区序列论文_王艳艳,郦银芳,张莉,王晓花

导读:本文包含了区序列论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:序列,基因,受体,子区,多样性,叶绿体,梭鱼。

区序列论文文献综述

王艳艳,郦银芳,张莉,王晓花[1](2019)在《儿童STING基因启动子区序列多态性分析》一文中研究指出目的:分析儿童外周血干扰素基因刺激因子(stimulator of interferon genes,STING)启动子-436~+267区域序列变化。方法:采用PCR产物直接测序的方法,对48例儿童的STING基因启动子区进行序列分析,构建重组报告质粒pGL-3/STING(TT)和pGL-3/STING(CC),转染人类胚胎肾(human embryonic kidney,HEK)293T细胞,检测其荧光素酶活性,计算相对活性单位(the relative luciferase activity unit,RLU)。结果:发现STING基因启动子区的1个新的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点(-401)T/C;该位点TT、TC、CC这3种基因型的频率分布分别为45.8%、37.5%、16.7%;经酶切、测序鉴定,成功构建了含有该位点的STING启动子序列(-436~+267)的表达质粒pGL-3/STING(TT)和pGL-3/STING(CC)。与pGL-3/STING(TT)质粒比较,pGL-3/STING(CC)启动子的RLU明显降低。结论:STING基因(-401)T/C是一个新的SNP,该SNP可降低STING基因启动子的活性,进而可能影响基因的转录调控,影响机体对疾病的易感性。(本文来源于《南京医科大学学报(自然科学版)》期刊2019年10期)

胡露露,赵子雅,王瑞宁,王亚琪,刘铮铸[2](2019)在《赤狐EDNRB基因编码区序列分析及启动子预测》一文中研究指出为了研究赤狐内皮素受体B基因(EDNRB)编码蛋白的结构、功能及预测其5′端上游2 000 bp的候选启动子区的核心启动子区与转录因子的结合位点,从NCBI数据库中获得赤狐EDNRB基因的数据,利用生物信息学方法分析其编码区及候选启动子区。结果表明:赤狐EDNRB基因编码氨基酸的总数为443个,编码产物为不稳定的疏水蛋白。二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,存在信号肽和二硫键。该编码蛋白存在于内质网、细胞质膜和线粒体中。该编码蛋白含有7次跨膜G蛋白偶联受体超家族结构域。赤狐与乌苏里貉的亲缘关系最近,与犬关系较近。该基因的5′端上游存在潜在的启动子区域,同时发现存在转录调控元件和转录因子结合位点,不存在CpG岛。通过对赤狐EDNRB基因进行生物信息学分析,能够初步预测其编码区的结构、功能以及该基因的核心启动子区与转录因子结合位点,为其遗传特性及调控机制的研究提供基本信息。(本文来源于《畜牧与兽医》期刊2019年08期)

杨金宏,孔卫青[3](2019)在《基于28S rDNA D2区序列的陕南凹缘菱纹叶蝉分子系统学与遗传多样性研究》一文中研究指出为探讨陕南桑园凹缘菱纹叶蝉(Hishimonus sellatus Uhler)系统关系与遗传多样性,对陕南7个主要蚕桑产区共132头凹缘菱纹叶蝉的 28S rDNA基因D2区序列进行核苷酸多样性和遗传差异分析,同时研究单倍型之间的分子系统关系和网络进化图。结果表明,总群体共存在多态性位点63个,单倍型8个,优势单倍型H_1占单倍型总数的74.2%,遗传分化程度较低。分子方差分析显示:种群内变异占总组分的98.94%,差异不显着,且其基因流系数Nst和种群地理距离之间不存在相关性(R~2=0.019 7),说明各个地理种群之间存在渐渗杂交。(本文来源于《西北农业学报》期刊2019年08期)

程波,杨伟俊,刘欢欢,何江[4](2019)在《基于叶绿体psb A-trnH基因间隔区序列鉴别维吾尔药刺山柑》一文中研究指出目的通过比较分析刺山柑(Capparis spinosa L.)与山柑科或山柑属药用植物的叶绿体psb A-trnH基因间隔区序列,为刺山柑的分子生物学鉴别研究提供参考依据。方法提取植物样品基因组总DNA,扩增叶绿体psb A-trnH基因间隔区序列,运用MEGA7为工具对序列进行多重序列比对,以Kimura 2 parameter(K2P)为模型估算种内种间遗传距离,并以非加权组平均法(UPGMA)构建系统发生树。结果与刺山柑相比,其种间遗传距离在0. 045~0. 474,平均种间遗传距离为0. 238。最小种间遗传距离大于最大种内遗传距离。UPGMA聚类结果显示,各个种内平行样本相聚,刺山柑与8种同科或同属植物被有效区分。结论叶绿体psb A-trnH基因间隔区序列对于刺山柑的鉴别研究具有应用价值。(本文来源于《中国药学杂志》期刊2019年12期)

周伟,高天翔,王俊,宋娜[5](2019)在《基于线粒体DNA控制区高变区序列的黄河东营段淡水梭鱼群体遗传多样性比较研究》一文中研究指出基于mtDNA控制区高变区序列,对采自黄河东营段的梭鱼群体和其他已报道的13个群体进行了遗传学比较分析。结果表明在长度为435bp的控制区序列上,东营垦利群体与其他13个群体均表现出较高的核苷酸多样度,大多数群体单倍型多样度较高;梭鱼群体在分布范围内表现出3个明显的单倍型世系,其中两个单倍型世系呈现同域分布,东营垦利群体表现出与东海和黄渤海群体同的世系分布趋势;3个世系分化发生于更新世中期,更新世冰期-间冰期的交替导致海平面的下降和上升,西北太平洋边缘海隔离和连通,使得梭鱼群体发生隔离分化和二次接触;叁个单倍型类群在地域上的分布频率具有明显差异,不同的地理群体间存在显着的遗传结构,分别对应着日本海组群、中国东海组群(中国东海、黄海和渤海群体)和中国南海组群;中国东海组群中,中国东海和黄海群体遗传差异相对较小,与渤海群体差异较大;东营垦利群体与采自东海和黄渤海的群体间遗传差异较小,与南海群体及日本群体间遗传差异较大。尽管梭鱼具有较强的潜在扩散能力,但是梭鱼群体间的基因交流有限。梭鱼不同组群群体历史动态检验显示梭鱼存在群体扩张事件。研究推测随着中更新世全球气候主导周期转型,中更新世冰期间冰期交替周期增加对梭鱼隔离分化和群体扩张产生了重要影响。(本文来源于《海洋湖沼通报》期刊2019年03期)

劳飞翔,莫实德,邓培雪,黄洁洁,梁林盼[6](2019)在《广西防城港市HIV-1流行株env基因C2V3区序列特征及亚型分析》一文中研究指出目的了解近期防城港市HIV-1流行毒株env基因C2V3区亚型及分布特征,为防城港市防治艾滋病工作提供科学依据。方法于2017年10月~2018年4月在防城港市人民医院收集199例定点随访的接受抗病毒治疗的HIV感染者或艾滋病病人(human immunodeficiency virus/acquired immunodeficiency syndrome,HIV/AIDS)的流行病学调查信息和10 ml外周血。从外周血白细胞中提取前病毒DNA,用巢式聚合酶链反应对获得的HIV-1前病毒DNA env C2V3区基因片段进行扩增,并进行DNA测序,获得的DNA序列信息使用Sequencher 5.1、MEGA 5.0软件进行清理和分析。结果本研究共收集199例HIV/AIDS,其人口学特征主要以年龄18~49岁为主,占53.70%;职业以农民和待业为主,分别占42.59%、45.37%;学历以初中及以下为主,占89.81%;民族以汉族为主,占75.93%;传播途径以异性传播为主,占93.52%。成功扩增HIV-1env C2V3区基因108例,其中CRF01_AE(Circulating Recombinant Forms,CRF)亚型103例,CRF BC亚型3例,B、CRF59_01B亚型各1例。发现8种gp120 V3环顶端四肽,其中以GPGQ为主,占50.00%;其次为GPGR和GPGK,分别占22.22%、12.96%。预测辅助受体为CXCR4(chemo-kine receptor 4) 59例,占54.63%;其次是CCR5辅助受体(chemo-kine receptor 5)30例,占27.78%;CXCR4/CCR5辅助受体19例,占17.59%。结论防城港市主要流行HIV-1 CRF01_AE亚型,其流行毒株亚型存在多态性。防城港市HIV-1型CRF01_AE毒株膜区V3环氨基酸顶端四肽存在较高的多态性,使用CXCR4辅助受体的HIV-1毒株比例高于用CCR5辅助受体的毒株。(本文来源于《医学动物防制》期刊2019年07期)

陈晓玉,李冠敏,孔德明,李玉博[7](2019)在《高斯整数零相关区序列集构造方法的研究》一文中研究指出该文提出两类高斯整数零相关区(ZCZ)序列集的构造方法。方法1以ZCZ序列集为基础,利用插零滤波法构造高斯整数ZCZ序列集,并给出了所构造的高斯整数ZCZ序列集度的计算方法。方法2提出了两种高斯整数正交矩阵的构造方法,进而基于正交矩阵构造最优高斯整数ZCZ序列集。该文所构造的高斯整数ZCZ序列集可以应用于准同步码多分址(QS-CDMA)、正交频分复用(OFDM)和多输入多输出(MIMO)等多种通信系统中,在抑制干扰的同时,提高系统的频谱效率。(本文来源于《电子与信息学报》期刊2019年06期)

燕秀林,郭晶晶,陶海红[8](2019)在《基于零相关区序列集的空时自适应处理地面运动目标检测算法》一文中研究指出在多发单收的合成孔径雷达-地面运动目标检测(SAR-GMTI)雷达系统中,虽然多颗卫星之间不需要数据传送就能在接收卫星上实现地面运动目标检测,但存在由于空间发射互相正交的一组波形而导致SAR成像相干积累的积分旁瓣过高的问题,从而影响对后续的图像域杂波相消性能。因此,文中提出了将空时自适应处理算法用于发射零相关区序列集(ZCZcodes)信号的星载多入单出系统,这样不用考虑积分旁瓣对SAR成像质量和图像域杂波相消性能带来的影响,且计算量较SAR-GMTI算法小,同样不需要数据传送也在接收卫星上实现了地面运动目标检测。仿真结果和性能分析验证了该方法的有效性。(本文来源于《现代雷达》期刊2019年03期)

薛艳洁,潘娜,李明云[9](2019)在《基于线粒体COⅡ基因和D-loop区序列对江西安南光唇鱼(Acrossocheilus)物种鉴定及系统发育位置分析》一文中研究指出以采自江西赣州安南的野生鱼为实验材料,分别设计引物扩增其线粒体DNA COⅡ和D-loop序列并进行序列比对分析,经扩增得到的COⅡ序列全长为691 bp,D-loop序列的全长为937~944 bp,其中COⅡ序列中A、T、G、C的平均占比分别为31. 00%、25. 80%、15. 30%和27. 90%,而D-loop序列的占比则分别为35. 60%、32. 30%、12. 00%和20. 00%,两序列都是A+T含量高于G+C,G的含量在4种碱基中最低。COⅡ序列中仅存在6个碱基位点的转换,D-loop则有多个碱基位点存在转换、颠换、缺失或插入,群体内遗传距离分别为0. 0075、0. 0050。用最大似然法构建的COⅡ和D-loop系统发育树显示赣州安南光唇鱼与半刺光唇鱼(Acrossocheilus hemispinus)亲缘性最近,序列相似性分别为98. 70%、98. 69%,遗传距离最近分别为0. 0130、0. 0260,未达到种间分化的水平(0. 05)。2个序列分析结果一致,结合外部形态特征观察,可以断定赣州安南光唇鱼与半刺光唇鱼为同一种,研究为江西赣州安南光唇鱼的资源利用提供了资料。(本文来源于《生物学杂志》期刊2019年01期)

于传飞,曹兴军,王文波,倪海晴,GUO,Amy,Y[10](2019)在《LC-MS法对抗PD-1信迪利单抗药物分子铰链区序列改构稳定性的研究》一文中研究指出抗体药物目前已成为治疗自身免疫性疾病及肿瘤等多种疾病的重要创新药物。以IgG4为框架开发的抗体药物面临的挑战之一是野生型IgG4的铰链区不稳定,容易发生铰链区Fab臂交换现象。将IgG4分子的铰链区序列-CPSC-(野生型IgG4)改构成-CPPC-(改构型IgG4)是降低铰链区交换和提高IgG4类分子稳定性的有效手段。信迪利单抗(sintilimab)是用于肿瘤免疫治疗的全人源抗PD-1抗体,采用IgG4分子框架并对其铰链区序列进行了改构(S228P)。利用LC-MS检测方法从体外(PBS和人血清)到动物体内(SCID小鼠)对改构后的铰链区稳定性进行了评估。结果表明, LC-MS作为一种简便快速的方法可以有效地检测体外和体内IgG4分子的Fab臂交换反应,经IgG4分子改构后的信迪利单抗结构稳定,避免了Fab臂的交换现象。(本文来源于《药学学报》期刊2019年01期)

区序列论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

为了研究赤狐内皮素受体B基因(EDNRB)编码蛋白的结构、功能及预测其5′端上游2 000 bp的候选启动子区的核心启动子区与转录因子的结合位点,从NCBI数据库中获得赤狐EDNRB基因的数据,利用生物信息学方法分析其编码区及候选启动子区。结果表明:赤狐EDNRB基因编码氨基酸的总数为443个,编码产物为不稳定的疏水蛋白。二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,存在信号肽和二硫键。该编码蛋白存在于内质网、细胞质膜和线粒体中。该编码蛋白含有7次跨膜G蛋白偶联受体超家族结构域。赤狐与乌苏里貉的亲缘关系最近,与犬关系较近。该基因的5′端上游存在潜在的启动子区域,同时发现存在转录调控元件和转录因子结合位点,不存在CpG岛。通过对赤狐EDNRB基因进行生物信息学分析,能够初步预测其编码区的结构、功能以及该基因的核心启动子区与转录因子结合位点,为其遗传特性及调控机制的研究提供基本信息。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

区序列论文参考文献

[1].王艳艳,郦银芳,张莉,王晓花.儿童STING基因启动子区序列多态性分析[J].南京医科大学学报(自然科学版).2019

[2].胡露露,赵子雅,王瑞宁,王亚琪,刘铮铸.赤狐EDNRB基因编码区序列分析及启动子预测[J].畜牧与兽医.2019

[3].杨金宏,孔卫青.基于28SrDNAD2区序列的陕南凹缘菱纹叶蝉分子系统学与遗传多样性研究[J].西北农业学报.2019

[4].程波,杨伟俊,刘欢欢,何江.基于叶绿体psbA-trnH基因间隔区序列鉴别维吾尔药刺山柑[J].中国药学杂志.2019

[5].周伟,高天翔,王俊,宋娜.基于线粒体DNA控制区高变区序列的黄河东营段淡水梭鱼群体遗传多样性比较研究[J].海洋湖沼通报.2019

[6].劳飞翔,莫实德,邓培雪,黄洁洁,梁林盼.广西防城港市HIV-1流行株env基因C2V3区序列特征及亚型分析[J].医学动物防制.2019

[7].陈晓玉,李冠敏,孔德明,李玉博.高斯整数零相关区序列集构造方法的研究[J].电子与信息学报.2019

[8].燕秀林,郭晶晶,陶海红.基于零相关区序列集的空时自适应处理地面运动目标检测算法[J].现代雷达.2019

[9].薛艳洁,潘娜,李明云.基于线粒体COⅡ基因和D-loop区序列对江西安南光唇鱼(Acrossocheilus)物种鉴定及系统发育位置分析[J].生物学杂志.2019

[10].于传飞,曹兴军,王文波,倪海晴,GUO,Amy,Y.LC-MS法对抗PD-1信迪利单抗药物分子铰链区序列改构稳定性的研究[J].药学学报.2019

论文知识图

公园构造纲要图移除非湍流模态前后的能谱,虚线反映...大菱鲆dndmRNA在胚胎发育过程中的分...实验对c-Ski基因启动子区PPARγ结...经典mTOR信号传导通路Figure1.5Class...甲基化(SAH,S-腺苷;SAM,S-腺苷...

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