石油污染土壤细菌群落结构及难降解组分功能基因定量研究

石油污染土壤细菌群落结构及难降解组分功能基因定量研究

论文摘要

生物修复技术是实现石油污染土壤净化与功能恢复的重要途径。在此过程中,土壤微生物起着关键性作用,所以探究石油污染土壤中高效降解菌群落变化,以及在基因水平上评价不同修复条件下石油难降解组分关键功能基因代谢的差异性,对进一步提高生物修复效果尤为重要。本研究,选取渭河阶地粉质壤土和黄土台塬粉质壤土为供试土壤,以扁穗冰草和狗牙根草为修复植物,分别在石油污染浓度:0 mg·kg-1、3000 mg·kg-1、7000mg·kg-1及10000 mg·kg-1的条件下,进行石油污染土壤植物-微生物联合修复模拟实验。主要研究内容:(1)利用高通量技术对不同实验条件下24组土壤样品脱氧核糖核酸(DNA)进行测序,通过OTU、稀释度曲线、香浓指数、热图、PCA、RDA等分析,研究不同实验条件下土壤细菌群落结构的变化特征;(2)对石油难降解组分关键功能基因邻苯二酚2,3-双加氧酶(C23O)基因、苯酚羟化酶(QHM)基因、芳烃双加氧酶(Ahd)基因的检测、克隆,从分子水平阐明石油降解机理;(3)通过实时荧光定量聚合酶链式反应(qPCR)构建标准曲线,在此基础上对不同实验条件下12组渭河阶地粉质壤土土壤试样进行功能基因表达定量。主要研究结果如下:(1)不同实验条件下,石油污染植物修复土壤中门水平主要细菌群落为:变形菌门(Proteobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、泉古菌门(Crenarchaeota)、放线菌门(Actinobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、浮霉菌门(Planctomycetes)、绿弯菌门(Chloroflexi)、WS3、芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)、厚壁菌门(Firmicutes)、硝化螺旋菌门(Nitrospirae)、广古菌门(Euryarchaeota)、疣微菌门(Verrucomicrobia)、装甲菌门(Armatimonadetes)、迷踪菌门(Elusimicrobia)。(2)土壤石油污染浓度、修复植物及不同土壤组分性质都对土壤细菌群落结构及其多样性有影响,且石油污染浓度和修复植物比不同土壤性质的影响更为明显。随着石油浓度的增加,土壤中优势菌群细菌数量随污染浓度呈阶梯式增加,较高浓度的石油污染土壤有利于大多数细菌的生长;不同修复植物对土壤理化性质有较大的影响。(3)对邻苯二酚2,3-双加氧酶、苯酚羟化酶、芳烃双加氧酶石油难降解组分关键功能基因进行检测,三种功能基因均符合目的基因的大小,分别约为470bp、85bp、310bp,说明修复土壤中含有以上石油难降解组分关键功能基因。(4)利用SYBR配置反应体系进行实时荧光定量PCR反应,分别建立了邻苯二酚2,3-双加氧酶基因、芳烃双加氧酶基因、苯酚羟化酶基因功能基因定量分析标准曲线(扩增效率E)为:y=-3.77x+38.2(E=84.30%);y=-3.78x+39.72(E=83.9%);y=-2.97x+37.13(E=117%)。(5)根据12组不同实验条件修复的土壤功能基因绝对荧光定量分析发现,狗牙根植物可促进石油污染土壤中邻苯二酚2,3-双加氧酶(C23O)基因、芳烃双加氧酶(Ahd)基因的拷贝,但狗牙根植物修复可能抑制了苯酚羟化酶(QHM)基因的拷贝。在中、高浓度(7000 mg/kg、10000 mg/kg)的石油污染土壤环境中,可促进细菌芳烃双加氧酶(Ahd)功能基因的拷贝。

论文目录

  • 摘要
  • abstract
  • 第一章 绪论
  •   1.1 研究背景及意义
  •   1.2 国内外研究现状
  •     1.2.1 石油污染土壤修复技术
  •     1.2.2 石油污染土壤细菌群落研究
  •     1.2.3 石油污染土壤相关功能基因的研究技术及原理
  •     1.2.4 石油主要组分及其功能基因降解机理
  •   1.3 研究内容及技术路线与创新点
  •     1.3.1 研究内容与技术路线
  •     1.3.2 创新点
  • 第二章 基于不同修复条件下土壤细菌群落结构和多样性研究
  •   2.1 实验区概况
  •   2.2 实验材料与仪器
  •     2.2.1 实验材料
  •     2.2.2 实验耗材及仪器
  •   2.3 实验方法
  •     2.3.1 实验样品
  •     2.3.2 土壤样品DNA的提取
  •     2.3.3 PCR扩增、纯化及测序
  •     2.3.4 测序分析方法
  •   2.4 结果与讨论
  •     2.4.1 不同土壤样品理化性质分析
  •     2.4.2 多样性指数、稀释度曲线及香浓曲线分析
  •     2.4.3 门水平下群落结构分析
  •     2.4.4 目水平下群落结构分析
  •     2.4.5 样品细菌菌群分布热图
  •   2.5 本章小结
  • 第三章 土壤微生物群落中难降解石油组分功能基因的检测与克隆
  •   3.1 实验材料与仪器
  •   3.2 实验方法
  •     3.2.1 DNA提取及浓度检测
  •     3.2.2 引物设计
  •     3.2.3 土壤细菌中石油难降解组分功能基因的检测
  •     3.2.4 目的基因的纯化
  •     3.2.5 土壤细菌中石油难降解组分功能基因的克隆
  •     3.2.6 检测及质粒的提取
  •   3.3 结果与讨论
  •     3.3.1 土壤细菌中难降解石油组分关键功能基因的检测与分析
  •     3.3.2 菌检克隆结果
  •     3.3.3 测序结果
  •   3.4 小结
  • 第四章 土壤中难降解石油组分关键功能基因的定量分析
  •   4.1 实验材料与仪器
  •   4.2 实验方法
  •     4.2.1 标准曲线的构建
  •     4.2.2 难降解石油组分关键功能基因的定量分析
  •   4.3 结果与讨论
  •     4.3.1 难降解组石油分功能基因实时荧光定量标准曲线
  •     4.3.2 邻苯二酚2,3-双加氧酶(C23O)基因荧光定量结果及分析
  •     4.3.3 苯酚羟化酶(QHM)基因荧光定量结果及分析
  •     4.3.4 芳烃双加氧酶(Ahd)基因荧光定量结果及分析
  •   4.4 小结
  • 结论
  • 参考文献
  • 攻读学位期间取得的研究成果
  • 致谢
  • 文章来源

    类型: 硕士论文

    作者: 姬雨

    导师: 李春荣

    关键词: 石油污染土壤,植物修复,细菌群落结构及多样性,实时荧光定量,功能基因

    来源: 长安大学

    年度: 2019

    分类: 基础科学,工程科技Ⅰ辑

    专业: 生物学,环境科学与资源利用,环境科学与资源利用

    单位: 长安大学

    分类号: X53;X172

    总页数: 62

    文件大小: 2783K

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