CRISPR辅助改造谷氨酸棒杆菌合成L-鸟氨酸

CRISPR辅助改造谷氨酸棒杆菌合成L-鸟氨酸

论文摘要

L-鸟氨酸(L-Ornithine)是尿素循环途径中的中间代谢产物,具有多种关键生理生化功能,在食品,医药和保健品领域具有广泛的市场需求。谷氨酸棒状杆菌SNK118(Corynebacterium glutamicum SNK118)是一株L-精氨酸工业生产菌株,本课题组已对其进行了全基因组重测序获得其DNA序列。本论文基于CRISPR-Cpf1系统的基因敲除和基于质粒的异源基因重组表达,对C.glutamicum SNK118进行系统工程改造用于高产L-鸟氨酸。本论文提供了一种有应用前景的高产L-鸟氨酸生产菌株和一种增强谷氨酸棒杆菌中辅因子NADPH的有效方法。(1)为切断鸟氨酸转化为瓜氨酸,并解除全局反馈阻遏调控的干扰,将SNK118基因组上的编码鸟氨酸氨甲酰基转移酶的基因argF和与其相邻的编码精氨酸阻遏物的基因argR同时敲除,获得菌株KBJ01。在500-mL摇瓶发酵84 h后,KBJ01菌株的L-鸟氨酸产量为28.24 g·L?1,是对照株JML04(SNK118ΔargR)的46倍(0.62 g·L?1)。(2)为增强L-鸟氨酸合成途径中的所需关键辅酶NADPH的供给,将糖丁基梭菌(Clostridium saccharobutylicum DSM 13864)来源的gapC(编码NADP+依赖型的三磷酸甘油醛脱氢酶)和枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis HB-1)来源的rocG(编码NADH依赖型的谷氨酸脱氢酶)引入菌株KBJ01中,分别构建KBJ05(KBJ01/pXMJ19-CsgapC)和KBJ06(KBJ01/pXMJ19-BsrocG)。摇瓶发酵84 h后,重组菌KBJ05和KBJ06的L-鸟氨酸产量分别为34.75 g·L?1和32.93 g·L?1,比对照菌株KBJ02(KBJ01/pXMJ19)(26.98g·L?1)分别提高28.8%和22.1%,而糖酸转化率分别达到0.274 g·g-1和0.271 g·g-1,较KBJ02(0.237 g·g-1)分别提高了15.61和14.35%。(3)为缓解分支途径对丙酮酸的竞争,在KBJ01中敲除编码支链氨基酸通透酶的基因ncgl2228以抑制支链氨基酸的过量合成,得到突变株KBJ07,在500-mL摇瓶发酵84 h后,L-鸟氨酸产量增加至30.46 g·L?1,糖酸转化率达到0.26 g·g-1。(4)以上结果显示基因过表达和敲除对L-鸟氨酸产量的积极影响,为此综合上述两个策略,构建重组菌株KBJ09(KBJ07/pXMJ19-CsgapC),KBJ10(KBJ07/pXMJ19-BsrocG)和KBJ11(KBJ07/pXMJ19-CsgapC-BsrocG)。在500-mL摇瓶发酵84 h后,菌株KBJ11的L-鸟氨酸产量最高,达35.85 g·L?1,糖酸转化率可达0.28 g·g-1。与对照菌株KBJ08(KBJ07/pXMJ19)的产量(30.34 g·L?1)相比,提高了18.16%。与菌株KBJ01相比,KBJ11产量提高了27%。(5)为进一步研究菌株KBJ11的性能,对其进行补料分批发酵。在5-L发酵中罐发酵80 h可产L-鸟氨酸60.01 g·L?1。10-L罐补料分批发酵,L-鸟氨酸产量达到88.26g·L?1,糖酸转化率达到0.41 g·g-1,其中生产强度为1.23 g·L?1·h-1(经过72 h)。本研究成果达到了鸟氨酸产量的领先水平。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 第一章 绪论
  •   1.1 L-鸟氨酸的概述
  •     1.1.1 L-鸟氨酸的理化性质
  •     1.1.2 L-鸟氨酸的生理功能及应用
  •     1.1.3 L-鸟氨酸的生产方法
  •   1.2 谷氨酸棒状杆菌合成L-鸟氨酸的概述
  •     1.2.1 谷氨酸棒状杆菌的简介
  •     1.2.2 谷氨酸棒状杆菌中L-鸟氨酸的代谢合成途径
  •     1.2.3 谷氨酸棒状杆菌合成L-鸟氨酸的代谢调控机制
  •     1.2.4 代谢工程育种
  •   1.3 本课题的来源、意义和研究内容
  •     1.3.1 本课题的来源
  •     1.3.2 本课题研究的背景与意义
  •     1.3.3 本课题研究的主要内容
  • 第二章 材料和方法
  •   2.1 实验材料
  •     2.1.1 菌株和质粒
  •     2.1.2 实验所用引物
  •     2.1.3 实验试剂和仪器设备
  •     2.1.4 培养基和相关试剂的配置
  •   2.2 实验方法
  •     2.2.1 CRISPR-Cpf1 系统基因敲除质粒的构建
  •     2.2.2 基因敲除菌株的构建
  •     2.2.3 重组表达质粒的构建
  •     2.2.4 异源基因表达重组菌株的构建
  •     2.2.5 谷氨酸棒状杆菌的摇瓶发酵
  •     2.2.6 谷氨酸棒状杆菌的5-L罐补料分批发酵
  •     2.2.7 菌体生长浓度、葡萄糖含量、L-鸟氨酸产量及支链氨基酸浓度等发酵参数的测定
  •     2.2.8 3-磷酸甘油醛脱氢酶、谷氨酸脱氢酶的活力的测定
  • 第三章 结果与讨论
  •   3.1 谷氨酸棒状杆菌SNK118 的改造
  •     3.1.1 基因敲除菌株的构建
  •     3.1.2 异源基因重组表达菌株的构建
  •     3.1.3 高产L-鸟氨酸谷氨酸棒杆菌重组菌株的构建
  •   3.2 基因敲除对谷氨酸棒杆菌SNK118产L-鸟氨酸的影响
  •     3.2.1 argF、argR敲除对菌株合成L-鸟氨酸的影响
  •     3.2.2 ncgl2228 的敲除对菌株KBJ01 合成L-鸟氨酸的影响
  •   3.3 异源基因表达对谷氨酸棒杆菌发酵产L-鸟氨酸的影响
  •     3.3.1 CsgapC的重组表达对菌株合成L-鸟氨酸的影响
  •     3.3.2 BsrocG的重组表达对菌株合成L-鸟氨酸的影响
  •   3.4 高产L-鸟氨酸谷氨酸棒状杆菌重组菌的发酵研究
  • 主要结论和展望
  •   主要结论
  •   工作展望
  • 参考文献
  • 致谢
  • 附录 A:本文所用的标准曲线
  • 附录 B:作者在攻读硕士期间发表的论文
  • 文章来源

    类型: 硕士论文

    作者: 阚宝军

    导师: 倪晔

    关键词: 谷氨酸棒状杆菌,鸟氨酸,磷酸甘油醛脱氢酶

    来源: 江南大学

    年度: 2019

    分类: 基础科学,工程科技Ⅰ辑

    专业: 生物学,生物学,一般化学工业

    单位: 江南大学

    基金: 国家自然科学基金项目(31601463),国家轻工业技术与工程一流学科项目(LITE2018-07),高校学科人才引进计划(111-2-06)

    分类号: Q78;TQ922

    总页数: 63

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