图核结合神经网络的蛋白质分类方法

图核结合神经网络的蛋白质分类方法

论文摘要

由于蛋白质的多样性及其结构的复杂性,采用传统按照属性简单线性组合的函数方法难以实现正确分类。图核方法则为此提供了一个解决方案,通过图核方式将蛋白质具有的结构信息提取出来,将两图的相似性比较转化为两图各顶点之间匹配度的比较。提出混合矩阵的点边相似核,将图的邻接矩阵看作各顶点样本向量,通过寻找两图最相似的顶点对进行核值计算。此外,还提出将图核与神经网络相结合,利用神经网络良好的分类性能提高分类准确率。实验结果表明,采用该方法比原有方法的分类准确率提高了15%~30%。

论文目录

  • 0 引言
  • 1 混合矩阵点边相似核
  •   1.1 样本降维
  •   1.2 相似度矩阵
  •   1.3 点边相似核
  •   1.4 算法时间复杂度
  • 2 图核与神经网络结合
  • 3 实验结果与分析
  • 4 结语
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 蒋强荣,邱广

    关键词: 神经网络,图核,蛋白质分类

    来源: 软件导刊 2019年02期

    年度: 2019

    分类: 信息科技,基础科学

    专业: 生物学,自动化技术

    单位: 北京工业大学信息学部

    分类号: TP183;Q51

    页码: 20-23

    总页数: 4

    文件大小: 1568K

    下载量: 117

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