论文摘要
超氧化物歧化酶（superoxide dismutase, SOD）是植物抗氧化系统的关键酶,在植物应对各种环境胁迫的过程中发挥重要的作用。本研究在砂藓（Racomitrium canescens）干旱胁迫转录组数据中发现一个表达量上调的SOD基因,将其命名为RcSOD。通过RT-PCR技术对RcSOD的开放阅读框进行了克隆及相关的生物信息学预测分析。通过实时荧光定量PCR （qPCR）对砂藓复水和脱水过程中RcSOD基因的表达量变化进行了检测分析。结果显示,该基因c DNA全长1 230 bp,开放阅读框长555 bp。RcSOD编码蛋白质的氨基酸数为184,相对分子质量为18.9 kD,理论等电点为5.94,不稳定指数为18.35,总平均亲水性为-0.172,预测该蛋白为疏水性蛋白,属于非跨膜、非分泌型蛋白,含有Cu/Zn SOD结构域。系统进化分析表明,RcSOD与藓类Cu/Zn SOD蛋白属于同一分枝。实时荧光定量PCR结果显示,RcSOD基因在复水和干旱的条件下均有差异性表达,在脱水过程中显著上调,初步推测RcSOD可能参与砂藓干旱胁迫应答反应。本研究对进一步研究砂藓中Cu/Zn SOD基因的生物学功能具有推动作用。
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文章来源
类型: 期刊论文
作者: 沙伟,蒋卓君,张梅娟,马天意
关键词: 砂藓,干旱胁迫,基因克隆,表达分析
来源: 基因组学与应用生物学 2019年05期
年度: 2019
分类: 基础科学,医药卫生科技
专业: 生物学
单位: 齐齐哈尔大学生命与农林学院
基金: 齐齐哈尔大学研究生创新科研项目(YJSCX2016-ZD17),国家自然科学基金项目(31570207)共同资助
分类号: Q943.2
DOI: 10.13417/j.gab.038.002144
页码: 2144-2151
总页数: 8
文件大小: 1941K
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