导读:本文包含了变铅青链霉菌论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:霉菌,过氧化物,基因,次级,紫红,抗生素,腺苷酸。
变铅青链霉菌论文文献综述
晏兰[1]（2017）在《转录因子WblI对变铅青链霉菌（Streptomyces lividans）抗生素合成调控作用机制的研究》一文中研究指出目前对链霉菌抗生素合成基因沉默表达原因以及激活方式的研究是链霉菌次级代谢研究领域的热点。变铅青链霉菌(Streptomyces lividans)是研究抗生素合成基因沉默表达与激活问题的较好模式菌株。该菌株含有合成ACT(actinorhodin)、RED(undecylprodigiosin)等6种抗生素的基因簇,然而在实验室正常培养条件下,菌株生产抗生素的能力极低,尤其是对呈现蓝色的抗生素ACT的生产基本处于沉默状态。虽然有研究结果显示该沉默状态可以利用基因表达操控等手段打破,但是,目前对变铅青链霉菌抗生素合成基因低表达的调节机制仍缺乏全面系统的理解,尤其是对于该菌株沉默表达ACT的分子机理还尚不明确。本研究发现一WhiB家族转录调控因子WblI(SCO5046),其在变铅青链霉菌中过表达显着促进了宿主抗生素RED及ACT的生产,而对抗生素yCPK的生产和孢子灰色素的生成有明显的抑制作用。为进一步揭示WblI对变铅青链霉菌抗生素生产及形态分化的调控作用机制,本研究采用标签分离共价沉淀染色质的方法鉴定出5个WblI下游调控靶基因,包括wblI自身,ACT合成基因簇中的actVA3及负责ACT胞外运输的actII-1/actII-2,Wbl家族蛋白Wbl A编码基因wblA。研究通过EMSA实验在体外确认了WblI与各靶基因启动子区域的直接结合。采用RT-PCR技术鉴定了WblI对各靶基因转录的调控作用,结果显示,WblI的过表达显着抑制了actVA3,actII-1(TetR家族蛋白,对actII-2转录起负调控作用)及wblA(ACT合成负调控因子)的转录;而对actII-2(ACT胞外运输蛋白)的表达有明显的激活作用。上述实验结果说明WblI过表达促进ACT合成的表型是通过直接调控ACT合成基因簇及wbl A的表达而实现的。本研究明确了WblI对ACT合成基因簇及wblA的上下游调控关系,揭示了WblI正调控变铅青链霉菌抗生素生产的分子机制,完善了链霉菌次级代谢调控网络。研究经验可以应用于日后急需抗生素的开发上。(本文来源于《暨南大学》期刊2017-06-30）
戴道凤[2]（2017）在《变铅青链霉菌DNA硫修饰的抗氧化功能探索》一文中研究指出DNA硫修饰是一种DNA磷酸骨架修饰:即DNA磷酸骨架上一个非桥接的氧原子被硫原子取代。DNA硫修饰由5个基因组成的dnd基因簇负责,这5个基因包括dndA、dndB、dndC、dndD和dndE。dndB-E构成一个操纵子,该操纵子与dndA转录方向相反。dnd基因簇广泛地分布于海洋细菌、土壤细菌和人类致病菌等各种细菌中。目前对于DNA硫修饰的功能仍然所知有限。有研究证明DNA硫修饰属于一个限制-修饰系统。本研究聚焦变铅青链霉菌DNA硫修饰的抗氧化功能。谢新强等的工作发现,在兼性厌氧菌Salmonella enterica中,DNA硫修饰菌株能抗过氧化氢,同时硫修饰的DNA能够与过氧化氢等过氧化物发生反应,还原这些过氧化物。但是,有若干问题尚未解决:1,DNA硫修饰抗氧化是否也存在于其它类型的细菌中?2,DNA硫修饰是否能影响基因转录呢?3,DNA硫修饰是否通过间接的激活抗氧化基因的转录来清除过氧化物?4,负责DNA硫修饰的dnd基因转录是否被过氧化物激活?5,如果dnd基因簇的转录服从氧化物的调控,相应的机理怎样?本研究发现,用20 mM过氧化氢处理野生型变铅青链霉菌1326和dnd基因簇缺失突变株HXY6,1326的存活率是HXY6的2倍;用290μM过氧乙酸(PAA)或20 mM过氧化氢异丙苯(CHP)处理后,1326的存活率是HXY6的10倍。因为变铅青链霉菌是好氧菌和革兰氏阳性菌,这显示在好氧菌和革兰氏阳性菌中,DNA硫修饰也具有抗氧化功能。通过Southern blotting对dndA和dndB基因上的DNA硫修饰位点S9和S13进行了鉴定。通过突变两个修饰位点以及用报道基因儿茶酚-2,3-双加氧酶进行跟踪分析,发现这两个硫修饰位点不能影响dndB基因的转录。比较了1326和HXY6的转录组后,发现DNA硫修饰不能激活抗氧化基因的转录,从而否定了间接清除这个假设,进而暗示DNA硫修饰只能直接清除过氧化物。同时通过检测清除过氧化物的相关基因被诱导的水平,了解胞内过氧化物的水平,发现这些基因(包括5个过氧化氢酶、2个烷基过氧化物还原酶和1个有机过氧化物抗性蛋白)在HXY6中被诱导的转录水平高于1326中的水平,实验结果显示HXY6中积累的过氧化物高于1326,同时暗示菌体内HXY6清除过氧化物的能力弱于1326。体内与体外清除率实验证明,1326菌株清除过氧化氢和PAA的能力都强于硫修饰系统缺失菌株HXY6。这些结果说明在变铅青链霉菌中,DNA硫修饰能直接清除过氧化物。多数抗氧化系统本身的表达会被它们所清除的氧化剂激活。当检测氧化剂百草枯、过氧化氢、联胺(diamide)、PAA和CHP对dnd基因簇的表达的影响时发现,diamide能激活dnd基因簇的转录(2.5倍激活)。同时,本研究也鉴定了变铅青链霉菌1326的dndA和dndB基因的转录起始位点,并对dndB启动子区的调控元件进行了分析。通过启动子区的删除和突变分析以及检测报道基因xylE编码的儿茶酚-2,3-双加氧酶活力,发现dndB启动子区含有一个负调控序列(r重复序列)和一个正调控序列(R重复序列)。发现DndB是dnd基因的负调控蛋白,敲除了dndB后,dnd基因的转录不再受diamide的调控。所以可能的机制是:还原状态的DndB与r重复序列结合,抑制了dndB的转录;被diamide氧化的DndB从r重复序列上释放下来,解除了对dndB的抑制。一个抗氧化系统必须具备以下要求:1,能抗某种氧化物;2,能清除这种氧化物;3,负责该抗氧化系统的基因的转录能被氧化物激活。这3点是一个抗氧化系统必须具备的“金标准”。因此,以上的结果说明DNA硫修饰具备了一个抗氧化系统必须拥有的叁个“金标准”,有力地支持了DNA硫修饰是抗氧化系统这个观点。同时,也为DNA硫修饰抗氧化的生物化学研究指明了方向。(本文来源于《上海交通大学》期刊2017-05-01）
熊康丽,浦天宁,梁晶丹,汪志军[3]（2017）在《变铅青链霉菌广谱胁迫蛋白对氧化压力响应的研究》一文中研究指出【目的】广谱胁迫蛋白(USP)是一种古老的蛋白家族,在链霉菌属细菌中其功能研究尚未报道。以变铅青链霉菌USP蛋白为对象对其功能进行解析。【方法】使用序列比对的方法分析同源性及保守结构域。纯化USP蛋白,用圆二色谱分析蛋白与环腺苷酸(cAMP)的结合对usp(SLI_7517)进行基因中断。检测野生型和usp基因缺失株对偶氮二甲酰胺造成的氧化压力的耐受能力。使用qPCR荧光定量分析技术,检测野生型菌株与usp缺失株在氧化环境中谷胱甘肽过氧化物酶及巯基过氧化物酶基因转录量的差异。【结果】同源序列分析表明链霉菌属来源的USP蛋白序列相互之间相似性较高,USP-like结构域高度保守。USP蛋白在体外结合cAMP引起CD谱的变化。usp基因缺失株对偶氮二甲酰胺更耐受,同时菌株中谷胱甘肽过氧化物酶基因转录量上升。【结论】变铅青链霉菌中USP蛋白能够结合cAMP。usp参与菌体应对氧化环境的调控,对谷胱甘肽过氧化物酶基因的转录有阻遏作用。(本文来源于《微生物学通报》期刊2017年01期）
戴世鲲,周丹燕,王广华,李翔,向文洲[4]（2015）在《接合转移技术将外源DNA大片段引入变铅青链霉菌中的研究》一文中研究指出为了发展一种将150 kb及以上的外源DNA片段引入变铅青链霉菌(Streptomyces lividans)中的有效方法,以大肠杆菌-变铅青链霉菌穿梭细菌人工染色体为载体,将携带完整格尔德霉素生物合成基因簇的3个150~180 kb的外源DNA片段期望以接合转移的方式从大肠杆菌宿主菌(Escherichia coli ET12567/p UZ8002)中横向转移入变铅青链霉菌(Streptomyces lividans)TK23菌株中。结果表明,接合转移技术能够有效地将携带完整格尔德霉素生物合成基因簇的3个外源DNA大片段引入到变铅青链霉菌基因组中并稳定传代。(本文来源于《湖北农业科学》期刊2015年15期）
欧阳昌鑫[5]（2014）在《变铅链霉菌基因磷硫修饰蛋白DndE的表达纯化与结晶初步探讨》一文中研究指出DNA磷硫修饰是迄今为止被发现的第一类发生在DNA骨架上的生理修饰,其是由dnd基因簇编码的DndA、DndB、DndC、DndD、DndE蛋白所调控。根据生物信息学分析,DndE蛋白可能是一类NCAIR合成酶的同源蛋白或者是一种PAPS硫转移酶的同源蛋白,这种功能推测上的模糊性为进一步开展DNA磷硫修饰的研究带来了巨大的困难。因此为了解决这一难点,准确阐述DndE蛋白的生理功能,我们选择DndE蛋白作为研究对象。为了研究DNA磷硫修饰在物种上的保守性和进化性,我们选择了来源于Streptomyces lividans 66的DndE蛋白作为进一步的研究对象。首先,我们摸索了Streptomyces lividans 66 DndE蛋白的表达纯化条件,尝试了不同的载体和不同的表达标签,如pET-44b、pSJ7、pET-28a。最终发现当利用PSMT3载体进行异源表达与纯化的时候,最终可以获得比较稳定的DndEN-flag-livdan蛋白。在获得稳定的DndE蛋白样品以后,我们对其开展了一系列功能的研究。研究表明Streptomyces lividans 66的DndE蛋白存在构象不均一,多聚现象等,且这种多聚与DndE蛋白的浓度有关系。鉴于DndE蛋白多聚的现象,无法使用NMR技术进行结构的解析,于是我们尝试用X-ray的方法对DndE蛋白进行结晶学研究。在得到比较稳定的蛋白样品后,进行了一系列的结晶筛选和结晶优化,再进行晶体条件初筛的时候得到了一些DndE的晶体,随即对一些晶型比较好的晶体进行优化,可惜的是,由于没有达到晶体解析的分辨率,最终没有得到DndE的晶体结构。根据最近的文献报道,发现在Escherichia coli B7A的DndE蛋白可能是一种骨架新颖的DNA结合蛋白。于是,我们也猜测Streptomyces lividans 66的DndE蛋白是不是也有可能是一种DNA结合蛋白,为了验证这一点,我们设计了随机标记的荧光DNA双链小分子(fluorescence polarization, FP)对其开展研究,发现DndE蛋白和随机的DNA的双链有较强的结合,故推测DndE蛋白是一种与DNA有着非特异性结合的、新颖的DNA结合蛋白,在整个DNA硫修饰的机制中可能扮演一个传递的功能。(本文来源于《扬州大学》期刊2014-10-01）
张家瑚,钟晶晶,戴剑漉,王以光,夏焕章[6]（2014）在《耐热链霉菌4″-O-异戊酰基转移酶基因在变铅青链霉菌TK24中的表达》一文中研究指出拟研究异源调控系统提高耐热链霉菌Streptomyces thermotolerans 4″-O-异戊酰基转移酶基因(ist)表达的可能性。在麦迪霉素产生菌Streptomyces mycarofaciens 1748中曾克隆到BamHⅠ~8.0 kb片段,含此基因片段的变铅青链霉菌TK24 Streptomyces lividans TK24转化子可将螺旋霉素高效转化为丙酰螺旋霉素。序列分析表明此片段除包含麦迪霉素4″-O-丙酰基转移酶基因(mpt)外还存在与其连锁的两个正调控基因orf27和orf28。将这个基因簇中mpt基因的orf替换为ist基因的orf,然后与两个正调控基因或者单独一个orf27连接,将这些构建好的片段分别克隆到中等拷贝数及高拷贝数载体pKC1139和pWHM3上,再转化到S.lividans TK24中。通过测定S.lividans TK24转化子中螺旋霉素生物转化为4″-O-酰化螺旋霉素的产率来评价mpt和ist基因的表达水平。结果表明只有高拷贝载体pWHM3构建的重组质粒S.lividans TK24转化子中才能明显检测到4″-O-异戊酰螺旋霉素的产生。mpt基因的正调节系统可以提高ist基因的表达水平,含两个调节基因的转化子转化效率高于含单一调节基因的转化子。(本文来源于《生物工程学报》期刊2014年09期）
高婕,韩铁生,丰俊,贺新义[7]（2014）在《大肠杆菌甲基转移酶dcm基因的表达对变铅青链霉菌的多效性影响》一文中研究指出【目的】大肠杆菌的dcm基因编码的DNA甲基转移酶可以特异性地将5′CCWGG3′(W=A/T)序列中第二个胞嘧啶变成5-甲基胞嘧啶。Dcm甲基转移酶发现已有37年了,但其确切的功能不明,本篇主要研究其对变铅青链霉菌的影响。【方法】通过构建克隆、接合转移、异源表达及HPLC、酶切、Southern杂交等方法研究dcm基因的表达对变铅青链霉菌的多效性影响。【结果】首次发现变铅青链霉菌基因组中不含5-甲基胞嘧啶修饰,将dcm基因导入变铅青链霉菌后,接合子菌落比正常菌落小很多,并有放线紫红素产生。【结论】基因组的表观遗传修饰能激活沉默放线紫红素基因簇的表达这一现象,为基因组挖掘隐藏的活性天然产物提供了一条新途径。(本文来源于《微生物学通报》期刊2014年09期）
白亭丽,俞燕飞,徐钟,陶美凤[8]（2014）在《变铅青链霉菌高效异源表达宿主SBT5的构建》一文中研究指出以变铅青链霉菌TK24为出发菌株,依次敲除钙依赖抗生素(CDA)、放线紫红素(ACT)和十一烷基灵菌红素(RED)这3个内源抗生素的生物合成基因簇,同时在钙依赖抗生素基因簇原位整合了来自棒状链霉菌的全局性调控基因afsRScla,构建得到变铅青链霉菌菌株SBT5。将来自天蓝色链霉菌的放线紫红素生物合成基因簇导入SBT5中,接合子产生大量蓝色的放线紫红素,而出发菌株TK24只产微量蓝色抗生素;SBT5接合子的ACT产量也显着高于导入了额外act基因簇拷贝的出发菌株接合子。SBT5菌株次级代谢背景清晰,不产色素类抗生素和抗细菌抗生素,可作为高效宿主用于次级代谢产物基因簇的异源表达和筛选。(本文来源于《华中农业大学学报》期刊2014年01期）
张莹,陶欣艺,王风清,魏东芝[9]（2013）在《两种组成型启动子PermE*和PSau3A在变铅青链霉菌中的启动效果比较》一文中研究指出红霉素抗性启动子PermE*和来源于链霉菌核基因组片段的PSau3A启动子均属于链霉菌组成型强启动子,分别将它们插入大肠杆菌-链霉菌穿梭质粒pNW-S1的SD序列和转录起始位点之间,构建成两个稳定的组成型表达质粒:pNW-S3和pNW-S4。以磷脂酰丝氨酸合成酶PSS基因为报道基因,以蛋白表达水平评价这两个启动子在变铅青链霉菌TK24中的表达效果。结果表明,在两株组成型表达重组菌中,PSS均得到了高效表达,具有在链霉菌系统中高效表达外源基因的功能,其中PermE*的启动效率略高于PSau3A。(本文来源于《化学与生物工程》期刊2013年11期）
郑华亮,白亭丽,陶美凤[10]（2013）在《大肠杆菌乙酰-CoA羧化酶基因异源表达对变铅青链霉菌次级代谢的影响》一文中研究指出克隆组装了大肠杆菌的乙酰-CoA羧化酶基因acc,以研究其异源表达对变铅青链霉菌中2种"沉默"抗生素放线紫红素和十一烷基灵菌红素合成的影响。大肠杆菌ACC由4个基因编码,通过PCR扩增4个基因,并通过重迭延伸PCR加上ermE启动子,构建得到4个重组基因;再将重组基因依次组装得到异源表达质粒pHLZ11,接合转移到变铅青链霉菌中进行异源表达。结果显示:含有异源表达质粒的变铅青链霉菌接合转移子能合成放线紫红素而十一烷基灵菌红素产量提高。表明大肠杆菌acc基因异源表达能够激活变铅青链霉菌沉默抗生素的合成,并提高已有抗生素产量。(本文来源于《华中农业大学学报》期刊2013年04期）
变铅青链霉菌论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
DNA硫修饰是一种DNA磷酸骨架修饰:即DNA磷酸骨架上一个非桥接的氧原子被硫原子取代。DNA硫修饰由5个基因组成的dnd基因簇负责,这5个基因包括dndA、dndB、dndC、dndD和dndE。dndB-E构成一个操纵子,该操纵子与dndA转录方向相反。dnd基因簇广泛地分布于海洋细菌、土壤细菌和人类致病菌等各种细菌中。目前对于DNA硫修饰的功能仍然所知有限。有研究证明DNA硫修饰属于一个限制-修饰系统。本研究聚焦变铅青链霉菌DNA硫修饰的抗氧化功能。谢新强等的工作发现,在兼性厌氧菌Salmonella enterica中,DNA硫修饰菌株能抗过氧化氢,同时硫修饰的DNA能够与过氧化氢等过氧化物发生反应,还原这些过氧化物。但是,有若干问题尚未解决:1,DNA硫修饰抗氧化是否也存在于其它类型的细菌中?2,DNA硫修饰是否能影响基因转录呢?3,DNA硫修饰是否通过间接的激活抗氧化基因的转录来清除过氧化物?4,负责DNA硫修饰的dnd基因转录是否被过氧化物激活?5,如果dnd基因簇的转录服从氧化物的调控,相应的机理怎样?本研究发现,用20 mM过氧化氢处理野生型变铅青链霉菌1326和dnd基因簇缺失突变株HXY6,1326的存活率是HXY6的2倍;用290μM过氧乙酸(PAA)或20 mM过氧化氢异丙苯(CHP)处理后,1326的存活率是HXY6的10倍。因为变铅青链霉菌是好氧菌和革兰氏阳性菌,这显示在好氧菌和革兰氏阳性菌中,DNA硫修饰也具有抗氧化功能。通过Southern blotting对dndA和dndB基因上的DNA硫修饰位点S9和S13进行了鉴定。通过突变两个修饰位点以及用报道基因儿茶酚-2,3-双加氧酶进行跟踪分析,发现这两个硫修饰位点不能影响dndB基因的转录。比较了1326和HXY6的转录组后,发现DNA硫修饰不能激活抗氧化基因的转录,从而否定了间接清除这个假设,进而暗示DNA硫修饰只能直接清除过氧化物。同时通过检测清除过氧化物的相关基因被诱导的水平,了解胞内过氧化物的水平,发现这些基因(包括5个过氧化氢酶、2个烷基过氧化物还原酶和1个有机过氧化物抗性蛋白)在HXY6中被诱导的转录水平高于1326中的水平,实验结果显示HXY6中积累的过氧化物高于1326,同时暗示菌体内HXY6清除过氧化物的能力弱于1326。体内与体外清除率实验证明,1326菌株清除过氧化氢和PAA的能力都强于硫修饰系统缺失菌株HXY6。这些结果说明在变铅青链霉菌中,DNA硫修饰能直接清除过氧化物。多数抗氧化系统本身的表达会被它们所清除的氧化剂激活。当检测氧化剂百草枯、过氧化氢、联胺(diamide)、PAA和CHP对dnd基因簇的表达的影响时发现,diamide能激活dnd基因簇的转录(2.5倍激活)。同时,本研究也鉴定了变铅青链霉菌1326的dndA和dndB基因的转录起始位点,并对dndB启动子区的调控元件进行了分析。通过启动子区的删除和突变分析以及检测报道基因xylE编码的儿茶酚-2,3-双加氧酶活力,发现dndB启动子区含有一个负调控序列(r重复序列)和一个正调控序列(R重复序列)。发现DndB是dnd基因的负调控蛋白,敲除了dndB后,dnd基因的转录不再受diamide的调控。所以可能的机制是:还原状态的DndB与r重复序列结合,抑制了dndB的转录;被diamide氧化的DndB从r重复序列上释放下来,解除了对dndB的抑制。一个抗氧化系统必须具备以下要求:1,能抗某种氧化物;2,能清除这种氧化物;3,负责该抗氧化系统的基因的转录能被氧化物激活。这3点是一个抗氧化系统必须具备的“金标准”。因此,以上的结果说明DNA硫修饰具备了一个抗氧化系统必须拥有的叁个“金标准”,有力地支持了DNA硫修饰是抗氧化系统这个观点。同时,也为DNA硫修饰抗氧化的生物化学研究指明了方向。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
变铅青链霉菌论文参考文献
[1].晏兰.转录因子WblI对变铅青链霉菌（Streptomyceslividans）抗生素合成调控作用机制的研究[D].暨南大学.2017
[2].戴道凤.变铅青链霉菌DNA硫修饰的抗氧化功能探索[D].上海交通大学.2017
[3].熊康丽,浦天宁,梁晶丹,汪志军.变铅青链霉菌广谱胁迫蛋白对氧化压力响应的研究[J].微生物学通报.2017
[4].戴世鲲,周丹燕,王广华,李翔,向文洲.接合转移技术将外源DNA大片段引入变铅青链霉菌中的研究[J].湖北农业科学.2015
[5].欧阳昌鑫.变铅链霉菌基因磷硫修饰蛋白DndE的表达纯化与结晶初步探讨[D].扬州大学.2014
[6].张家瑚,钟晶晶,戴剑漉,王以光,夏焕章.耐热链霉菌4″-O-异戊酰基转移酶基因在变铅青链霉菌TK24中的表达[J].生物工程学报.2014
[7].高婕,韩铁生,丰俊,贺新义.大肠杆菌甲基转移酶dcm基因的表达对变铅青链霉菌的多效性影响[J].微生物学通报.2014
[8].白亭丽,俞燕飞,徐钟,陶美凤.变铅青链霉菌高效异源表达宿主SBT5的构建[J].华中农业大学学报.2014
[9].张莹,陶欣艺,王风清,魏东芝.两种组成型启动子PermE*和PSau3A在变铅青链霉菌中的启动效果比较[J].化学与生物工程.2013
[10].郑华亮,白亭丽,陶美凤.大肠杆菌乙酰-CoA羧化酶基因异源表达对变铅青链霉菌次级代谢的影响[J].华中农业大学学报.2013
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