应用代谢网络模型解析工业微生物胞内代谢

应用代谢网络模型解析工业微生物胞内代谢

论文摘要

为了快速、高效地理解工业微生物胞内代谢特征,寻找潜在的代谢工程改造靶点,基因组规模代谢网络模型(GSMM)作为一种系统生物学工具越来越受到人们的关注。文中在回顾GSMM 20年发展历程的基础上,分析了当前GSMM的研究现状,总结了GSMM的构建及分析方法,从预测细胞表型和指导代谢工程两个方面阐述了GSMM在解析工业微生物胞内代谢中的应用,并展望了GSMM未来的发展趋势。

论文目录

  • 1 代谢网络模型的发展
  •   1.1 代谢网络模型的研究现状
  •   1.2 代谢网络模型的发展趋势
  •     1.2.1 互作网络模型
  •     1.2.2 泛基因组模型
  •     1.2.3 宏基因组模型
  • 2 代谢网络模型的分析
  •   2.1 模型构建
  •   2.2 模型分析
  •     2.2.1 流量平衡分析类算法
  •     2.2.2 遗传扰动类算法
  • 3 代谢网络模型在解析胞内代谢中的应用
  •   3.1 预测细胞表型
  •   3.2 指导代谢工程
  • 4 结论与展望
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 叶超,徐楠,陈修来,刘立明

    关键词: 微生物胞内代谢,生产性能,基因组规模代谢网络模型,系统生物学

    来源: 生物工程学报 2019年10期

    年度: 2019

    分类: 基础科学

    专业: 生物学

    单位: 江南大学食品科学与技术国家重点实验室,江南大学工业生物技术教育部重点实验室,扬州大学生物科学与技术学院

    基金: 国家重点研发计划(No.2018YFA0901401),2018年“万人计划”科技创新领军人才支持经费,国家自然科学基金(No.21808083),江苏省科技支撑计划社会发展项目(Nos.BE2018623,BE2017622),广东省重点领域研发计划项目(No.2019B020218001)资助~~

    分类号: Q936

    DOI: 10.13345/j.cjb.190257

    页码: 1901-1913

    总页数: 13

    文件大小: 2208K

    下载量: 284

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