两种鹤科动物MHC-I基因高变区的对比分析

两种鹤科动物MHC-I基因高变区的对比分析

论文摘要

主要组织相容性复合体(MHC)是脊椎动物基因组中高度多态的基因家族,其编码产物在脊椎动物免疫系统中起着重要作用。受湿地生境污染和破坏等因素的影响,全球现存鹤科(Gruidae)动物大都已处于受胁状态。为了解鹤科动物MHC-I基因序列信息,本研究设计通用引物对灰鹤(Grus grus)和肉垂鹤(Bugeranus carunculatus)MHC-I基因进行分离。结果从1只灰鹤和1只肉垂鹤血液基因组中分别分离到2条和3条长约1 500 bp的序列片段,这暗示鹤科动物至少存在两个MHC-I基因座位。分离到的核苷酸序列均可翻译成正常的氨基酸,表明它们具有一定的生物学功能。MHC-I抗原结合区的核苷酸和氨基酸变异率,灰鹤分别为5.0%和9.6%,肉垂鹤为9.1%和14.6%。两种鹤抗原肽结合位点的非同义替代率与同义替代率的比值分别为7.348 8和2.145 2,表明其受到强烈的正选择作用。贝叶斯系统发生树显示,鹤科动物MHC-I基因并未按物种聚类,暗示MHC-I基因跨物种多态性的存在。本研究获得的MHC-I基因通用引物及序列信息,可为今后濒危鹤科动物的保护遗传学研究奠定基础。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 研究材料
  •   1.2 研究方法
  •     1.2.1 基因组DNA的提取
  •     1.2.2 PCR扩增
  •     1.2.3 克隆测序
  •     1.2.4数据分析
  • 2 结果
  •   2.1 MHC-I基因的鉴定
  •   2.2 MHC-I基因外显子2和3序列的特征
  •     2.2.1 序列的碱基组成
  •     2.2.2 序列的变异
  •   2.3 MHC-I基因受到的自然选择
  •   2.4 MHC-I基因的系统发生
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 刘宏毅,孙成贺,刘大伟,鲁长虎,吕士成

    关键词: 鹤科动物,灰鹤,肉垂鹤,主要组织相容性复合体,保护遗传学

    来源: 动物学杂志 2019年04期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,农业科技

    专业: 生物学

    单位: 南京林业大学生物与环境学院,江苏盐城国家级自然保护区管理处,南京森林警察学院刑事科学技术学院

    基金: 国家自然科学基金项目(No.31800453),江苏省自然科学基金项目(No.BK20160927)

    分类号: Q953

    DOI: 10.13859/j.cjz.201904013

    页码: 567-575

    总页数: 9

    文件大小: 928K

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