羚牛苦味受体3(Tas2R3)基因的克隆及生物信息学分析

羚牛苦味受体3(Tas2R3)基因的克隆及生物信息学分析

论文摘要

Tas2R3是苦味受体基因家族中一个重要的成员,为了进一步了解和研究羚牛(Budorcas taxicolor)苦味受体基因的结构和功能,本研究对羚牛苦味受体3 (Tas2R3)基因进行了克隆和生物信息学分析(GenBank登录号:MG650195)。结果显示,羚牛Tas2R3基因编码区(coding sequence, CDS)序列全长951 bp,共编码316个氨基酸,以亮氨酸含量最高,谷氨酰胺含量最低。其蛋白质等电点为9.68,分子量为51.96 kD。高级结构功能预测显示,二级结构以α-螺旋为主,蛋白质为碱性、稳定的亲水性蛋白,由4个胞外区、7个跨膜区和4个胞内区组成。预测到2种类型共8个糖基化功能位点和4种类型共15个磷酸化功能位点。通过比较Tas2R3基因种间相似性发现,在偶蹄目中具有很高的同源性,羚牛与绵羊(Ovis aries)的相似性最高(0.98),与褐家鼠(Rattus norvegicus)最低(0.52)。用羚牛、绵羊等12个物种的Tas2R3基因CDS序列构建的NJ树与ME树结构一致,表明Tas2R3基因适合用于构建不同物种间的系统进化树。

论文目录

  • 1 结果与分析
  •   1.1 羚牛Tas2R3基因编码区开放阅读框分析
  •   1.2 羚牛Tas2R3基因序列同源性及分子进化分析
  •   1.3 羚牛Tas2R3基因编码区蛋白结构分析
  •     1.3.1 理化性质分析
  •     1.3.2 羚牛Tas2R3蛋白二级结构的预测
  •     1.3.3 羚牛Tas2R3蛋白跨膜区结构的预测
  •     1.3.4 羚牛Tas2R3蛋白磷酸化位点和糖基化位点的预测
  • 2 讨论
  • 3 材料与方法
  •   3.1 羚牛基因组总DNA的提取
  •   3.2 引物设计与合成
  •   3.3 Tas2R3基因的PCR扩增
  •   3.4 PCR产物克隆及序列测序
  •   3.5 Tas2R3基因的生物信息学分析
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 周明,余姣姣,李彪,欧阳菠,杨建东

    关键词: 羚牛,苦味受体,基因,克隆,生物信息学分析

    来源: 基因组学与应用生物学 2019年05期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,医药卫生科技

    专业: 生物学

    单位: 四川农业大学动物科技学院

    基金: 四川省教育局创新研究小组计划项目(No.14TD0002)资助

    分类号: Q78

    DOI: 10.13417/j.gab.038.001957

    页码: 1957-1968

    总页数: 12

    文件大小: 2065K

    下载量: 92

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