成都某部一起感染Yamagata系乙型流感病毒血凝素基因分析

成都某部一起感染Yamagata系乙型流感病毒血凝素基因分析

论文摘要

目的分析成都某部感染乙型流感病毒遗传进化与血凝素(HA)基因突变位点。方法通过犬肾上皮细胞(MDCK细胞)体外分离患者咽拭子标本流感病毒毒株,用PCR获取乙型流感病毒HA基因并测序,与NCBI数据库在线比对并利用MEGA 6.06软件构建系统发育进化树,分析突变位点。结果通过MDCK细胞接种,分离出1株乙型流感病毒株,以感染病例咽拭子核酸及分离毒株的核酸为模板进行PCR扩增得到1 755 bp全长HA基因,获得的序列提交至GenBank数据库,获得基因登录号为MH236281。通过在线比对及系统发育树构建,该病例感染的病毒为Yamagata系乙型流感病毒。与乙型流感病毒Yamagata系的代表毒株Influenza B/Yamagata/16/88(GenBank No. M36105)相比,HA基因点突变碱基为57个;与世界卫生组织(WHO)推荐的疫苗株Influenza B/Utah/08/2014 (Gen Bank No. KU592766)相比,突变碱基数为20个。进一步对HA1氨基酸突变位点进行分析,与四川地区往年流行株相比均发生了不同程度的突变,其中与2010年四川温江的分离株(GenBank No. KP461138)相比突变位点较少,仅有4处点突变;与WHO推荐的疫苗株Influenza B/Utah/08/2014相比,有2个氨基酸位点发生了变异,分别为L176Q和M255V,但突变没有处于HA1上的抗原决定簇区域。其中176位点是一个全新的突变,以往四川流行毒株、Yamagata系的代表毒株Influenza B/Yamagata/16/88及WHO推荐的疫苗株Influenza B/Utah/08/2014的HA1 176位点均为亮氨酸(L),而本研究病例感染的乙型流感毒株HA1 176位点突变为谷氨酰胺(Q)。结论成都地区驻地部队2017—2018流行季感染的乙型流感病毒HA基因已发生一些突变,但突变尚未造成抗原性的改变。

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 刘媛,王文博,何怡蓓,邹自英,朱紫衣,熊杰

关键词: 流感病毒属型,血凝素,突变,系统发育树

来源: 第二军医大学学报 2019年11期

年度: 2019

分类: 医药卫生科技,基础科学

专业: 生物学,基础医学

单位: 西部战区总医院检验科,西部战区疾病预防控制中心,成都中医药大学医学技术学院

基金: 中国博士后科学基金(2018T111157,2017M613427)~~

分类号: R373.13

DOI: 10.16781/j.0258-879x.2019.11.1215

页码: 1215-1222

总页数: 8

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成都某部一起感染Yamagata系乙型流感病毒血凝素基因分析
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