导读:本文包含了正向消减文库论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:文库,基因,抑制,差异,家蝇,柽柳,肌肉。
正向消减文库论文文献综述
吕宝乾,万婕,李艺琼,金启安,彭正强[1](2014)在《低温胁迫下椰心叶甲啮小蜂正反向消减cDNA文库的构建及其序列分析》一文中研究指出【背景】椰心叶甲啮小蜂在防治椰心叶甲危害上取得了重要成果,其耐低温胁迫能力将决定该寄生蜂是否能在低温环境下建立种群并发挥控害效能。筛选椰心叶甲啮小蜂低温胁迫下相关响应基因,可为揭示其耐寒性机理提供重要线索。【方法】采用抑制消减杂交技术,分别以经0℃处理24 h后的试虫与未经低温处理的试虫c DNA互为tester与driver,正反向构建椰心叶甲啮小蜂c DNA消减文库,经蓝、白斑筛选,鉴定阳性差异片段,并分别随机挑选正反向文库224和119个阳性克隆进行序列比对分析。【结果】本试验所构建的c DNA消减文库为椰心叶甲啮小蜂低温胁迫下特异表达的c DNA消减文库;经蓝、白斑筛选,分别得到了40和4个高质量ESTs,经PCR鉴定插入片段长度主要分布于200~700 bp之间;序列分析结果表明,差异表达基因的功能主要涉及新陈代谢、细胞结构、信号传导、氨基酸和蛋白质合成的生理过程,并筛选出5类与啮小蜂耐寒性相关的基因,包括Hsp家族蛋白、海藻糖磷酸合酶、谷氨酰胺合成酶、ATP合成酶β亚基和NADH脱氢酶。【结论与意义】该研究对进一步研究椰心叶甲啮小蜂抗寒性状的表达具有一定的参考价值,为揭示啮小蜂抗低温耐寒机制打下一定的理论基础。(本文来源于《生物安全学报》期刊2014年03期)
王少干[2](2012)在《陆地棉纤维次生壁加厚期正向消减文库的构建及差异表达基因分析》一文中研究指出棉花是重要的经济作物,也是纺织工业中天然纤维的主要来源。此外,棉纤维细胞也是研究植物细胞伸长、纤维素合成和次生壁发育的理想模式材料。近年来,伴随着各种高通量研究策略的使用,棉纤维发育的遗传机理得到了更深层次的研究,并取得了一系列重要的研究成果。然而,大部分研究主要集中在纤维发育的起始和伸长阶段,对次生壁加厚期的研究还相对较少,极大地限制了利用基因工程手段改良棉纤维比强度这一重要纤维品质性状的步伐。因此,有必要针对棉纤维次生壁加厚期的遗传机理开展进一步的研究,为棉花分子育种提供更多可利用的基因资源。本研究以陆地棉高断裂比强度材料0-153和转基因抗虫棉sGK9708为亲本构建的高代重组自交系群体(F6:9)中选育出的高比强度纤维品系(H,69307)作为研究材料,利用抑制性消减杂交(SSH)技术,构建了陆地棉纤维次生壁加厚期的正向消减cDNA文库,并对差异表达基因进行分析。本研究结果如下:1、本研究以H15DPA纤维为driver、H20DPA纤维为tester,成功构建出陆地棉纤维次生壁加厚期的正向消减cDNA文库。该文库共包含1152个阳性克隆,重组率为97.04%,滴度为1.89×104cfu/ml。2、对挑选的1152个阳性克隆进行反向Northern筛选,共得到340个差异表达克隆,代表115个非冗余基因,其中包含35个重迭群,80个单拷贝。生物信息学分析表明,这些差异表达基因广泛参与了糖类、脂类、氨基酸等物质的代谢,以及纤维素生物合成、细胞壁合成与修饰、氧化还原、细胞信号转导等生物学过程。3、从115个差异表达基因中选取18个代表性基因,利用荧光定量PCR进行表达模式分析。结果表明,所挑选的基因在H20DPA纤维中的表达水平均明显高于其在H15DPA纤维中的表达水平,说明消减文库的结果真实,可靠。同时,也暗示这些基因可能与棉纤维的次生壁加厚相关。上述18个基因包括水通道蛋白、阿拉伯半乳糖蛋白4、类受体蛋白激酶、类成束蛋白阿拉伯半乳糖蛋白1、类成束蛋白阿拉伯半乳糖蛋白16、类几丁质酶蛋白1、FbLate-2、纤维素合成酶1、纤维素合成酶2、果胶甲酯酶5、细胞色素C氧化还原酶,Cobra-like4蛋白、NADH脱氢酶亚基、植物类糖原淀粉起始蛋白3、分泌载体膜蛋白、功能未知基因1-A10、功能未知基因3-E3、功能未知基因10-F6。4、利用简单序列重复识别工具SSRIT对115条EST序列进行简单序列重复(SSR)位点的筛选,共得到16条含有SSR位点的序列,并设计了16对SSR引物。5、通过对16个EST-SSR分子标记的多态性检测发现,其中1个标记具有共显性。此外,经遗传连锁作图及染色体定位分析将该标记定位在陆地棉第16号染色体上,且与CGR5621S标记紧密连锁,遗传距离仅0.6cM。(本文来源于《华中农业大学》期刊2012-06-01)
张惠,左红梅,孙青松,刘树明,王东方[3](2010)在《沙门氏菌诱导家蝇幼虫抑制性正向消减文库的构建》一文中研究指出细菌耐药性研究是当前的热点和重点,耐药沙门氏菌就是其中一例,它对喹诺酮类、磺胺类、头孢菌素、氯霉素及四环素等多种抗生素具有耐药性[2]。因此寻找新的抗菌策略势在必行。目前,抗菌肽研究与应用是解决这一问题的重要策略。抗菌肽是生物免疫系统产生的一类抵抗外界病原体感染的小分子肽类生物活(本文来源于《东北叁省及内蒙古生物化学与分子生物学学会2010年学术交流会论文集》期刊2010-08-10)
方定志,刘秉文,沈涛,白怀[4](2005)在《高凝状态大鼠肝脏差异表达基因正向消减cDNA文库的构建与初筛》一文中研究指出目的构建高凝状态(prothrom botic states,PTS)大鼠肝脏差异表达基因正向消减cDNA文库并进行初步筛选。方法从PTS模型大鼠和对照大鼠肝脏提取po ly A+mRNA,分别以po ly A+mRNA为模板,依次合成单链和双链cDNA,经酶切成400~600 bp大小的片段。以PTS大鼠cDNA作为T ester,对照大鼠cDNA为D river,进行抑制性消减杂交。将消减杂交第二次PCR产物cDNA克隆至pM D 18-T载体上,然后转化细菌,获得PTS大鼠肝脏差异表达基因正向消减cDNA文库。用巢式PCR扩增法制备“正向”和“反向”消减cDNA探针;采用差异筛选方法,用这两种探针对PTS大鼠肝脏差异表达基因正向消减cDNA文库进行筛选;将获得的阳性克隆cDNA进行序列分析;并与G enB ank DNA数据库中的DNA序列进行同源性分析。结果成功构建了PTS大鼠肝脏差异表达基因正向消减cDNA文库,初步筛选发现两条PTS差异表达cDNA片段。结论成功构建了PTS大鼠肝脏差异表达基因正向消减cDNA文库。(本文来源于《四川大学学报(医学版)》期刊2005年06期)
刘桂丰,侯英杰,王玉成,褚延广[5](2005)在《干旱胁迫下多枝柽柳正反向消减cDNA文库的构建》一文中研究指出以干旱处理和生长在土壤水分充足的多枝柽柳的叶片为材料,利用抑制性消减杂交技术(SSH)成功地构建了干旱处理与对照之间的正反向消减cDNA文库。琼脂糖凝胶电泳分析表明,消减前后的PCR产物电泳谱带差异明显,说明消减成功。经检测,文库克隆的重组率为95%,插入片段多数集中在0.2~0.5kb之间。对正向文库部分克隆进行测序发现,文库中含有Mn-SOD、钙调蛋白、钙依赖蛋白激酶、脱水诱导蛋白等大量的抗旱相关基因,说明干旱胁迫下多枝柽柳抑制性消减文库已经构建成功。(本文来源于《东北林业大学学报》期刊2005年05期)
毕延震,熊远着,徐德全,谢红涛[6](2005)在《猪杂种一代与亲本肌肉组织间正反向消减cDNA文库的构建》一文中研究指出应用抑制消减杂交技术成功构建了杂种一代梅大猪、亲代大白猪的背最长肌正反向消减cDNA文库。以βactin为指标检测2个文库的消减效率分别为215和210倍。从相应的质粒文库中分别获取了700个和623个有效阳性克隆,PCR检测插入片段主要分布在150~600 bp之间。亲本与子代肌肉组织间消减cDNA文库的构建为进一步分离、鉴定与杂种优势相关的基因奠定了基础。(本文来源于《畜牧兽医学报》期刊2005年05期)
邱峰[7](2005)在《甘蓝型油菜Cr3529正向消减文库部分片段的序列分析及反向文库中一个未知蛋白基因的cDNA克隆》一文中研究指出为了从可能的差异表达基因入手研究甘蓝型油菜幼叶黄化突变体Cr3529黄化性状的成因,从本实验室构建的野生型3529——突变体Cr3529正向抑制性消减杂交(suppression subtractive hybridization, SSH)文库中选取了33个克隆进行序列分析。测序结果显示,33个克隆中,7、14号克隆为重复的克隆,二者大小相同,且只有一个碱基的差异;15、18号克隆为同一基因的不同片段;其余均为独立的克隆。BLASTn和BLASTx分析的结果表明,11、22、31号克隆与捕光色素chla/b结合蛋白同源,3、17分别与PSⅡ反应中心及其相关的蛋白同源,另外15和18号克隆与推测的chl P基因有着较高的同源性,该基因被认为参与叶绿素的合成。由此可以初步证实本实验室关于突变体的黄化性状与光合作用,特别是叶绿素的合成相关的推测。此外,对其余克隆的序列分析表明,这些克隆涉及到氨基酸代谢、糖代谢、脂肪酸代谢等多个代谢过程,初步说明了黄化性状还可能涉及到各个代谢途径。 为了研究反向消减文库中一个未知基因功能,利用RACE(rapid amplification of cDNA ends)技术,在已知片段的基础上,对该基因的5’端cDNA进行了扩增,经过两轮PCR得到了该基因5’端约1000bp的序列,将之与原有已知片段拼接得到一个大小为1343bp的片段,序列分析发现该片段的1~1299位碱基为基因编码区;BLAST分析表明,该基因与来自拟南芥的一个编码未知蛋白质的基因(GenBank登录号At4g01080)同源性达80.1%,但由于单个碱(本文来源于《四川大学》期刊2005-05-01)
徐德全,张义兵,熊远着,桂建芳,蒋思文[8](2004)在《梅山猪与长白猪肌肉组织间正反向消减cDNA文库的构建》一文中研究指出以梅山猪和长白猪背最长肌为材料,利用抑制性消减杂交技术,成功构建了梅山猪与长白猪肌肉组织间正反向消减cDNA文库。以管家基因G3PDH作为消减指标,检测梅山猪和长白猪两个消减文库的消减效率分别高达2~(10)和2~5倍,表明某些特异于两种肌肉组织的差异表达基因富集效率也分别接近2~(10)和2~5倍。从两个消减文库中分别筛选到了709和673个有效阳性克隆,PCR鉴定插入片段长度主要分布于150~750 bp之间。不同猪种肌肉组织间消减cDNA文库的构建为进一步分离和鉴定影响肌肉生长和肉质的基因奠定了基础,对探讨肌肉生长机理和肉质决定因素,以及应用于分子育种具有重要意义。(本文来源于《中国畜牧兽医学会2004学术年会暨第五届全国畜牧兽医青年科技工作者学术研讨会论文集(上册)》期刊2004-09-01)
徐德全,张义兵,熊远着,桂建芳,蒋思文[9](2003)在《梅山猪与长白猪肌肉组织间正反向消减cDNA文库的构建》一文中研究指出以梅山猪和长白猪的背最长肌为材料 ,利用抑制性消减杂交技术成功构建了梅山猪与长白猪肌肉组织间正反向消减cDNA文库。以管家基因G3PDH作为消减指标 ,检测梅山猪和长白猪两个消减文库的消减效率分别高达 2 10 和 2 5倍 ,表明某些特异于两种肌肉组织的差异表达基因的富集效率也分别接近 2 10 和 2 5倍。从两个消减文库中分别筛选到了 70 9和 6 73个有效阳性克隆 ,PCR鉴定插入片段长度主要分布于 15 0~ 75 0bp之间。不同猪种肌肉组织间消减cDNA文库的构建为进一步分离和鉴定与猪肌肉生长和肉质相关基因奠定了基础 ,对探讨肌肉生长机理和肉质决定因素以及猪的分子育种具有重要意义。(本文来源于《遗传学报》期刊2003年07期)
正向消减文库论文开题报告
(1)论文研究背景及目的
此处内容要求:
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例:
棉花是重要的经济作物,也是纺织工业中天然纤维的主要来源。此外,棉纤维细胞也是研究植物细胞伸长、纤维素合成和次生壁发育的理想模式材料。近年来,伴随着各种高通量研究策略的使用,棉纤维发育的遗传机理得到了更深层次的研究,并取得了一系列重要的研究成果。然而,大部分研究主要集中在纤维发育的起始和伸长阶段,对次生壁加厚期的研究还相对较少,极大地限制了利用基因工程手段改良棉纤维比强度这一重要纤维品质性状的步伐。因此,有必要针对棉纤维次生壁加厚期的遗传机理开展进一步的研究,为棉花分子育种提供更多可利用的基因资源。本研究以陆地棉高断裂比强度材料0-153和转基因抗虫棉sGK9708为亲本构建的高代重组自交系群体(F6:9)中选育出的高比强度纤维品系(H,69307)作为研究材料,利用抑制性消减杂交(SSH)技术,构建了陆地棉纤维次生壁加厚期的正向消减cDNA文库,并对差异表达基因进行分析。本研究结果如下:1、本研究以H15DPA纤维为driver、H20DPA纤维为tester,成功构建出陆地棉纤维次生壁加厚期的正向消减cDNA文库。该文库共包含1152个阳性克隆,重组率为97.04%,滴度为1.89×104cfu/ml。2、对挑选的1152个阳性克隆进行反向Northern筛选,共得到340个差异表达克隆,代表115个非冗余基因,其中包含35个重迭群,80个单拷贝。生物信息学分析表明,这些差异表达基因广泛参与了糖类、脂类、氨基酸等物质的代谢,以及纤维素生物合成、细胞壁合成与修饰、氧化还原、细胞信号转导等生物学过程。3、从115个差异表达基因中选取18个代表性基因,利用荧光定量PCR进行表达模式分析。结果表明,所挑选的基因在H20DPA纤维中的表达水平均明显高于其在H15DPA纤维中的表达水平,说明消减文库的结果真实,可靠。同时,也暗示这些基因可能与棉纤维的次生壁加厚相关。上述18个基因包括水通道蛋白、阿拉伯半乳糖蛋白4、类受体蛋白激酶、类成束蛋白阿拉伯半乳糖蛋白1、类成束蛋白阿拉伯半乳糖蛋白16、类几丁质酶蛋白1、FbLate-2、纤维素合成酶1、纤维素合成酶2、果胶甲酯酶5、细胞色素C氧化还原酶,Cobra-like4蛋白、NADH脱氢酶亚基、植物类糖原淀粉起始蛋白3、分泌载体膜蛋白、功能未知基因1-A10、功能未知基因3-E3、功能未知基因10-F6。4、利用简单序列重复识别工具SSRIT对115条EST序列进行简单序列重复(SSR)位点的筛选,共得到16条含有SSR位点的序列,并设计了16对SSR引物。5、通过对16个EST-SSR分子标记的多态性检测发现,其中1个标记具有共显性。此外,经遗传连锁作图及染色体定位分析将该标记定位在陆地棉第16号染色体上,且与CGR5621S标记紧密连锁,遗传距离仅0.6cM。
(2)本文研究方法
调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
正向消减文库论文参考文献
[1].吕宝乾,万婕,李艺琼,金启安,彭正强.低温胁迫下椰心叶甲啮小蜂正反向消减cDNA文库的构建及其序列分析[J].生物安全学报.2014
[2].王少干.陆地棉纤维次生壁加厚期正向消减文库的构建及差异表达基因分析[D].华中农业大学.2012
[3].张惠,左红梅,孙青松,刘树明,王东方.沙门氏菌诱导家蝇幼虫抑制性正向消减文库的构建[C].东北叁省及内蒙古生物化学与分子生物学学会2010年学术交流会论文集.2010
[4].方定志,刘秉文,沈涛,白怀.高凝状态大鼠肝脏差异表达基因正向消减cDNA文库的构建与初筛[J].四川大学学报(医学版).2005
[5].刘桂丰,侯英杰,王玉成,褚延广.干旱胁迫下多枝柽柳正反向消减cDNA文库的构建[J].东北林业大学学报.2005
[6].毕延震,熊远着,徐德全,谢红涛.猪杂种一代与亲本肌肉组织间正反向消减cDNA文库的构建[J].畜牧兽医学报.2005
[7].邱峰.甘蓝型油菜Cr3529正向消减文库部分片段的序列分析及反向文库中一个未知蛋白基因的cDNA克隆[D].四川大学.2005
[8].徐德全,张义兵,熊远着,桂建芳,蒋思文.梅山猪与长白猪肌肉组织间正反向消减cDNA文库的构建[C].中国畜牧兽医学会2004学术年会暨第五届全国畜牧兽医青年科技工作者学术研讨会论文集(上册).2004
[9].徐德全,张义兵,熊远着,桂建芳,蒋思文.梅山猪与长白猪肌肉组织间正反向消减cDNA文库的构建[J].遗传学报.2003