一个含有CMeT新型NR-PKS基因的克隆与鉴定

一个含有CMeT新型NR-PKS基因的克隆与鉴定

论文摘要

地衣中含有种类丰富并具有生物活性的聚酮类化合物,目前对地衣聚酮类化合物的生物合成尚不清楚。本研究通过对皮革肾岛衣地衣型真菌转录组数据的分析,获得一个新的含有甲基转移酶结构域的非还原型聚酮合酶(NR-PKS)基因(NpPKS1),利用RT-PCR技术首次从皮革肾岛衣地衣型真菌中克隆得到该基因全长cDNA,并检测不同培养基对NpPKS1基因表达的影响。结果显示:NpPKS1基因cDNA全长7 857 bp,编码2 618个氨基酸;该蛋白不存在信号肽,在细胞质基质中发挥作用;与含有甲基转移酶结构域的构巢曲霉(Aspergillus nidulans, XP664052)、壳球孢菌(Macrophomina phaseolina, EKG19938)聚为一支;表达分析显示该基因在不同培养基上的表达量差异极其显著,在BMG培养基上的表达量最高,其相对表达量可达39.15。本研究为下一步异源表达皮革肾岛衣地衣型真菌的聚酮合酶、探讨皮革肾岛衣聚酮化合物的生物合成及基因资源的有效利用提供必要的研究材料。

论文目录

  • 1结果与分析
  •   1.1克隆获得NpPKS1基因
  •   1.2 NpPKS1基因的生物信息学分析
  •   1.3 NpPKS1基因在不同培养基条件下的荧光定量分析
  • 2讨论
  • 3材料与方法
  •   3.1试验材料
  •   3.2皮革肾岛衣NpPKS1基因的克隆
  •   3.3用生物信息学方法对NpPKS1基因进行预测
  •   3.4 NpPKS1蛋白序列的分子系统进化分析
  •   3.5不同培养基对NpPKS1基因表达的影响
  • 作者贡献
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 原晓龙,陈中华,李云琴,王毅

    关键词: 皮革肾岛衣地衣型真菌,非还原型聚酮合酶,基因功能鉴定,基因表达

    来源: 分子植物育种 2019年20期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学

    单位: 云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室

    基金: 国家自然科学基金项目(31860177),云南省应用基础研究计划面上项目(2016FB055)和云南省应用基础研究计划青年项目(2016FD100,2017FD169)共同资助

    分类号: Q933

    DOI: 10.13271/j.mpb.017.006661

    页码: 6661-6667

    总页数: 7

    文件大小: 700K

    下载量: 27

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