干旱胁迫0 h、12 h、24 h、48 h和72 h的抗旱性强的棉花品种"KK1543"叶片中获得了113个在干旱胁迫下差异表达的蛋白。通过质谱分析鉴定了102个蛋白点,这些蛋白主要参与碳水化合物代谢、光合作用、细胞防御、氨基酸和蛋白质合成、细胞加工、分子伴侣等过程。在干旱胁迫0 h和24 h的抗旱性强的棉花品种"KK1543"和敏旱棉花品种"新陆早26"根中获得了差异表达的蛋白质110个,通过质谱分析鉴定了56个蛋白质,这些蛋白与代谢(46.4%),抗氧化(14.2%),转运和细胞结构(23.2%)相关;在干旱胁迫下,利用VIGS技术沉默Gh HSP70-26或Gh VHA-A的棉花植株与对照植株相比离体叶片水分丧失快、叶片MDA含量和电导率增大,叶绿素含量和总抗氧化物酶活性降低。过表达GhHSP70-26或GhVHA-A的烟草相比野生型存活率高,叶片水分丧失慢,细胞膜受损和受ROS氧化胁迫的伤害程度低;【结论】对37个棉花种质资源进行了综合的抗旱性分级评价,从抗旱性强的棉花品种"KK1543"和敏旱棉花品种"新陆早26"中鉴定了差异表达蛋白,并通过遗传学和分子生物学方法证明GhHSP70和GhVHA-A基因能够提高植物对干旱胁迫的忍耐能力。(本文来源于《2019年中国作物学会学术年会论文摘要集》期刊2019-10-27)

张薇,张秋菊,王玉鹏,谢彪,孙琳[9](2019)在《压缩感知理论在小样本量蛋白质组学变量筛选研究中的应用》一文中研究指出目的探索基于压缩感知理论变量筛选方法在小样本量蛋白质组学研究中应用的效果和特点,为小样本量的蛋白质组学的变量筛选提供更灵敏、可靠的方法。方法模拟实验比较基于CS理论的变量筛选方法与偏最小二乘(PLS)及随机森林(RF)筛选变量的能力,通过灵敏度、特异度及平衡准确度评价其变量筛选效果;利用CS变量筛选方法筛选非小细胞肺癌两亚型组(腺癌和鳞状细胞癌)的差异蛋白。结果模拟实验表明,CS理论的变量筛选方法在样本量较小时具有较好的变量筛选效果,灵敏度、特异度及平衡准确度均较高;利用基于CS理论的变量筛选方法筛选,获得肺腺癌和鳞状细胞癌间差异表达蛋白22种,被证明是肺腺癌和鳞状细胞癌间有差异的蛋白为:Cytokeratin 6A、Cytokeratin 6B、Cytokeratin 6C、PKP1、P63、MCT1。结论基于CS理论的变量筛选方法在样本量特别少时,筛选变量的效果优于PLS和RF,更适用于小样本蛋白质组学数据变量筛选研究。(本文来源于《中国卫生统计》期刊2019年05期)

秦钧[10](2019)在《蛋白质组学与精准医疗》一文中研究指出肿瘤防控的关键在于"早发现、早诊断、早治疗"。然而,临床应用的肿瘤诊断标志物寥寥无几,且存在一定的假阳性和假阴性,并不十分理想。同时,肿瘤的治疗效果存在较大的个体差异,临床急需指导个体化精准医疗的标志物。基因组学、转录组学技术的快速发展,推进了肿瘤发生相(本文来源于《中国生物化学与分子生物学会2019年全国学术会议暨学会成立四十周年论文集》期刊2019-10-24)

蛋白质组学论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

啤酒的酿造和质量直接受到啤酒大麦品质的影响。随着系统生物学和生物信息学的发展,啤酒大麦和麦芽的蛋白质组学正日益成为研究热点。对蛋白质组学及研究方法,及其在啤酒大麦品种鉴定、质量分析、麦芽制造和品质影响研究中的应用进展进行了概述,展望啤酒大麦及麦芽中蛋白质组今后的研究方向进行。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

蛋白质组学论文参考文献

[1].李运洁,黄鑫,邓婕,段东.基于iTRAQ技术的碘难治型甲状腺癌与分化型甲状腺癌的比较蛋白质组学研究[J].第叁军医大学学报.2019

[2].朱天地,李静雯,叶春雷,陈军,王立光.蛋白质组学及其在啤酒大麦和麦芽研究中的应用综述[J].甘肃农业科技.2019

[3].乔阳,陈群,杨光,曹迎亚,鲁卫华.基于iTRAQ技术的脓毒症脑病的蛋白质组学研究[J].中国临床药理学与治疗学.2019

[4].谢遇春,奈日乐,杨峰,马丽娜,米璐.基于非标记蛋白质组学技术筛选影响察哈尔羊肌肉品质的重要分子标记[J].肉类研究.2019

[5].王彪,李学峰,陈武英,孔令让.小麦抗赤霉病基因Fhb7近等基因系蛋白质组学分析[C].科技创新与绿色生产——2019年山东省作物学会学术年会论文集.2019

[6].余萍,董超,姚春馨,丁玉梅,周晓罡.基于Labelfree定量蛋白质组学技术对马铃薯晚疫病菌氮饥饿条件下分泌蛋白组初步分析[J].西南农业学报.2019

[7].何敬,彭斌,易斌.年龄相关性听力减退小鼠耳蜗核iTRAQ定量蛋白质组学研究[J].中国耳鼻咽喉颅底外科杂志.2019

[8].倪志勇,刘娜,张海燕,郭忠军,刘鹏鹏.棉花种质资源的抗旱性评价及蛋白质组学研究[C].2019年中国作物学会学术年会论文摘要集.2019

[9].张薇,张秋菊,王玉鹏,谢彪,孙琳.压缩感知理论在小样本量蛋白质组学变量筛选研究中的应用[J].中国卫生统计.2019

[10].秦钧.蛋白质组学与精准医疗[C].中国生物化学与分子生物学会2019年全国学术会议暨学会成立四十周年论文集.2019

论文知识图

有机染料在小鼠体内成像图稳定转染AQP8过表达及AQP8shRNASiHa...活性蛋白质谱分析技术活性探针分子(...分泌蛋白质组学分析流程图海马齿蛋SDS卫AGE1一3:海水栽培海马齿...系列细胞具有不同的转移能力Fig5....

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