基于高通量测序的南泥湾湿地土壤细菌多样性分析

基于高通量测序的南泥湾湿地土壤细菌多样性分析

论文摘要

为研究南泥湾湿地细菌群落类群结构,本研究利用Illumina高通量测序技术,对土壤样品中细菌的16S rRNA基因进行测序分析。各样地共检测到细菌类群27门、106纲、163目、306科、534属,主要的优势菌门为变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、绿弯菌门(Chloroflexi)和酸杆菌门(Acidobacteria),主要的优势菌纲为α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)、β-变形菌纲(Betaproteobacteria)和γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria)。不同退化湿地土壤细菌的数量和种类各不相同。随着退化程度加深,土壤细菌群落多样性降低,南泥湾湿地土壤细菌菌种多样性在不同退化阶段的差异较大。通过典型对应分析发现,土壤p H值、有机质和全钾对南泥湾湿地土壤细菌分布影响较大。人为开垦活动会降低土壤微生物多样性,退耕还湿措施对湿地微生物群落结构有影响。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 研究区概况
  •   1.2 试验设计和样品采集
  •   1.3 测定方法
  •   1.4 试验上机流程
  •   1.5 数据分析
  • 2 结果
  •   2.1 细菌群落组成分析
  •   2.2 细菌群落的多样性分析
  •   2.3 细菌群落的相关性分析
  •   2.4 土壤理化因子与土壤细菌群落特征的相关性
  • 3 讨论
  • 4 结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 邵颖,曹四平,刘长海,罗梦娇

    关键词: 湿地退化,细菌,多样性,高通量测序

    来源: 干旱区资源与环境 2019年02期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,农业科技

    专业: 生物学,农业基础科学,农艺学

    单位: 延安大学生命科学学院

    基金: 国家自然科学基金项目(31370541),",十三五",国家重点研发计划项目(No.2016YFC0501705)资助

    分类号: S154.3

    DOI: 10.13448/j.cnki.jalre.2019.057

    页码: 158-163

    总页数: 6

    文件大小: 1387K

    下载量: 1054

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