7个地理种群小鼠TLR9基因的遗传多样性分析

7个地理种群小鼠TLR9基因的遗传多样性分析

论文摘要

[目的]分析我国7个地理种群小鼠TLR9基因的遗传多样性。[方法]利用PCR技术扩增并测序7个地理种群100个小鼠样品的TLR9基因。使用MEGA 7.0、DnaSP等软件对基因序列进行分析,计算遗传距离、遗传多样性,并构建系统发育树。[结果]获得的TLR9基因片段长度为1 030 bp,位于参与对病原体相关分子模式识别的LRR结构域的编码区,A、T、C、G的平均含量分别为22.9%、22.2%、32.8%和22.0%,各地理种群间碱基含量没有明显差异。通过计算各地理种群间遗传距离及核苷酸多样性发现,这7个地理种群小鼠TLR9基因序列较为保守,并无明显遗传分化。以褐家鼠(NM198131)作为外群构建系统发育树,其结果与遗传多样性分析相一致。[结论]7个地理种群小鼠TLR9基因遗传多样性较低,具有极高的保守性。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 样品采集
  •   1.2 方法
  •     1.2.1 DNA提取。
  •     1.2.2 PCR扩增。
  •     1.2.3 PCR扩增产物检测。
  •   1.3 产物测序及序列分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 目的基因提取及PCR扩增产物检测结果
  •   2.2 小鼠TLR9基因碱基含量分析
  •   2.3 各地理种群间遗传距离分析
  •   2.4 小鼠TLR9基因遗传多样性分析
  •   2.5 系统发育树分析
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 冷冰霜,于立强,黄玲

    关键词: 小鼠,基因,遗传多样性

    来源: 安徽农业科学 2019年10期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学

    单位: 鲁东大学生命科学学院,山东省烟台第三中学

    基金: 国家自然科学基金项目(31371252)

    分类号: Q953

    页码: 89-91

    总页数: 3

    文件大小: 2669K

    下载量: 49

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