AVMCD:基于16S rRNA测序的微生物群落多样性分析与可视化平台

论文摘要

传统的技术手段已逐渐难以适应现代生物技术的发展,随着以16S rRNA为代表的第二代高通量测序技术飞速发展,微生物群落多样性研究已进入分子时代,但要分析庞大的测序数据并从中找寻存在的关联还是给生物学家带来诸多现实困难.为帮助研究者更快更好地掌握微生物群落多样性的信息,开发了AVMCD(analysis and visualization of microbial community datasets)生物信息平台,提供基于16S rRNA测序的专业在线分析及可视化服务.AVMCD坚持友好快捷的交互方式,注册用户只需上传待分析的数据,根据提示简单设置参数,即可由平台自动展开专业的序列分析,并将结果以丰富的可视化形式呈现给用户.

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类型: 期刊论文

作者: 艾海新,黄良超,张力,齐梦园,尹子墨,吴雪巍,陈稳,刘宏生

关键词: 测序,微生物群落,多样性分析,数据可视化

来源: 辽宁大学学报(自然科学版) 2019年02期

年度: 2019

分类: 基础科学

专业: 生物学

单位: 辽宁大学生命科学院,辽宁省生物大分子计算模拟与信息处理工程技术研究中心,辽宁省药物分子模拟与设计工程实验室,辽宁大学信息学院

基金: 沈阳市科技局应用基础研究基金(F16205151)

分类号: Q938

DOI: 10.16197/j.cnki.lnunse.2019.02.009

页码: 156-161

总页数: 6

文件大小: 1092K

下载量: 114

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标签：测序论文;  微生物群落论文;  多样性分析论文;  数据可视化论文;