论文摘要
【目的】蔗糖合成酶（SUS）是植物进行蔗糖代谢的关键酶之一,控制着植物体内糖分的合成和运输,在植物的生长发育和代谢活动中具有重要作用。【方法】本研究利用玉米基因组数据库平台,以生物信息学手段对玉米SUS基因家族进行成员鉴定和分析。【结果】①玉米SUS家族共有5个成员,它们分别分布在第1.4.9号染色体上。氨基酸大小为802～849 aa,除ZmSUS5为弱碱性以外,其余均表现为弱酸性。②基因二级结构分析显示,该家族蛋白主要结构为a-螺旋,大部分为不稳定蛋白,且具有弱疏水性。③亚细胞定位预测结果显示,ZmSUS蛋白均定位在叶绿体。④进化分析显示ZmSUS可分为3个亚家族（SUSⅠ～SUSⅢ）,且位于同一组的成员其氨基酸序列一致性以及内含子/外显子分布模式相似度都很高。⑤基因启动子分析分析显示ZmSUS家族蛋白在玉米的生长发育以及逆境胁迫方面都起着重要的作用。⑥组织表达特异性分析发现,ZmSUS1和ZmSUS2在胚和胚乳中大量表达;ZmSUS5在所有被检测的组织中表达量很低;ZmSUS3及ZmSUS4在被检测的组织中均有较高的表达量。【结论】这些结果表明ZmSUS1和ZmSUS2可能参与了种子的发育过程,ZmSUS3、ZmSUS4可能参与玉米生长发育的多个阶段。本研究为后续对玉米SUS家族基因的功能研究以及对蔗糖代谢调控的应用提供了理论参考。
论文目录
文章来源
类型: 期刊论文
作者: 陈曙,赵秋芳,陈宏良,金辉
关键词: 玉米,基因家族,生物信息学分析,系统进化分析,表达分析
来源: 西南农业学报 2019年11期
年度: 2019
分类: 农业科技
专业: 农作物
单位: 中国热带农业科学院南亚热带作物研究所,农业部热带果树生物学重点实验室
基金: 中央级非盈利性科研院所基本科研业务“糯玉米种质资源的收集,评价及自交系的选育”(1630062017015),农业部国际交流与合作项目“‘一带一路’沿线国家热带农业资源联合调查与开发评价”(13232697606221573):热带玉米种质资源联合调查与评价
分类号: S513
DOI: 10.16213/j.cnki.scjas.2019.11.001
页码: 2479-2485
总页数: 7
文件大小: 521K
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