八肋游仆虫组织蛋白酶B基因家族的分子克隆及序列分析

八肋游仆虫组织蛋白酶B基因家族的分子克隆及序列分析

论文摘要

组织蛋白酶B (cathepsin B, CTSB)是一种主要存在于溶酶体中的半胱氨酸蛋白水解酶,广泛存在于各种生物中。为了研究八肋游仆虫组织蛋白酶B (Euplotes octocarinatus Cathepsin B, EoCTSB)基因的序列、结构和功能,本研究利用生物信息学方法,对八肋游仆虫组织蛋白酶B基因进行了系统分析。利用相似性搜索及系统进化分析,共鉴定得到6个EoCTSBs基因。转录组数据及3′RACE分析结果表明这6个基因均具有转录活性。通过与其他真核生物的组织蛋白酶B比较,结果显示,6种EoCTSBs均含有保守的肽链内切酶催化活性位点,但都缺失封闭环结构,因此推测它们都没有外肽酶活性;仅EoCTSB-6的S2亚位为酸性氨基酸残基,暗示其具有催化特异性底物Z-Arg-Arg-AMC水解的活性。本研究为后续深入探讨EoCTSB的生物学功能提供理论依据。

论文目录

  • 1 结果与分析
  •   1.1 EoCTSB基因的鉴定
  •   1.2 EoCTSB的序列和结构特征分析
  •   1.3 6种EoCTSBs基因均具有转录活性
  • 2 讨论
  • 3 材料与方法
  •   3.1 数据来源
  •   3.2 EoCTSBs基因的鉴定
  •   3.3 生物信息学分析
  •   3.4 八肋游仆虫总RNA的提取与Eo CTSBs基因c DNA的3′端序列的扩增
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 刘婧妮,宋建英,王软林,梁爱华

    关键词: 八肋游仆虫,组织蛋白酶,序列分析

    来源: 基因组学与应用生物学 2019年08期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,医药卫生科技

    专业: 生物学

    单位: 山西大学生物技术研究所,化学生物学与分子工程教育部重点实验室

    基金: 国家自然科学基金项目(31372199)资助

    分类号: Q78

    DOI: 10.13417/j.gab.038.003428

    页码: 3428-3435

    总页数: 8

    文件大小: 2531K

    下载量: 39

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