酸菜水中细菌多样性研究

酸菜水中细菌多样性研究

论文摘要

以恩施地区酸菜水为研究对象,使用Miseq高通量测序技术与聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳技术(PCR-DGGE)相结合的手段对样品中的微生物多样性和群落结构进行解析,同时利用纯培养的方法进行乳酸菌的分离鉴定。结果表明:酸菜水中的细菌种类较为丰富,其中隶属于硬壁菌门(Firmicutes)的乳杆菌属(Lactobacillus)为优势属,其相对含量达76.25%。通过PCR-DGGE技术与纯培养方法发现,酸菜水中的优势乳酸菌为植物乳杆菌(Lactobacillus plantarum)。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料与试剂
  •   1.2 仪器与设备
  •   1.3 试验方法
  •     1.3.1 样品总DNA提取与检测
  •     1.3.2 样品细菌16SrRNA PCR扩增及Miseq高通量测序
  •     1.3.3 序列拼接及质量控制
  •     1.3.4 基于PCR-DGGE技术酸菜水中乳酸杆菌多样性解析
  •     1.3.5 酸菜水中乳酸菌的分离与鉴定
  •   1.4 数据处理
  • 2 结果与分析
  •   2.1 序列丰富度和多样性分析
  •   2.2 基于不同分类地位酸菜水样品核心细菌菌群相对含量分析
  •   2.3 酸菜水中乳杆菌DGGE图谱及系统发育分析
  •   2.4 酸菜水中乳酸菌分离鉴定结果
  • 3 结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 折米娜,望诗琪,赵慧君,郭壮,廖华,张振东

    关键词: 酸菜水,高通量测序,微生物多样性

    来源: 中国调味品 2019年01期

    年度: 2019

    分类: 工程科技Ⅰ辑,基础科学

    专业: 生物学,轻工业手工业

    单位: 湖北文理学院食品科学技术学院鄂西北传统发酵食品研究所,恩施市农业局

    基金: 湖北文理学院2018年度学科开放基金项目(XK2018010),湖北文理学院食品新型工业化学科群建设项目(20180202)

    分类号: TS201.3

    页码: 26-31

    总页数: 6

    文件大小: 295K

    下载量: 208

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