中华鳖dct基因克隆及表达分析

论文摘要

为了阐明中华鳖酪氨酸酶家族成员dct基因的结构与表达特征,根据Ensembl数据库的中华鳖dct基因序列设计引物,运用RT-PCR技术进行开放阅读框（opening reading frame,ORF）克隆,并进行生物信息学分析,进而采用实时荧光定量PCR （quantitative real-time PCR,q-PCR）技术检测正常体色和黄色中华鳖肺、肾脏、裙边和肌肉组织的mRNA表达水平.结果显示中华鳖dct基因ORF区全长1 578 bp,编码525个氨基酸,2种体色鳖dct基因序列完全一致;氨基酸序列分析得C末端无L-亮氨酸基序;N末端含有1个信号肽结构域;预测蛋白（成熟肽）分子质量为56.449 ku,理论等电点为6.67,不稳定指数为38.71,表明DCT蛋白是酸性稳定蛋白;预测DCT蛋白为亲水性蛋白;含有跨膜结构域、类表皮生长因子结构域、层粘连蛋白型类表皮生长因子结构域和2个铜离子结合结构域.系统发育树分析显示,在dct基因进化过程中,中华鳖与绿海龟和锦龟的亲缘关系较近.q-PCR结果表明:dct基因在同一个体各组织中均有表达,肺组织中相对表达量最高,且极显著高于其他3种组织;黄色中华鳖肺、肾脏和裙边组织dct表达水平与正常体色鳖的相应组织均存在显著性差异.结果表明,中华鳖体色变异与dct基因突变无关,但dct基因表达改变可能对体色变异起了一定的作用.

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 刘文婷,许鹏,张娜,管越强,张耀红

关键词: 中华鳖,基因,克隆,生物信息学

来源: 河北大学学报(自然科学版) 2019年06期

年度: 2019

分类: 基础科学,农业科技

专业: 水产和渔业

单位: 河北大学生命科学学院,河北省药品检验研究院,保定水产技术推广站

基金: 河北省自然科学基金资助项目(C2016201207),河北省现代农业产业技术体系淡水养殖创新团队(HBCT2018180203)

分类号: S917.4

页码: 619-628

总页数: 10

文件大小: 3422K

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