蓖麻APs基因克隆及生物信息学分析

蓖麻APs基因克隆及生物信息学分析

论文摘要

天冬氨酸蛋白酶(aspartic proteases, APs)在植物生长发育中有重要作用。该酶不仅参与植物的有性生殖,其过表达会导致植株矮化并产生对有毒物质的耐受性。本研究以4叶期蓖麻叶片的cDNA为模板扩增获得1 545 bp的APs基因,经分析该基因可编码514个氨基酸,由这514个氨基酸组成的蛋白为稳定的亲水性分泌蛋白,有明显的跨膜结构域,且含多个磷酸化位点;由28.99%的α-螺旋,25.49%的延伸链,6.03%的β-转角和39.49%的无规则卷曲共同构成了该蛋白的二级结构。根据序列同源比对,发现该基因与白杨、巴西橡胶树、木薯和麻疯树高度同源。本研究为蓖麻天冬氨酸蛋白酶生物合成及其功能的研究提供一定的理论与实践依据。

论文目录

  • 1 结果与分析
  •   1.1 总RNA的检测
  •   1.2 基因克隆
  •   1.3 天冬氨酸蛋白酶一级结构和理化性质分析
  •   1.4 氨基酸保守结构域及信号肽分析
  •   1.5 编码氨基酸的跨膜结构分析
  •   1.6 氨基酸亲疏水性预测分析
  •   1.7 磷酸化位点分析
  •   1.8 编码蛋白的二级结构和三级结构预测分析
  •   1.9 同源性分析及进化树分析
  • 2 讨论
  • 3 材料与方法
  •   3.1 实验材料
  •   3.2 蓖麻总RNA的提取及引物的设计
  •   3.3 基因的克隆
  • 作者贡献
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 王双,李跃,李孟建,李国瑞,黄凤兰,陈永胜

    关键词: 蓖麻,天冬氨酸蛋白酶,基因克隆,生物信息学

    来源: 分子植物育种 2019年22期

    年度: 2019

    分类: 农业科技

    专业: 农作物

    单位: 内蒙古民族大学生命科学学院,沈阳农业大学食品学院,内蒙古民族大学内蒙古自治区高校蓖麻产业工程技术研究中心内蒙古自治区蓖麻育种重点实验室内蒙古自治区蓖麻产业协同创新培育中心

    基金: 国家自然科学基金项目(31460353),内蒙古自治区科技创新引导资金项目(KJCX15002),内蒙古民族大学科研项目(MDK2016008,MDK2017034,MDK2017035),草原英才创新团队项目和国家青年科学基金(31401418)共同资助

    分类号: S565.6

    DOI: 10.13271/j.mpb.017.007344

    页码: 7344-7349

    总页数: 6

    文件大小: 1844K

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