导读:本文包含了动态性状基因定位论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:性状,多项式,基因,动态,论文,Legendre,似然法。
动态性状基因定位论文文献综述
高会江,孙华,陈学辉,杨润清,徐士忠[1](2006)在《F_2群体动态性状基因定位的极大似然分析》一文中研究指出把表型值随着时间(生命时期、年龄、胎次等)或其他可以量化的因素(生理状态、生产水平、代谢率和环境条件等)变化的性状称为动态性状。受动物遗传育种中用来估计动态性状育种值的随机回归测定日模型思想的启发,将关于时间(测定日期)的Legendre多项式镶嵌在遗传模型的每个遗传效应中,以刻画QTL对动态性状变化过程的作用,从而建立起动态性状基因定位的数学模型。以F2遗传设计群体为例,论述了动态性状基因定位分析的基本原理,推导了QTL效应大小和位置的极大似然法估计过程。选择3次Legendre多项式为子模型,采用MonteCarlo方法模拟F2设计群体,研究抽样群体大小和测定日密度对不同遗传力QTL检测效力的影响。利用正交设计安排因素试验组合,分析模拟试验结果表明:高遗传力的要比低遗传力的QTL在检测时需要较少个体数和测定日抽样;但不论QTL的遗传力多大,300以上的群体大小和5%以上的测定日密度都可以保证足够高的检测效力。(本文来源于《东北林业大学学报》期刊2006年01期)
杨润清,高会江,孙华[2](2004)在《远交群体动态性状基因定位的似然分析 Ⅱ.模拟研究》一文中研究指出以远交设计群体为例 ,在推导出动态性状基因定位的似然法分析过程的基础上 ,选择 3阶Legendre多项式为子模型 ,采用Monte Carlo方法模拟研究了不同个体数、测定日频数、标记密度和QTL遗传贡献率对两种分析方法检测QTL效率的影响。每个因素都取高、中和低 3个水平 ,利用正交设计安排模拟因素试验组合。模拟试验结果表明 :高QTL遗传贡献率要比低QTL遗传贡献率的QTL在检测时需要较少个体数和测定日抽样 ;但不论QTL遗传贡献率多大 ,30 0以上的群体大小和 5 %以上的测定日频数都可以保证足够高的检测效率。个体数和测定日频数对动态性状QTL的分析和检测具有几乎相同的作用 ,而且相同样本含量条件下两者呈现互补的关系。就某个动态点的QTL检测而言 ,模拟试验也同时证明 :提出的这种以整个动态过程为定位目标的动态性状基因定位方法明显优于传统的逐个动态点的定位分析方法(本文来源于《遗传学报》期刊2004年11期)
杨润清,高会江,孙华,Shizhong,Xu[3](2004)在《远交群体动态性状基因定位的似然分析 Ⅰ.理论方法》一文中研究指出受动物遗传育种中用来估计动态性状育种值的随机回归测定日模型思想的启发 ,将关于时间 (测定日期 )的Legendre多项式镶嵌在遗传模型的每个遗传效应中 ,以刻画QTL对动态性状变化过程的作用 ,从而建立起动态性状基因定位的数学模型。利用远交设计群体 ,阐述了动态性状基因定位的似然分析原理 ,推导了定位参数似然估计的EM法两步求解过程。结合动态性状遗传分析的特点和普通数量性状基因定位研究进展 ,还提出了有关动态性状基因定位进一步研究的设想(本文来源于《遗传学报》期刊2004年10期)
孙华[4](2003)在《动态性状基因定位理论框架的初步构建》一文中研究指出把表型值随着时间(生命时期,年龄,胎次等)或其他可以量化的因素(生理状态,生产水平,代谢率和环境条件等)变化的性状称为动态性状。受动物遗传育种中用来估计动态性状育种值的随机回归测定日模型思想的启发,将关于时间(测定日期)的Legendre多项式镶嵌在遗传模型的每个遗传效应中,以刻画QTL对动态性状变化过程的作用,从而建立起动态性状基因定位的数学模型。 以F_2遗传设计群体为例,论述了动态性状基因定位分析的基本原理,推导了QTL效应大小和位置的极大似然法估计过程,采用Monte Carlo方法模拟产生标记基因型和个体表型值,设置抽样群体大小、测定日密度和QTL遗传力叁个因素各叁个水平,研究了抽样群体大小和测定日密度对不同遗传力QTL的检测效力的影响,模拟试验采用正交设计安排因素组合。模拟试验结果表明:个体数和测定日密度对动态性状QTL的分析和检测具有几乎相同的作用,而且在相同样本含量条件下两者呈现互补的关系;高遗传力的要比低遗传力的QTL在检测时需要较少的群体和测定日抽样,但不论QTL的遗传力多大,300以上的群体大小和5%以上的测定日密度都可以保证足够高的检测效力。 同时,在假设误差方差为齐次的情况下,引用回归析法对动态性状进行定位分析以代替似然法。模拟试验结果表明:虽然回归法在各个因素组合条件下对误差方差的估计准确度和精确度都低于似然法,但两种方法对QTL的检测效力差别不大,而且与似然方法相比,回归法表现出明显的计算过程简单、计算速度快等优势。 在QTL定位模型中,嵌入基因效应随过程变化的函数,同以往的单独定位分析和多性状定位分析相比,不仅考虑了动态性状的动态变化规律,而且减少了待估参数,提高了QTL的检测效力和定位的准确度。尤其是用Legendre多项式描述动态性状QTL各种基因效应的作用,既可以发挥多项式在计算上的优势,也确保定位分析模型两端具有相同的几何形状或拟合参数之间的等价性。 鉴于动态性状的广泛性及经济重要性,研究该类性状基因定位分析方法对深入揭示其遗传规律、提高其改良效率具有重要的理论和现实意义。(本文来源于《东北农业大学》期刊2003-06-01)
动态性状基因定位论文开题报告
(1)论文研究背景及目的
此处内容要求:
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例:
以远交设计群体为例 ,在推导出动态性状基因定位的似然法分析过程的基础上 ,选择 3阶Legendre多项式为子模型 ,采用Monte Carlo方法模拟研究了不同个体数、测定日频数、标记密度和QTL遗传贡献率对两种分析方法检测QTL效率的影响。每个因素都取高、中和低 3个水平 ,利用正交设计安排模拟因素试验组合。模拟试验结果表明 :高QTL遗传贡献率要比低QTL遗传贡献率的QTL在检测时需要较少个体数和测定日抽样 ;但不论QTL遗传贡献率多大 ,30 0以上的群体大小和 5 %以上的测定日频数都可以保证足够高的检测效率。个体数和测定日频数对动态性状QTL的分析和检测具有几乎相同的作用 ,而且相同样本含量条件下两者呈现互补的关系。就某个动态点的QTL检测而言 ,模拟试验也同时证明 :提出的这种以整个动态过程为定位目标的动态性状基因定位方法明显优于传统的逐个动态点的定位分析方法
(2)本文研究方法
调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
动态性状基因定位论文参考文献
[1].高会江,孙华,陈学辉,杨润清,徐士忠.F_2群体动态性状基因定位的极大似然分析[J].东北林业大学学报.2006
[2].杨润清,高会江,孙华.远交群体动态性状基因定位的似然分析Ⅱ.模拟研究[J].遗传学报.2004
[3].杨润清,高会江,孙华,Shizhong,Xu.远交群体动态性状基因定位的似然分析Ⅰ.理论方法[J].遗传学报.2004
[4].孙华.动态性状基因定位理论框架的初步构建[D].东北农业大学.2003