基于生物信息学和质谱技术的阿胶特异性肽段筛选与鉴定

基于生物信息学和质谱技术的阿胶特异性肽段筛选与鉴定

论文摘要

目的:建立基于生物信息技术和液质联用技术识别特征肽鉴别阿胶的新方法。方法:利用生物信息技术对驴皮、牛皮和猪皮I型胶原蛋白α1链氨基酸序列进行同源性比对发现3种皮类胶原蛋白氨基酸序列存在差异,通过生物学软件模拟胰酶酶解,分析比对驴皮、牛皮、猪皮来源I型胶原蛋白α1链酶解肽段,然后通过实验对样品前处理条件进行系统摸索,采用超高效液相色谱-四级杆飞行时间质谱(UPLC/Q-TOF-MS)进行验证。结果:筛选出12个驴皮的特异性肽段,鉴定出1个与预测结果一致的驴皮特异性肽段,其质荷比(m/z)为766.4,分子量为1 530.802 2,对应的多肽序列为GEAGPAGPAGPIGPVGAR,利用特征肽段对10组阿胶样品进行鉴定。结论:生物信息技术结合UPLC/Q-TOF-MS检测出的驴皮特征肽可有效、特异、准确地对阿胶药材进行专属性鉴定。

论文目录

  • 1 实验部分
  •   1.1 材料与仪器
  •     1.1.1 材料
  •     1.1.2 试剂
  •     1.1.3 仪器
  •   1.2 生物信息技术模拟酶解
  •   1.3 样品处理
  •   1.4 生物酶解
  •   1.5 UPLC/Q-TOF-MS分析
  • 2 结果与讨论
  •   2.1 I型胶原蛋白模拟酶切的生物信息分析
  •   2.2 驴皮及其他皮类总离子流图的建立
  •     2.2.1 样品前处理条件优化
  •     2.2.2 酶解条件优化
  •     2.2.3 3种皮类UPLC-TOF/MS分析结果
  •   2.3 实际样品的鉴定结果
  • 3 结论与展望
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 王芳,范雨,叶茂,曹秀君,童芯锌,彭成,国锦琳

    关键词: 阿胶鉴定,胰酶,特异肽段,生物信息学

    来源: 中国现代中药 2019年09期

    年度: 2019

    分类: 医药卫生科技,基础科学

    专业: 生物学,中药学

    单位: 成都中医药大学中药资源系统研究与开发利用重点实验室中药材标准化重点实验室

    基金: 四川省青年科技创新团队项目(19CXTD0055)

    分类号: Q811.4;R28

    DOI: 10.13313/j.issn.1673-4890.20190320005

    页码: 1256-1261+1266

    总页数: 7

    文件大小: 972K

    下载量: 253

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