山羊地方性鼻内肿瘤病毒重庆株基因组序列分析

山羊地方性鼻内肿瘤病毒重庆株基因组序列分析

论文摘要

目的分析山羊地方性鼻内肿瘤病毒(enzootic nasal tumor virus,ENTV)重庆株基因组序列。方法对临床病例进行剖检、病理学观察,提取组织总RNA,进行RT-PCR扩增,对获得的ENTV-2基因组序列进行测定及分析。结果鼻内肿瘤在鼻腔后端与鼻甲筛骨黏膜紧密相连,完全阻塞鼻腔,侵入鼻窦,呈灰红色、乳头状,表面覆盖大量透明黏液。肿瘤细胞以管状和乳头状结构排列。拼接出1条长度为7 243 nt的ENTV-2 CQ株基因组序列,约占ENTV-2基因组长度的96. 2%。该序列与四川ENTV-2的同源性,最高大于97%,与山羊内源性逆转录病毒(caprine endogenous retrovirus,CERV)gag(XM018046415CERV)的同源性高于98%,与陕西ENTV-2的同源性为91%~92%,与英国ENTV-2(AY197548)的同源性为88%。多序列比对显示,CQ株gag基因有2处多核苷酸插入,这一序列特征与XM018046415CERV的gag基因相同。除了AY197548ENTV-2单独构成Ⅱ群外,ENTV-2在羊反转录病毒进化树中构成Ⅰ群;CQ株与四川ENTV-2构成一分支,与陕西ENTV-2构成另一分支。结论该病例为山羊地方性鼻内肿瘤(enzootic nasal tumor,ENT),提示其病原可能是1株古老ENTV-2毒株,有遗传多样性。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 临床病例
  •   1.2 载体
  •   1.3主要试剂
  •   1.4 病理学观察
  •   1.5 引物设计及合成
  •   1.6 总RNA提取
  •   1.7 RT-PCR扩增
  •   1.8 序列测定及分析
  • 2 结果
  •   2.1 病理学观察
  •   2.2 同源性分析
  •   2.3 编码的蛋白质
  •   2.4序列插入/缺失
  •   2.5 系统进化分析
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 沈克飞,唐达,杨柳,徐登峰,许国洋,付利芝,张素辉

    关键词: 地方性鼻内肿瘤,基因组,遗传多样性

    来源: 中国生物制品学杂志 2019年08期

    年度: 2019

    分类: 医药卫生科技,基础科学,农业科技

    专业: 生物学,畜牧与动物医学

    单位: 重庆市畜牧科学院

    基金: 重庆市基础研究与前沿探索项目(cstc2018jcyjAX0764),重庆市现代山地特色高效农业技术体系2018[3]号

    分类号: S852.65

    DOI: 10.13200/j.cnki.cjb.002717

    页码: 853-857+869

    总页数: 6

    文件大小: 547K

    下载量: 50

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