模拟位论文_杨清浩,王祥卫,金燕,张立新

导读:本文包含了模拟位论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:噬菌体,螺旋,多糖,细胞,沙门氏菌,分子,血吸虫。

模拟位论文文献综述

杨清浩,王祥卫,金燕,张立新[1](2005)在《MUC1抗原的表位预测及模拟位的筛选》一文中研究指出目的预测MUC1抗原的B细胞表位,从噬菌体随机多肽文库筛选及鉴定MUC1抗原的模拟位。方法联合运用多种方法对MUC1的二级结构和表面特性,如理化性质、亲水性、可塑性、溶剂可及性及免疫原性等方面进行分析,预测MUC1的抗原表位。利用纯化获得的BC2抗体筛选噬菌体随机7肽库,夹心ELISA分析噬菌体克隆,测定阳性克隆DNA序列,竞争性抑制实验鉴定阳性噬菌体克隆。结果MUC1存在有多个潜在的抗原表位位点,可能的蛋白质抗原表位区域:110,2454,6577,8491,108134,140156,159174,179196,199210,220233,237265,270299,316337,351362,369396,411420,445502。经3轮筛选,获得了30个阳性克隆,DNA序列分析并推导出氨基酸序列:TAPDLRP、SAPDLRP、AAPDSRP及LAPDFRP4个噬菌体展示肽克隆抑制率均在50%以上。结论应用多参数预测MUC1抗原的B细胞表位,为进一步研究MUC1结构和功能、选择表达新型MUC1分子奠定了基础。所得序列TAPDLRP、SAPDLRP、AAPDSRP及LAPDFRP模拟MUC1抗原表位。(本文来源于《重庆医学》期刊2005年05期)

罗海波,郑山根,朱平,富宁[2](2004)在《大肠杆菌脂多糖2630模拟位的研究》一文中研究指出目的 :利用纯化的抗大肠杆菌L2 6 30多抗筛选噬菌体环七肽库 ,以获得可模拟脂多糖 (LPS)表位的短肽克隆。方法 :以亲和层析纯化的抗大肠杆菌L2 6 30多克隆抗体为靶分子 ,筛选噬菌体随机环七肽库 ,用双夹心ELISA和竞争抑制ELISA鉴定阳性噬菌体克隆的抗原性。结果 :对噬菌体环肽库进行 3轮筛选后 ,随机挑选 2 0个克隆 ,经鉴定其中 12个可与抗L2 6 30抗体结合 ,即为阳性克隆 ;其中有 5个阳性噬菌体克隆表现出与抗鼠伤寒沙门氏菌LPS多抗结合的活性 ,提示这 5个噬菌体展示的短肽具有模拟大肠杆菌LPS及鼠伤寒沙门氏菌LPS共同表位的性质。经DNA序列分析显示 ,其中 8个克隆的氨基酸序列具有X DGLL XX或X EDGLL X保守序列 ,其余 4个克隆的序列均不相同。结论 :筛选获得的噬菌体环七肽克隆具有模拟大肠杆菌LPS表位的活性 ,为大肠杆菌L2 6 30多表位模拟短肽。其中 5个阳性噬菌体克隆短肽具有模拟大肠杆菌LPS及鼠伤寒沙门氏菌LPS共同表位的活性(本文来源于《细胞与分子免疫学杂志》期刊2004年06期)

刘北一,朱平,韩强涛,姜世勃,富宁[3](2004)在《HIV-1gp41 C-螺旋模拟位的筛选和鉴定》一文中研究指出目的 :筛选可作为小分子先导化合物的HIV 1gp4 1C螺旋模拟位 ,为开发抗HIV 1早期感染的小分子药物奠定基础。方法 :以源于HIV 1gp4 1N端的肽N36为靶 ,对噬菌体环七肽库进行亲和筛选。利用ELISA鉴定噬菌体阳性克隆并对其进行DNA序列分析。结果 :3轮筛选后随机挑取 2 6个噬菌体克隆 ,ELISA鉴定表明有 16个克隆可与N36结合 ,将其中 10个克隆DNA测序并推导氨基酸序列 ,每一克隆至少含有 2个疏水氨基酸 ,其中 9个克隆均有WW ,7个克隆有WWH保守序列。挑选阳性噬菌体克隆No 8进一步鉴定 ,游离N36肽阻断No 8克隆与固相化N36结合 ,C34肽竞争抑制N36肽与No 8克隆结合 (IC50 为 12 5 μg ml)。 结论 :表达WW保守序列的肽模拟HIV 1gp4 1C螺旋与N螺旋结合 ,该结果为设计针对HIV介导融膜的抑制剂提供技术支持。(本文来源于《中国免疫学杂志》期刊2004年09期)

刘北一,罗海波,朱平,姜世勃,富宁[4](2003)在《HIV-1gp41核心结构模拟位的筛选与鉴定》一文中研究指出目的 :筛选并鉴定HIV 1gp4 1核心表位。方法 :用识别HIV 1gp4 1的构象特异性单克隆抗体NC 1筛选噬菌体12肽库 ,通过夹心ELISA、NC 1特异性阻断实验、竞争抑制实验鉴定阳性噬菌体克隆 ,DNA序列分析阳性克隆。结果 :经 3轮筛选 ,随机挑取 2 4个噬菌体克隆 ,ELISA鉴定表明有 10个克隆可与NC 1结合 ,DNA序列分析并推导氨基酸序列 ,共 5种序列 :HDVHHRWVYLLS、ITVNEWLYTSEQ、HGRSHGMFKPKR、MGPIARPHWHLN、DMYRSPRPKPDT。其中gp4 1N肽和C肽所形成的复合物可特异性阻断表达HDVHHRWVYLLS ,VNEWLYTSEQ和MGPIARPHWHLN的克隆与NC 1的结合。结论 :所得序列HDVHHR WVYLLS ,VNEWLYTSEQ及MGPIARPHWHLN模拟HIV 1gp4 1六螺旋束核心表位。(本文来源于《中国免疫学杂志》期刊2003年07期)

朱国鸿[5](2003)在《骨肉瘤细胞特异结合肽及肿瘤抗原模拟位的研究》一文中研究指出目前,针对骨肉瘤的治疗方法主要采用联合化疗、手术治疗,同时辅助放疗、生物学治疗等,但都存在一定不足之处:如手术治疗仅局限原发肿瘤灶的切除,对于肿瘤转移灶则无能为力,需配合有效的全身治疗;化疗能进行全身治疗,但所用药物的剂量达到杀灭肿瘤细胞的同时,也会对正常细胞和组织产生杀伤作用;此外全身治疗时易产生多药耐药现象。总之,增加抗肿瘤药物对骨肉瘤的特异性,减少对正常组织和细胞的毒副作用,是骨肉瘤治疗中亟待解决的一个课题。导向治疗具有此优点,既增强药物的特异性,提高疗效,同时又减少对正常组织和细胞的损伤,其关键在于具备高效导向性的载体系统。传统的导向治疗是以单克隆抗体为导向载体,自Embleton等首先制备出抗骨肉瘤的单克隆抗体,随后多篇文献报道了抗骨肉瘤的单克隆抗体用于导向治疗的研究,国内纪方等也观察到~(90)Y-标记的抗人成骨肉瘤单克隆抗体对人骨肉瘤裸鼠移植模型具有导向杀伤肿瘤效应。但作为载体,单克隆抗体存在无法克服的缺陷,如其分子较大,在组织中穿透性较差,若为鼠源性单抗则易在体内诱发人抗鼠抗体(HAMA)。而利用特异性结合肿瘤细胞的小分子则能解决这个问题,它分子量小,组织穿透性好,对人体的抗原性弱,不易诱发机体对其产生排斥反应,并能改善所交联药物的传递系统,提高药物导向的特异性,从而实现治疗的针对性和安全性。噬菌体展示技术为筛选开发小分子活性物质提供了的重要的技术支持。本研究以骨肉瘤细胞为靶筛选噬菌体12肽库,以寻求能与骨肉瘤细胞特异结合的小分子短肽,为骨肉瘤的靶向治疗提供有用的信息。本研究还以能与骨肉瘤细胞特异结合的噬菌体克隆为靶筛选噬菌体环7肽库,以期得到骨肉瘤细胞表面位点的模拟序列,对骨肉瘤细胞表面相关抗原的模拟结构进行了初步的探索。本研究包括以下两个方面: 1、骨肉瘤细胞特异结合肽的研究:朱国鸿:介肉瘤细胞特异结合欣及肺病杭原棋拟位的研究 首先以骨肉瘤细胞为靶子,对噬菌体随机12肤库进行筛选,采用差减筛选(subtraetion sereening)的方法,用成骨细胞作为吸附细胞(absorber eell)以除去非特异结合的噬菌体,以期得到可与骨肉瘤细胞特异结合的小分子短肤。经过叁轮筛选后,随机挑选20个噬菌体克隆对其进行鉴定。我们用细胞EUSA和细胞免疫组化两种方法鉴定筛选出的噬菌体克隆。然后将阳性克隆进行测序,推导其氨基酸序列。利用细胞ELIsA的方法鉴定,其中有9个克隆显示可与骨肉瘤细胞有较强的结合。用细胞免疫组化对结合能力最高的NO.14噬菌体克隆再进一步鉴定,结果显示与骨肉瘤细胞有良好的结合特性,而与成骨细胞、HEK293(人胚肾细胞)、THP一1(人单核细胞系)、MCF一7(人乳腺癌细胞)、CNE3(鼻咽癌细胞NPC eell lines)无明显结合。DNA测序结果推导氨基酸序列,结果发现它们之间无明显相似性。据此推测骨肉瘤细胞表面成分相当复杂,具有不同的表位。本研究成功地利用噬菌体表面呈现技术筛选出骨肉瘤细胞特异性结合短肤,为骨肉瘤的靶向治疗的进一步研究奠定基础。2、骨肉瘤细胞表面相关抗原模拟肤的初步筛选: 为获得骨肉瘤细胞表面分子模拟肤,本研究建立了生物素标一记噬菌体体系。我们用与骨肉瘤细胞特异结合的12肤No.14噬菌体克隆为靶分子筛选噬菌体环7肤库,并且利用骨肉瘤细胞裂解液作为配基洗脱,经过叁轮筛选后,挑取20个克隆用生物素一亲和素系统ELISA进行了鉴定。本研究采用特殊的筛选方式,即以噬菌体克隆为靶分子,直接对噬菌体肤库进行亲和性筛选,省略了肤合成或纯化蛋白步骤,更直接地对骨肉瘤细胞表面相关抗原模拟位进行了初步的研究。(本文来源于《中国人民解放军第一军医大学》期刊2003-05-01)

郑山根,朱平,刘北一,富宁[6](2003)在《鼠伤寒脂多糖表位模拟位的筛选》一文中研究指出目的获得模拟脂多糖抗原表位的噬菌体环状展示肽。方法用抗鼠伤寒菌脂多糖单克隆抗体2F4为靶分子,亲和筛选噬菌体随机环七肽库,双夹心ELISA及特异性抗原抑制试验鉴定阳性克隆。结果经叁轮筛选,随机挑选38个克隆,其中34个克隆显示与2F4结合。鼠伤寒沙门氏菌脂多糖可抑制噬菌体克隆与2F4结合,所有克隆的半数抑制浓度为(0.125~0.250)μg/ml。挑选10个克隆测序并推导氨基酸序列,其中7个克隆出现P-X-WAS-X-W保守序列;10个序列中非极性氨基酸含量平均值为71.4%。结论噬菌体展示环七肽可模拟鼠伤寒沙门氏菌脂多糖抗原表位。(本文来源于《第一军医大学学报》期刊2003年02期)

罗海波,胡远东,李松,富宁[7](2002)在《TNFα模拟位序列与其结合序列的计算机分子模拟》一文中研究指出军事医学科学院六所七室基于以模拟TNFα单表位噬菌体克隆筛选出的TNFα结合肽序列,利用计算机辅助分子模拟技术对十二肽TNFα结合肽克隆LLT-118(EHMALTYPFRPP)与LCS-7(c-RRPAQSG-c)以及TNFα分子间相互结合作用进行分子模拟分析。(本文来源于《中国免疫学会第四届学术大会会议议程及论文摘要集》期刊2002-12-01)

甘燕[8](2002)在《抗曼氏血吸虫模拟位肽分子疫苗的合成及特征》一文中研究指出合成肽疫苗是抗血吸虫病疫苗研究的一个重要领域,代表保护性抗原如Sm23,Sm28表面B细胞线性表位的肽分子容易制备,但因为构像性表位是由肽链折迭而相互靠拢的氨基酸分子组成。代表构像性表位的肽分子的鉴别和合成并非易事,用特异性单克隆抗体筛选组合肽库所获得的抗原表位的模拟物,即模拟位肽成功地解决了这一问题。本(本文来源于《国外医学(寄生虫病分册)》期刊2002年03期)

杨乔欣,马文煜,余颖[9](2002)在《单纯疱疹病毒糖蛋白模拟位的研究》一文中研究指出目的为了充分认识单纯疱疹病毒(HSV)糖蛋白的抗原表位,寻找HSV多组分疫苗和新型基因工程疫苗更有效的小片段短肽作为该病毒疫苗的备选免疫原。方法利用有动物保护活性的抗HSV糖蛋白C(gC)单克隆抗体(McAb)1A12淘筛噬菌体随机12肽库,经4轮筛选后进行ELISA检测,随机挑取14个阳性克隆进行序列测定,序列比较后得到保守序列,做ELISA阻断实验进一步鉴定筛选结果并与相关天然蛋白HSV gC进行序列比较。结果获得保守序列-SG(L)RHII-和其侧翼辅助序列-AK-、-VW-,其与天然相关蛋白HSV gC 114~116位氨基酸十分相似。携有此短肽的噬菌体可以与McAb特异结合,并可部分阻断抗体与HSV囊膜抗原的反应。结论所筛选到的保守序列可模拟McAb针对的抗原表位,可能是HSV的替代抗原。这一研究方法有望使短肽替代庞大的糖蛋白全长氨基酸序列,为研制更有效及更广谱的基因工程疫苗提供依据,也使研制基于抗原表位水平的特异诊断试剂成为可能。(本文来源于《免疫学杂志》期刊2002年02期)

模拟位论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

目的 :利用纯化的抗大肠杆菌L2 6 30多抗筛选噬菌体环七肽库 ,以获得可模拟脂多糖 (LPS)表位的短肽克隆。方法 :以亲和层析纯化的抗大肠杆菌L2 6 30多克隆抗体为靶分子 ,筛选噬菌体随机环七肽库 ,用双夹心ELISA和竞争抑制ELISA鉴定阳性噬菌体克隆的抗原性。结果 :对噬菌体环肽库进行 3轮筛选后 ,随机挑选 2 0个克隆 ,经鉴定其中 12个可与抗L2 6 30抗体结合 ,即为阳性克隆 ;其中有 5个阳性噬菌体克隆表现出与抗鼠伤寒沙门氏菌LPS多抗结合的活性 ,提示这 5个噬菌体展示的短肽具有模拟大肠杆菌LPS及鼠伤寒沙门氏菌LPS共同表位的性质。经DNA序列分析显示 ,其中 8个克隆的氨基酸序列具有X DGLL XX或X EDGLL X保守序列 ,其余 4个克隆的序列均不相同。结论 :筛选获得的噬菌体环七肽克隆具有模拟大肠杆菌LPS表位的活性 ,为大肠杆菌L2 6 30多表位模拟短肽。其中 5个阳性噬菌体克隆短肽具有模拟大肠杆菌LPS及鼠伤寒沙门氏菌LPS共同表位的活性

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

模拟位论文参考文献

[1].杨清浩,王祥卫,金燕,张立新.MUC1抗原的表位预测及模拟位的筛选[J].重庆医学.2005

[2].罗海波,郑山根,朱平,富宁.大肠杆菌脂多糖2630模拟位的研究[J].细胞与分子免疫学杂志.2004

[3].刘北一,朱平,韩强涛,姜世勃,富宁.HIV-1gp41C-螺旋模拟位的筛选和鉴定[J].中国免疫学杂志.2004

[4].刘北一,罗海波,朱平,姜世勃,富宁.HIV-1gp41核心结构模拟位的筛选与鉴定[J].中国免疫学杂志.2003

[5].朱国鸿.骨肉瘤细胞特异结合肽及肿瘤抗原模拟位的研究[D].中国人民解放军第一军医大学.2003

[6].郑山根,朱平,刘北一,富宁.鼠伤寒脂多糖表位模拟位的筛选[J].第一军医大学学报.2003

[7].罗海波,胡远东,李松,富宁.TNFα模拟位序列与其结合序列的计算机分子模拟[C].中国免疫学会第四届学术大会会议议程及论文摘要集.2002

[8].甘燕.抗曼氏血吸虫模拟位肽分子疫苗的合成及特征[J].国外医学(寄生虫病分册).2002

[9].杨乔欣,马文煜,余颖.单纯疱疹病毒糖蛋白模拟位的研究[J].免疫学杂志.2002

论文知识图

初始剖面示意图失调和增益误差(3)微分非线性(DNL)...电源模块电路油温采集电路软件开发环境整车实验数据采集系统

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