解脂耶氏酵母赤藓糖还原酶基因的克隆与功能鉴定及利用代谢工程手段提高其合成赤藓糖醇

解脂耶氏酵母赤藓糖还原酶基因的克隆与功能鉴定及利用代谢工程手段提高其合成赤藓糖醇

论文摘要

解脂耶氏酵母(Yarrowia lipolytica)是一种非常规酵母(Nonconventional yeast),是国际上工业生产赤藓糖醇的常用菌之一,也是我国企业生产赤藓糖醇唯一使用的菌株。赤藓糖醇因其不致龋齿性和低热量,被认为是一种优良的蔗糖替代品。合成赤藓糖醇的出发原料为葡萄糖,经过磷酸戊糖途径,生成中间产物D-赤藓糖,赤藓糖还原酶(ER)在辅因子NADPH的辅助作用下,能够催化D-赤藓糖为赤藓糖醇,该酶是赤藓糖醇合成途径中的一种关键酶。然而在产赤藓糖醇的解脂耶氏酵母中,ER基因仍未被克隆鉴定,因此克隆鉴定该基因对于进一步提高解脂耶氏酵母合成赤藓糖醇的性能具有重要的价值。本次研究总共从产赤藓糖醇的解脂耶氏酵母中鉴定了三种赤藓糖还原酶基因,分别是ER10、ER25、ER27,并将它们在大肠杆菌中异源表达。三种赤藓糖还原酶之间的氨基酸同源性小于35%,且都以NADPH作为辅因子。此外表征这三种赤藓糖还原酶的酶学性质,ER25酶催化速率最大,酸性环境对于酶活性更有利。敲除ER10、ER25、ER27基因的菌株依然能够利用葡萄糖合成赤藓糖醇,但其生产率和转化率都显著降低。同时敲除三种ER基因,可使酵母的赤藓糖醇生产率降低61%,转化率降低37%。将这三种ER基因分别在解脂耶氏酵母中过表达,相对于野生型对照酵母在生产率和转化率上分别会有15.6%和31.2%的提高。基于ER基因合成赤藓糖醇的重要性,又构建一个同时过表达ER10、ER25、ER27以及6-磷酸葡萄糖脱氢酶基因(ZWF1)和6-磷酸-葡萄糖酸脱氢酶基因(GND1)的更高效的赤藓糖醇生产菌株。该菌株由葡萄糖合成赤藓糖醇的转化率达到63%(每克葡萄糖可产0.63克赤藓糖醇),比对照组高了23.5%,在已有文献中是最高转化率。

论文目录

  • 摘要
  • abstract
  • 第一章 绪论
  •   1.1 赤藓糖醇
  •     1.1.1 赤藓糖醇的结构与理化特征
  •     1.1.2 赤藓糖醇的功能及应用
  •     1.1.3 赤藓糖醇的合成
  •   1.2 赤藓糖还原酶
  •   1.3 解脂耶氏酵母
  •   1.4 解脂耶氏酵母产赤藓糖醇
  •   1.5 目的意义
  • 第二章 解脂耶氏酵母赤藓糖还原酶的鉴定
  •   2.1 实验材料
  •     2.1.1 菌株与质粒
  •     2.1.2 主要试剂与试剂盒
  •     2.1.3 实验仪器
  •     2.1.4 培养基与试剂的配制
  •     2.1.5 实验引物
  •   2.2 实验方法
  •     2.2.1 从解脂耶氏酵母菌株CGMCC7326 基因组中鉴定醛酮还原酶基因
  •     2.2.2 ER基因的克隆与表达
  •     2.2.3 ER酶动力学参数测定
  •     2.2.4 pH值和金属离子对ER酶活的影响
  •     2.2.5 ER酶的底物特异性
  •   2.3 实验结果
  •     2.3.1 解脂耶氏酵母CGMCC7326 赤藓糖还原酶基因的鉴定
  •     2.3.2 赤藓糖还原酶在大肠杆菌中过表达和纯化
  •     2.3.3 三种赤藓糖还原酶的动力学参数
  •     2.3.4 最适pH值
  •     2.3.5 底物与辅酶特异性
  •     2.3.6 二价金属离子和DTT对 ER酶活性的影响
  •   2.4 本章小结
  • 第三章 ER基因在Y.lipolytica酵母中的敲除与过表达
  •   3.1 实验材料
  •     3.1.1 菌株、质粒与试剂盒
  •     3.1.2 实验仪器
  •     3.1.3 分子克隆工具酶与试剂盒
  •     3.1.4 生化试剂
  •     3.1.5 培养基与溶液
  •   3.2 实验方法及结果
  •     3.2.1 ER基因敲除载体的构建
  •     3.2.2 敲除ER基因的解脂耶氏酵母工程菌株的构建
  •     3.2.3 构建用于过表达酵母中ER基因的质粒
  •     3.2.4 构建过表达ER基因的解脂耶氏酵母CGMCC7326 工程菌株
  •   3.3 本章小结
  • 第四章 工程菌株中ER基因表达的验证
  •   4.1 实验材料
  •     4.1.1 样本
  •     4.1.2 实验主要仪器
  •     4.1.3 实验主要试剂
  •   4.2 实验方法
  •     4.2.1 引物设计
  •     4.2.2 RNA质量检测
  •     4.2.3 逆转录合成cDNA
  •     4.2.4 Real Time PCR样本检测
  •   4.3 实验结果
  •     4.3.1 过表达与敲除ER基因的RNA浓度及纯度结果分析
  •     4.3.2 过表达ER基因的酵母中各样品Real Time PCR检测结果及分析
  •     4.3.3 敲除ER基因的酵母中各样品Real Time PCR检测结果及分析
  •   4.4 本章小结
  • 第五章 赤藓糖还原酶对Y.lipolytica酵母合成赤藓糖醇的影响
  •   5.1 实验材料
  •     5.1.1 主要菌株
  •     5.1.2 实验仪器
  •     5.1.3 生化试剂
  •     5.1.4 发酵液
  •   5.2 实验方法
  •     5.2.1 对敲除和过表达ER基因的菌株进行赤藓糖醇合成测评
  •     5.2.2 赤藓糖醇发酵参数的分析与计算方法
  •   5.3 实验结果
  •     5.3.1 敲除ER基因对赤藓糖醇合成的影响
  •     5.3.2 Y.lipolytica菌株中ER基因的过表达对赤藓糖醇合成的影响
  •   5.4 本章小结
  • 第六章 总结与展望
  •   6.1 实验成果总结
  •   6.2 实验创新点
  •   6.3 实验展望
  • 图录
  • 表录
  • 参考文献
  • 攻读硕士学位期间已公开专利及正在评审的论文
  • 致谢
  • 文章来源

    类型: 硕士论文

    作者: 程慧玲

    导师: 程海荣

    关键词: 解脂耶氏酵母,赤藓糖还原酶,赤藓糖,赤藓糖醇

    来源: 上海交通大学

    年度: 2019

    分类: 基础科学,工程科技Ⅰ辑

    专业: 生物学,轻工业手工业

    单位: 上海交通大学

    分类号: Q78;TS202.3

    DOI: 10.27307/d.cnki.gsjtu.2019.002769

    总页数: 76

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