兔皮胶原快速明胶化分子机制

兔皮胶原快速明胶化分子机制

论文摘要

通过YASARA软件对酸诱导兔皮胶原蛋白明胶化过程进行动力学模拟,解析兔皮胶原快速明胶化的分子机制。均方根偏差结果表明,酸处理使胶原蛋白分子的非螺旋区亚基组分分离,但对其中单个亚基的构象影响较小。酸处理初期,兔皮胶原三螺旋区的氢键在短时间内被迅速破坏,模拟50ns后,氢键数量保持相对稳定,与实际研究结果一致。三螺旋结构在酸处理初期伴随着氢键的破坏并向其他二级结构转化,随着模拟时间的延长,α-螺旋与β-折叠相对含量之和呈先增加后减少趋势。当α-螺旋和β-折叠相对含量之和达到最大时,明胶化程度最佳。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 模型构建
  •   1.2 模型评价
  •   1.3 单体系动力学模拟
  •   1.4 数据处理与分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 模型构建
  •     2.1.1 非螺旋区模型构建
  •     2.1.2 三螺旋区模型构建
  •   2.2 模型评价
  •   2.3 单体系动力学模拟
  •     2.3.1 非螺旋肽结构的RMSD分析结果
  •     2.3.2 非螺旋肽的二级结构变化分析结果
  •     2.3.3 三螺旋结构的RMSD分析结果
  •     2.3.4 三螺旋结构氢键含量分析结果
  •     2.3.5 三螺旋区的二级结构变化分析结果
  • 3 结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 冯鑫,苏现波,马明思,马良,戴宏杰,余永,郭婷,周鸿媛,张宇昊

    关键词: 胶原,明胶,结构变化,分子模拟,机制

    来源: 食品科学 2019年17期

    年度: 2019

    分类: 工程科技Ⅰ辑

    专业: 轻工业手工业

    单位: 西南大学食品科学学院,邯郸学院生命科学与工程学院

    基金: “十三五”国家重点研发计划重点专项(2016YFD0400200),国家自然科学基金面上项目(31671881),重庆市基础科学与前沿技术研究项目(cstc2015jcyjBX0116,cstc2018jcyjA0939)

    分类号: TS251.92;TS201.7

    页码: 65-71

    总页数: 7

    文件大小: 3778K

    下载量: 153

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