导读:本文包含了序列结合蛋白论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:叉头框蛋白J1,特异AT序列结合蛋白1,癌旁组织,浸润深度
序列结合蛋白论文文献综述
赵杰[1]（2019）在《胃癌组织叉头框蛋白J1和特异AT序列结合蛋白1表达水平及临床意义》一文中研究指出目的分析胃癌组织叉头框蛋白J1(FOXJ1)、特异AT序列结合蛋白1(SATB1)表达水平及临床意义。方法选取平顶山市第一人民医院2016年1月至2017年12月胃癌患者49例,利用免疫组化SP法检测胃癌组织、癌旁组织(距离癌组织边缘>5 cm)中FOXJ1、SATB1表达,分析两者在胃癌组织中的表达与胃癌病理参数相关性。结果 FOXJ1、SATB1均表达于胃癌组织,前者在胃癌组织中主要定位于细胞质,在癌旁组织中主要定位于细胞核,胃癌组织FOXJ1阳性表达率(46.94%)低于癌旁组织(93.88%),差异有统计学意义(P<0.05);胃癌组织SATB1阳性表达率(65.31%)高于癌旁组织(0.00%),差异有统计学意义(P<0.05)。FOXJ1、SATB1表达与TNM分期、浸润深度、淋巴结转移相关(均P<0.05)。结论胃癌组织中FOXJ1表达减弱,SATB1呈高表达,且其表达水平与TNM分期、浸润深度、淋巴结转移相关,对临床诊治有重要指导意义。(本文来源于《河南医学研究》期刊2019年14期）
韩智锋[2]（2019）在《特异AT序列结合蛋白1、E-钙黏蛋白表达水平与乳腺癌患者组织学分级的相关性分析》一文中研究指出目的分析特异AT序列结合蛋白1(SATB1)、E-钙黏蛋白(E-cad)表达水平与乳腺癌患者组织学分级的相关性分析。方法选取2016年3月至2018年4月在郑州美康盛德医学检验所进行检测的119例乳腺癌患者,均接受SATB1、E-cad表达水平检测,分析E-cad、SATB1表达水平与乳腺癌患者临床病理特征的相关性。结果 E-cad表达水平与乳腺癌患者是否绝经、年龄无关(均P>0.05),与乳腺癌患者组织学分级、TNM分期、有无淋巴结转移、肿瘤个数有关(均P<0.05);SATB1表达水平与乳腺癌患者年龄无关(P>0.05),与乳腺癌患者是否绝经、组织学分级、TNM分期、有无淋巴结转移、肿瘤个数有关(均P<0.05)。结论 E-cad表达水平与乳腺癌患者组织学分级、TNM分期、有无淋巴结转移、肿瘤个数有关,SATB1表达水平与乳腺癌患者是否绝经、组织学分级、TNM分期、有无淋巴结转移、肿瘤个数有关,两者联合检测能为乳腺癌患者靶向治疗提供可靠依据。(本文来源于《河南医学研究》期刊2019年11期）
张丽娜[3]（2019）在《特殊富含AT序列结合蛋白1在胃癌组织中的表达及对胃癌细胞生物学行为的影响》一文中研究指出目的:特殊富含AT序列结合蛋白1(special AT rich sequence binding protein1,SATB1)可在肿瘤细胞中高表达,并可促进肿瘤细胞增殖与转移,是肿瘤潜在的治疗靶点。本研究旨在探讨SATB1在胃癌组织中的表达及其对胃癌细胞生物学行为的影响,以期为胃癌的治疗提供参考。方法:1、免疫组化法检测30例胃癌组织、淋巴结组织及癌旁组织中SATB1的表达。2、RT-PCR及Western blot检测胃癌细胞株MGC-803、HGC-27和正常胃黏膜永生化细胞GES-1中SATB1的m RNA和蛋白的含量。3、将真核表达质粒pc DNA3.1(+)-His-SATB1(His-SATB1)、载体质粒pc DNA3.1(His-N)、沉默质粒p PLK+Puro-SATB1 sh RNA(sh-SATB1)、沉默载体质粒p PLK+Puro(sh-N)通过Lip2000试剂转染入MGC-803细胞。4、Western blot分析在MGC-803细胞中转染真核表达质粒pc DNA3.1(+)-His-SATB1(His-SATB1)、载体质粒pc DNA3.1(His-N)、沉默质粒p PLK+Puro-SATB1 sh RNA(sh-SATB1)、沉默载体质粒p PLK+Puro(sh-N)24h后MGC-803细胞中SATB1的表达及生物学行为相关蛋白的表达。5、CCK8法检测在MGC-803细胞中转染真核表达质粒pc DNA3.1(+)-His-SATB1(His-SATB1)、载体质粒pc DNA3.1(His-N)、沉默质粒p PLK+Puro-SATB1 sh RNA(sh-SATB1)、沉默载体质粒p PLK+Puro(sh-N)24h后MGC-803细胞增殖活力。6、细胞克隆形成实验检测转染真核表达质粒pc DNA3.1(+)-His-SATB1(His-SATB1)、载体质粒pc DNA3.1(His-N)、沉默质粒p PLK+Puro-SATB1 sh RNA(sh-SATB1)、沉默载体质粒p PLK+Puro(sh-N)24h后MGC-803细胞克隆形成能力。7、流式细胞仪检测转染真核表达质粒pc DNA3.1(+)-His-SATB1(His-SATB1)、载体质粒pc DNA3.1(His-N)、沉默质粒p PLK+Puro-SATB1 sh RNA(sh-SATB1)、沉默载体质粒p PLK+Puro(sh-N)24h后SATB1对MGC-803细胞周期及凋亡的影响。8、划痕实验及Transwell实验检测转染真核表达质粒pc DNA3.1(+)-His-SATB1(His-SATB1)、载体质粒pc DNA3.1(His-N)、沉默质粒p PLK+Puro-SATB1 sh RNA(sh-SATB1)、沉默载体质粒p PLK+Puro(sh-N)24h后MGC-803细胞的迁移能力。9、数据分析采用SPSS17.0软件,计量资料以x±s表示,多组间的比较采用方差分析,两两间比较采用t检验,两个率的比较通过卡方检验,对于频率值<5的样本,通过Fisher精确检验进行修正。P<0.05被认为有统计学意义。结果1、SATB1在胃癌组织及胃癌细胞中高表达。与癌旁组织相比,SATB1在胃癌组织及转移淋巴结组织中高表达(p<0.05);与正常胃黏膜上皮细胞GES-1相比,SATB1的m RNA及蛋白水平在胃癌细胞MGC-803及HGC-27中高表达(p<0.05)。2、与sh-N组相比,sh-SATB1组MGC-803细胞中SATB1的蛋白表达显着降低,与His-N组相比,His-SATB1组MGC-803细胞中SATB1蛋白表达水平显着升高(p<0.05)。3、与sh-N组相比,sh-SATB1组MGC-803细胞增殖活力、克隆形成能力显着降低,细胞增殖相关蛋白AKT、p AKT表达水平降低;与His-N组相比,His-SATB1组MGC-803细胞增殖活力、克隆形成能力显着升高,细胞增殖相关蛋白AKT、p AKT表达水平升高(p<0.05)。4、与sh-N组相比,sh-SATB1组MGC-803细胞周期阻滞在G0/G1期,周期相关蛋白cyclin D1、CDK4表达水平降低,而细胞周期蛋白依靠性激酶抑制剂p21表达水平升高;与His-N组相比,His-SATB1组MGC-803细胞向增殖活跃的G2期转化,周期相关蛋白cyclin D1、CDK4表达水平升高,而细胞周期蛋白依靠性激酶抑制剂p21表达水平降低(p<0.05)。5、与sh-N组相比,sh-SATB1组MGC-803细胞凋亡增多,抑凋亡分子bcl-2表达水平降低;与His-N组相比,His-SATB1组MGC-803细胞凋亡减少,抑凋亡分子bcl-2表达水平升高(p<0.05),而无论sh-SATB1组还是His-SATB1组促凋亡分子bax并没有明显变化。6、与sh-N组相比,sh-SATB1组MGC-803细胞迁移能力显着降低,迁移相关蛋白β-catenin、MMP2、MMP9表达水平降低;与His-N组相比,His-SATB1组MGC-803细胞迁移能力显着升高,迁移相关蛋白β-catenin、MMP2、MMP9表达水平升高(p<0.05)。结论1、SATB1在胃癌组织及细胞中高表达。2、SATB1可促进胃癌细胞的增殖、周期进程并抑制凋亡,该现象的发生可能是通过激活PI3K/AKT信号通路及调控AKT、p21、bcl-2蛋白的表达引起。3、SATB1可促进胃癌细胞的迁移,该现象的发生可能是通过激活Wnt/β-catenin信号通路引起。(本文来源于《山西医科大学》期刊2019-06-06）
张丽娜,许昕瑜,郭松佳,任云青[4]（2019）在《特殊富含AT序列结合蛋白1在胃癌组织中的表达及其对胃癌细胞增殖的影响》一文中研究指出目的:研究特殊富含AT序列结合蛋白1(SATB1)在胃癌组织中的表达及其对胃癌细胞增殖的影响。方法:免疫组化法检测30例胃癌组织、淋巴结组织及癌旁组织中SATB1的表达; RT-PCR及Western blot检测胃癌细胞株MGC-803和正常胃黏膜永生化细胞GES-1中SATB1的mRNA和蛋白的含量;电转染技术将真核表达质粒pc DNA3. 1-His-SATB1(HisSATB1)、载体质粒pc DNA3. 1(His-N)、沉默质粒p PLK+Puro-SATB1 shRNA(sh-SATB1)、沉默载体质粒p PLK+Puro(sh-N)转染入MGC-803细胞,24 h后Western blot检测各组细胞中SATB1、AKT、p-AKT的表达; CCK8检测细胞增殖活性。结果:SATB1在胃癌组织、转移淋巴结组织及MGC-803细胞中的表达水平显着升高(P<0. 05)。sh-SATB1组MGC-803细胞中SATB1的蛋白表达显着降低,细胞增殖活性、AKT、p-AKT蛋白表达均显着降低(P<0. 05); His-SATB1组MGC-803细胞中SATB1蛋白表达水平显着升高,细胞增殖活性增强,AKT、p-AKT蛋白表达均显着升高(P<0. 05)。结论:SATB1在胃癌组织及细胞中高表达,SATB1可促进胃癌细胞的增殖,该效应可能是通过调控AKT合成及激活PI3K/AKT信号通路实现的。(本文来源于《中国免疫学杂志》期刊2019年09期）
贾婷婷,颜世果[5]（2019）在《特异性AT序列结合蛋白2在颌面部发育及牙周组织再生中作用的研究进展》一文中研究指出特异性AT序列结合蛋白(SATB)2是一种组织特异性表达的核基质序列结合蛋白。SATB2被鉴定为骨骼塑型和成骨细胞分化的分子决定因素,在颌面部发育中发挥关键作用,是有效的促进牙周再生的调控因子。本文就SATB2对颌面部发育的调控及其在牙周组织工程领域应用的研究现状进行综述。(本文来源于《国际口腔医学杂志》期刊2019年03期）
张方梅,刘杨,李祥瑞,张云慧,程登发[6]（2019）在《马铃薯甲虫气味结合蛋白的序列和基因表达谱分析》一文中研究指出【目的】昆虫气味结合蛋白(OBPs)在昆虫嗅觉行为中发挥着重要作用。马铃薯甲虫Leptinotarsa decemlineata是马铃薯上一种最主要的毁灭性害虫。为阐明该虫嗅觉识别分子机制,本研究对马铃薯甲虫26个OBP基因序列特征及组织表达谱进行研究。【方法】基于马铃薯甲虫触角转录组测序数据,利用生物信息学方法及qRT-PCR技术,分别对马铃薯甲虫26个LdecOBPs (LdecOBP1-LdecOBP26)的系统进化及基因的组织表达谱进行分析。【结果】除LdecOBP26基因外,其余25个LdecOBPs基因序列均具有完整的开放阅读框,编码120～255个氨基酸残基,预测的蛋白分子量为13.66～29.38 kD,等电点为4.12～8.42,它们属于两个亚家族,其中13个为Classical-C OBPs, 12个为Minus-C OBPs。除LdecOBP3和LdecOBP26外,其他24个LdecOBPs的N端均由16～23个氨基酸组成的信号肽序列。不同的OBPs亚家族均具有各自典型保守的Cys残基。LdecOBPs之间高度分化,氨基酸序列一致性在3.20%～41.91%。系统进化树分析表明,LdecOBPs与沙葱萤叶甲Galeruca daurica的GdauOBPs亲缘关系最近。基因表达谱分析显示,26个LdecOBPs基因在马铃薯甲虫的不同组织中表达,其中有12个LdecOBPs基因(LdecOBP2,LdecOBP4,LdecOBP6,LdecOBP9,LdecOBP10,LdecOBP12,LdecOBP13,LdecOBP16,LdecOBP20-22和LdecOBP24)在触角中高表达,2个LdecOBPs基因(LdecOBP5和LdecOBP17)在足中高表达,其他12个LdecOBPs基因(LdecOBP1,LdecOBP3,LdecOBP7,LdecOBP8,LdecOBP11,LdecOBP14,LdecOBP15,LdecOBP18,LdecOBP19,LdecOBP23,LdecOBP25和LdecOBP26)在触角、头(去除触角)、胸、腹、足和翅这些组织中均表达。【结论】本研究结果为进一步研究马铃薯甲虫嗅觉识别分子机制奠定了基础。(本文来源于《昆虫学报》期刊2019年04期）
李显莉,孟凡峰[7]（2019）在《子痫前期产妇胎盘组织中生长阻滞特异性蛋白6、富集AT序列的特异性结合蛋白1的含量及其与氧化应激、炎性反应的相关性》一文中研究指出目的探讨子痫前期产妇胎盘组织中生长阻滞特异性蛋白6 (Gas6)、富集AT序列的特异性结合蛋白1(SATB1)的含量及其与氧化应激、炎性反应的相关性,为临床诊治提供参考依据。方法收集2014年7月-2017年2月在武功县人民医院进行分娩的子痫前期产妇90例作为子痫前期组,同期在武功县人民医院进行分娩的健康产妇50例作为正常对照组。留取两组产妇的胎盘标本组织,采用Western-blot法检测其中Gas6、SATB1 mRNA的表达量;采用酶联免疫吸附法(ELISA)检测胎盘标本组织碾磨液中氧化应激、炎性反应指标的含量。结果子痫前期组产妇胎盘组织标本中Gas6 mRNA表达量高于正常对照组产妇,SATB1 mRNA表达量低于正常对照组产妇,差异有统计学意义(均P<0. 05);子痫前期组产妇胎盘组织碾磨液中氧化指标脂质过氧化氢(LHP)、活性氧(ROS)的含量高于正常对照组产妇,抗氧化指标谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)、过氧化氢酶(CAT)的含量低于正常对照组产妇,差异有统计学意义(均P<0. 05);子痫前期组产妇胎盘组织碾磨液中炎症指标高迁移率族蛋白(HMGB1)、C反应蛋白(CRP)、白介素-6 (IL-6)的含量高于正常对照组产妇,差异有统计学意义(均P<0. 05)。结论子痫前期产妇胎盘组织中Gas6、SATB1 mRNA表达量存在异常,可客观反映机体氧化应激、炎性反应程度。(本文来源于《中国妇幼保健》期刊2019年01期）
葛宇,董相书,吴斌,程志号,孙长君[8]（2018）在《油梨果肉捕光叶绿素a/b结合蛋白基因PaCAB1的克隆、序列分析及表达》一文中研究指出以油梨品系"RN-5"为试验材料,克隆出叶绿素a/b结合蛋白同源基因,命名为PaCAB1,其开放阅读框为777bp,编码259个氨基酸。氨基酸序列比较分析表明,PaCAB1独自聚类成为一组,与其他21种物种CAB同源性相对较低。实时荧光定量PCR检测表明,在油梨果肉发育过程中,PaCAB1的表达量逐渐地缓慢降低,到S-III时期降到最低点,其变化趋势与叶绿素a、叶绿素b和叶绿素a+b的含量变化趋势一致。(本文来源于《中国南方果树》期刊2018年05期）
张寿明,唐欢宇,吴宗福[9]（2018）在《利用MS2识别序列标签纯化技术富集猪链球菌小RNA结合蛋白》一文中研究指出为建立理想的猪链球菌RNA结合蛋白筛选方法,以该菌小RNA rss04和rss06为研究对象,通过纯化MS2序列识别蛋白MS2-MBP,构建表达MS2融合RNA(MS2-rss04与MS2-rss06)的质粒p SET2-MS2-rss04、pSET2-MS2-rss06及阴性对照质粒p SET2-MS2-negative,将上述质粒分别电转化至猪链球菌小RNA缺失株Δrss04、Δrss06及野生株P1/7,通过MS2识别序列标签纯化,收集洗脱液,提取RNA。结果显示:表达MS2融合RNA的样品,rss04和rss06分别富集16倍和110倍,而阴性对照组未检测到rss04和rss06的富集。结果表明:MS2识别序列纯化体系成功建立,可用于猪链球菌RNA结合蛋白的筛选,为深入研究猪链球菌小RNA功能提供技术平台。(本文来源于《畜牧与兽医》期刊2018年06期）
张军[10]（2018）在《基于序列信息的DNA/RNA结合蛋白识别》一文中研究指出随着基因组计划的启动和发展,蛋白质序列每年呈指数趋势爆炸式增长,然而其中已知结构和功能的蛋白质数量却增长缓慢。面对日益增多的蛋白质序列,如何从中挖掘有用的信息进而有效地预测蛋白质的结构和功能成为当前一个亟待解决的难题。DNA和RNA结合蛋白是两种特殊的蛋白质,它们在多种有关基因的生命活动中扮演重要的角色,与很多疾病相关。虽然基于实验的方法能够比较准确地识别这两种蛋白,但这些方法的成本都非常高,而且对实验环境和设备有严格的要求。为了设计更加高效快捷的DNA和RNA结合蛋白识别方法,本课题以蛋白质序列信息为基础,对DNA和RNA结合蛋白识别问题进行了研究。针对现有基于序列的DNA结合蛋白识别方法性能有限的问题,本文设计了一个基于加权投票的集成学习策略,结合现有的叁种蛋白质表示方法(k-mer,PDT和PDT-Profile)及SVM算法构建了一个DNA结合蛋白识别模型i DNA-Prot-Vote。在国际上两个广泛使用的数据集上对其进行了测试,结果表明本文所提集成方法能够在基分类器的基础上提升DNA结合蛋白识别准确率,且集成模型i DNA-Prot-Vote的识别准确率高于大多数现存的方法。针对如何有效地表示蛋白质序列的问题,本文设计了叁种基于PSFM谱的蛋白质特征提取方法,包括PSFM-DBT,PSFM-TT和PSFM-RPT。在基准数据集和独立测试集上的测试结果表明本文所提的叁种方法在DNA结合蛋白识别问题上优于大多数现存方法,且PSFM-DBT方法取得了最高的预测准确率。为了验证所提方法的有效性,本文在分子生物学层面对PSFM-DBT提取到的特征进行了分析,结果表明该方法确实能够有效抓取蛋白质特征。基于PSFM-DBT方法本文构建了一个DNA结合蛋白预测模型,并开发了相应的在线预测系统。针对DNA和RNA结合蛋白识别领域没有能够同时识别DNA结合蛋白、RNA结合蛋白以及非核酸结合蛋白的方法,本文基于深度学习技术提出了第一个能够识别上述叁种蛋白质的方法Deep DRBP。Deep DRBP分为两层,每层是一个分类模型,由一种深度神经网络结合一种蛋白质进化信息谱构成。第一层用来区分核酸结合蛋白(DNA/RNA-binding proteins)和非核酸结合蛋白,第二层用来进一步确定在第一层中被预测为核酸结合蛋白的查询蛋白是DNA结合蛋白还是RNA结合蛋白。在基准数据集和Swiss-Prot新增蛋白质上的测试结果表明本文所提方法是一种有效的识别方法。此外,本文还提供了相应的在线预测系统。(本文来源于《哈尔滨工业大学》期刊2018-06-01）
序列结合蛋白论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
目的分析特异AT序列结合蛋白1(SATB1)、E-钙黏蛋白(E-cad)表达水平与乳腺癌患者组织学分级的相关性分析。方法选取2016年3月至2018年4月在郑州美康盛德医学检验所进行检测的119例乳腺癌患者,均接受SATB1、E-cad表达水平检测,分析E-cad、SATB1表达水平与乳腺癌患者临床病理特征的相关性。结果 E-cad表达水平与乳腺癌患者是否绝经、年龄无关(均P>0.05),与乳腺癌患者组织学分级、TNM分期、有无淋巴结转移、肿瘤个数有关(均P<0.05);SATB1表达水平与乳腺癌患者年龄无关(P>0.05),与乳腺癌患者是否绝经、组织学分级、TNM分期、有无淋巴结转移、肿瘤个数有关(均P<0.05)。结论 E-cad表达水平与乳腺癌患者组织学分级、TNM分期、有无淋巴结转移、肿瘤个数有关,SATB1表达水平与乳腺癌患者是否绝经、组织学分级、TNM分期、有无淋巴结转移、肿瘤个数有关,两者联合检测能为乳腺癌患者靶向治疗提供可靠依据。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
序列结合蛋白论文参考文献
[1].赵杰.胃癌组织叉头框蛋白J1和特异AT序列结合蛋白1表达水平及临床意义[J].河南医学研究.2019
[2].韩智锋.特异AT序列结合蛋白1、E-钙黏蛋白表达水平与乳腺癌患者组织学分级的相关性分析[J].河南医学研究.2019
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[4].张丽娜,许昕瑜,郭松佳,任云青.特殊富含AT序列结合蛋白1在胃癌组织中的表达及其对胃癌细胞增殖的影响[J].中国免疫学杂志.2019
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[8].葛宇,董相书,吴斌,程志号,孙长君.油梨果肉捕光叶绿素a/b结合蛋白基因PaCAB1的克隆、序列分析及表达[J].中国南方果树.2018
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