中华按蚊miRNAs的全基因组鉴定和分类

论文摘要

小分子RNA(miRNA)是一类小的非编码RNA,在细胞凋亡、分化和先天性免疫等生物学过程中发挥着重要作用。中华按蚊是中国和东南亚国家分布最广的疟疾传播媒介,本研究采用生物信息学方法注释了中华按蚊基因组的小分子RNA,测序和鉴定了7个样本的小分子RNA。这7个样本来自实验室拟除虫菊酯感性品系、3个野外拟除虫菊酯抗性群体和3个野外拟除虫菊酯感性群体。基于基因组序列共鉴定出272个miRNA,总长为24 978 bp,占基因组的0.009%。从这7个样本的测序和注释中,共鉴定出62个已知的miRNA和432个新的miRNA。这些样本间已知miRNA的数量没有明显的差异,说明这些已知的miRNA非常普通的,表达量最高。在实验室和野外样品之间以及除虫菊酯抗性和感性样品之间,新miRNA的数量没有明显的差异。本研究提供了中华按蚊miRNA的信息框架,然而,还需要进一步的研究来揭示这些样品中miRNA种类之间的关系,以及这些miRNA在不同样品中对拟除虫菊酯抗性的调控机制。

论文目录

文章来源

类型: 期刊论文

作者: Sana ASGHAR,陈斌

关键词: 中华按蚊,鉴定,分类,拟除虫菊酯抗性

来源: 寄生虫与医学昆虫学报 2019年02期

年度: 2019

分类: 医药卫生科技,基础科学

专业: 生物学,基础医学

单位: 重庆师范大学昆虫与分子生物学研究所,媒介昆虫重庆市重点实验室,动物生物学重庆市重点实验室

基金: 国家自然科学基金项目(31872262,31672363),国家科技基础性工作专项重点项目(2015FY210300),国际原子能机构CRP项目(18268)

分类号: R384.1

页码: 80-87

总页数: 8

文件大小: 167K

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标签：中华按蚊论文;  鉴定论文;  分类论文;  拟除虫菊酯抗性论文;