基于SLAF-seq技术的甘薯种质资源群体遗传进化分析

论文摘要

基于简化基因组测序技术对122份甘薯种质资源进行分析,开发SNP位点并将其应用于种质资源群体结构和遗传进化分析。结果表明,从122份甘薯种质资源中共获得563.18 Mb读长,不同材料的读长数量在1 419 809～8 392 785范围之间。测序质量值Q30在90.61%～96.82%之间,平均Q30为92.78%。测序获得的GC含量在36.46%～40.33%之间,平均GC含量为38.17%,对照GC含量为40.72%。根据测序结果共开发出高质量的SLAF标签2388759个,平均测序深度为17.45’。其中,多态性的SLAF标签77761个,占SLAF标签总数的3.26%。根据所获得多态性SLAF标签统计SNP位点信息,共计获得129 063个群体SNP位点。遗传进化分析表明122份种质资源可以分为3个大类,分类结果与它们的地理来源无直接关系,聚类结果可为甘薯育种亲本组配和杂种优势利用提供科学依据。

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 李慧峰,黄咏梅,李彦青,滑金锋,吴翠荣,范继征,陈天渊

关键词: 甘薯,种质资源,遗传进化分析

来源: 热带作物学报 2019年12期

年度: 2019

分类: 农业科技

专业: 农作物

单位: 广西农业科学院玉米研究所

基金: 广西农业科学院基本科研业务专项(桂农科2017YM12),国家现代农业产业技术体系广西创新团队建设专项(No.nycytxgxcxtd-11-03),现代农业产业技术体系建设专项(No.CARS-10-C19)

分类号: S531

页码: 2390-2396

总页数: 7

文件大小: 2862K

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