吡咯伯克霍尔德氏菌JK-SH007吲哚-3-乙酰胺IAA合成功能及其依赖途径鉴定

吡咯伯克霍尔德氏菌JK-SH007吲哚-3-乙酰胺IAA合成功能及其依赖途径鉴定

论文摘要

【目的】探索吡咯伯克霍尔德氏菌JK-SH007(Burkholderia pyrrocinia JK-SH007)合成生长素吲哚-3-乙酸(indole-3-acetic acid, IAA)的能力,并阐明B.pyrrocinia JK-SH007存在色氨酸依赖型的吲哚-3-乙酰胺(indole-3-acetamide, IAM)IAA合成途径。【方法】使用Salkowski比色法和酶联免疫吸附法(ELISA)进行L-色氨酸对B.pyrrocinia JK-SH007合成IAA能力影响的检测;以B.pyrrocinia JK-SH007全基因组为模板,设计特异性引物克隆iaaM和iaaH基因,并使用生物信息学方法对其蛋白质和亲缘关系进行分析;通过实时荧光定量PCR方法分析B.pyrrocinia JK-SH007中的iaaM和iaaH基因在L-色氨酸处理下的差异表达。【结果】B.pyrrocinia JK-SH007菌株能够合成15.663μg·mL-1的IAA,在以L-色氨酸为前体的条件下其合成IAA的量显著增加,达到了44.404μg·mL-1。iaaM和iaaH基因均含有一个完整的开放阅读框,其中iaaM基因全长1 782 bp,编码593个氨基酸,属于Aminooxidase super family家族;iaaH基因全长1 368 bp,编码455个氨基酸,属于Amidase super family家族。在L-色氨酸的处理下,B.pyrrocinia JK-SH007中的iaaM和iaaH基因的表达量均显著增加。【结论】B.pyrrocinia JK-SH007具有合成IAA的能力,L-色氨酸对其合成IAA具有显著促进作用,且克隆得到了iaaM和iaaH基因,其在进化上具有一定的保守性,证明B.pyrrocinia JK-SH007中存在吲哚-3-乙酰胺IAA合成途径。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 试验材料
  •   1.2 L-色氨酸处理下B. pyrrocinia JK-SH007的IAA生成
  •   1.3 iaaM和iaaH基因的克隆
  •   1.4 色氨酸2-单加氧酶和吲哚乙酰胺水解酶的生物信息学分析方法
  •   1.5 iaaM和iaaH基因在L-色氨酸处理下的差异表达分析方法
  • 2 结果与分析
  •   2.1 L-色氨酸处理下B. pyrrocinia JK-SH007的IAA生成
  •   2.2 iaaM和iaaH基因的克隆及其编码蛋白质序列
  •   2.3 iaaM和iaaH蛋白结构功能域和结构分析
  •   2.4 iaaM和iaaH蛋白的系统发育分析
  •   2.5 iaaM和iaaH基因在L-色氨酸处理下的差异表达分析
  • 3 讨论
  • 4 结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 刘婉慧,陈飞飞,叶建仁,王朝恩,康熠,付欢欢

    关键词: 吡咯伯克霍尔德氏菌,吲哚乙酸,吲哚乙酰胺途径,色氨酸单加氧酶基因,吲哚乙酰胺水解酶基因

    来源: 林业科学 2019年09期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学

    单位: 南京林业大学南方现代林业协同创新中心南京林业大学林学院

    基金: 江苏省农业自主创新项目[CX(16)1005]

    分类号: Q78

    页码: 121-129

    总页数: 9

    文件大小: 6905K

    下载量: 105

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