论文摘要
分子动力学模拟能够描述蛋白质分子在行使生物学功能过程中涉及的构象变化,已发展成为中物学研究中重要的计算工具.由于生物分子的构象分布存在崎岖的自由能面,在较为复杂的生物体系的模拟中,传统的分子动力学模拟的构象采样能力受到极大限制,模拟的时间尺度与真实的生物学过程之间仍存在差距.增强采样是解决这一问题的有效手段.本文综述了两类增强采样方法即约束型和无约束型增强采样算法的理论基础、最新进展及其在生物分子中的典型应用,同时也简要总结了组合型增强采样算法近些年的发展.
论文目录
文章来源
类型: 期刊论文
作者: 王安辉,张志超,李国辉
关键词: 增强采样,伞形采样,副本交换,多元动力学,加速分子动力学
来源: Chinese Journal of Chemical Physics 2019年03期
年度: 2019
分类: 基础科学
专业: 生物学
单位: 中国科学院大连化学物理研究所分子反应动力学国家重点实验室,大连理工大学化学学院精细化工国家重点实验室
基金: supported by the National Natural Science Foundation of China(No.31700647,No.21625302,and No.21573217)
分类号: Q-0
页码: 277-286
总页数: 10
文件大小: 335K
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