基于表位设计疫苗论文_罗建华,夏雪霏,姚文兵,田浤

导读:本文包含了基于表位设计疫苗论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:疫苗,蛋白,细胞,免疫,多肽,链球菌,大肠杆菌。

基于表位设计疫苗论文文献综述

罗建华,夏雪霏,姚文兵,田浤^[1]（2019）在《硝基化通用T细胞表位疫苗CD47-NitraTh的设计与抑瘤活性》一文中研究指出利用遗传密码扩充技术,将免疫原性氨基酸对硝基苯丙氨酸定点引入到通用T细胞表位,并将其与免疫检查点分子CD47分子胞外区19-140片段融合表达,构建了靶向免疫检查点CD47的疫苗CD47-NitraTh。CD47-NitraTh能够在BALB/c小鼠体内诱导产生高滴度抗体,并可显着抑制CT26结肠癌肿瘤生长,提高脾脏CD4~+T细胞和CD8~+T细胞的比例,同时可促进na?ve T细胞向Th1细胞极化。值得关注的是,CD47-NitraTh不仅提高了肿瘤浸润淋巴细胞的比例,同时还降低了肿瘤组织中Treg细胞比例,意味着CD47-NitraTh疫苗能够重塑肿瘤免疫抑制性微环境。本研究结果提示,CD47-NitraTh可以作为有效的肿瘤疫苗候选分子。(本文来源于《中国药科大学学报》期刊2019年05期）

孔里程,王兆飞,孙建和^[2]（2019）在《猪链球菌保护性抗原表位串联亚单位疫苗设计及小鼠免疫保护效力分析》一文中研究指出为了筛选和鉴定猪链球菌3个保护性抗原GAPDH、MRP、DLDH的优势B细胞抗原表位,设计表位串联方案,研究重组串联表位蛋白(简称GMD蛋白)免疫小鼠后对猪链球菌攻击的免疫保护效力。采用生物信息学分析工具对优势B细胞抗原表位进行筛选,并将表位串联并构建重组质粒pET28a-GMD,诱导表达且纯化后将GMD蛋白配合弗氏佐剂免疫BALB/c小鼠,并评价该蛋白对2型猪链球菌的免疫保护效力。发现经SDS-PAGE鉴定该重组蛋白大小为43.3 kDa;小鼠免疫保护实验结果显示,免疫小鼠血清中针对猪链球菌HA9801菌株抗体效价最高可达1∶102 400,GMD蛋白对小鼠的免疫保护率可达90%。上述结果表明面对猪链球菌HA9801菌株的攻击,GMD蛋白可以为机体提供良好的免疫保护,本研究结果为猪链球菌新型表位亚单位疫苗的研制提供了基础数据。(本文来源于《上海交通大学学报(农业科学版)》期刊2019年03期）

伍娜娜,荣娜,康超,刘祥,陈琛^[3]（2019）在《大肠杆菌免疫蛋白OmpA生物信息学分析及表位多肽疫苗设计》一文中研究指出为进一步提高大肠杆菌外膜蛋白(OmpA)的免疫效果,对大肠杆菌的OmpA进行生物信息学分析并设计其表位多肽重组疫苗。运用DNAMAN 8.0和MEGA 5.0分别对OmpA进行同源性及系统发生分析,通过ExPASy-ProtParam对OmpA的理化性质进行分析,分别采用Signal P 4.1与TMHMM Serverv.2.0对OmpA进行信号肽和跨膜结构预测,应用SOPMA和SWISS-MODEL对OmpA进行二级结构和叁级结构预测,通过String进行蛋白质互作网络分析,使用BepiPred 1.0和ABCpred方法预测OmpA的B细胞抗原表位,利用神经网络法与MHC-Ⅱ类分子结合肽在线预测程序预测OmpA的CTL和Th细胞抗原表位,采用DNASTAR.Lasergene.v 7.1拼接获得优势抗原表位。进化关系结果显示,OmpA在肠道菌属间遗传进化关系较近,OmpA抗体可能为不同种肠道细菌的感染提供交叉免疫保护。OmpA为亲水性蛋白质,第1—21位氨基酸为信号肽位置,具跨膜结构。OmpA的二级结构中以无规则卷曲(45.66%)、α-螺旋(31.79%)、β-片层(16.18%)和β-转角(6.36%)为主,其叁级结构为桶状结构。OmpA与par、coa蛋白之间存在互作。OmpA可能有4个B细胞抗原表位,1个CTL细胞抗原表位,1个Th细胞抗原表位,且重组获得抗原性较好的OmpA表位多肽。(本文来源于《河南农业科学》期刊2019年06期）

林静,尚翠玲,李小慧,高珂珂,孟佳丽^[4]（2018）在《3种常见致病菌重组表位疫苗设计及重组腺病毒载体的构建》一文中研究指出选取金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)的Ebps和ClfA、大肠杆菌(Escherichia coli)的OmpA和OmpC、无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)的SIP和PGK 3种常见致病菌的特异性蛋白。通过分析3种致病菌的B/T细胞优势蛋白表位并预测和评价其抗原性,设计合成叁联重组表位序列(TRE)。应用腺病毒Ad-Max系统将合成后的重组表位序列连接到穿梭载体pDC315-MCS-EGFP上,与腺病毒大骨架pBHGloxE1、3Cre共转染HEK293细胞,1周后观察到转染细胞出现绿色荧光且细胞出现典型的CPE,证明穿梭质粒载体pDC315-MCS-EGFP和腺病毒大骨架pBHGloxE1、3Cre转染成功。RT-PCR、Western blot验证所获得的重组腺病毒Ad-TRE-EGFP,PCR鉴定P4代重组腺病毒,均得到目的条带。说明目的片段在HEK293细胞中稳定有效表达。为下一步3种常见致病菌重组表位疫苗的体内外试验奠定了工作基础。(本文来源于《中国兽医学报》期刊2018年11期）

曹际^[5]（2018）在《拟态弧菌靶向表位基因疫苗的设计、构建及其免疫效果评价》一文中研究指出拟态弧菌(Vibrio mimicus)是一种严重危害水产养殖业发展的肠道病原菌。口服或肛注基因疫苗所激发的肠黏膜免疫在抗该菌感染中发挥重要作用。因此,研制安全、高效的拟态弧菌基因疫苗对于防控鱼类拟态弧菌感染具有重要意义。基因疫苗以安全、易于构建、免疫应答全面且持久等优势受到人们关注。但是,口服或肛注“裸”基因疫苗易受到消化道酶类降解,导致其免疫原性减弱,无法获得高水平的肠黏膜免疫应答,而解决这一问题的关键措施是选用适宜载体将基因疫苗靶向抗原递呈细胞(Antigen Presenting Cell,APC)进行高效表达与递呈。目前,细菌菌蜕(Bacterial Ghosts,BGs)已被证实具有防止基因疫苗降解并将其靶向APC进行表达的作用,而鱼类恒定链类似蛋白(Invariant chain like protein,Iclp)具有将抗原肽靶向MHC分子,提高抗原提呈效率的作用。因此,可利用Iclp与BGs作为基因疫苗的内、外靶向载体,以提高其免疫原性。前期研究中我们鉴定了拟态弧菌两种免疫保护性蛋白(OmpU黏附素蛋白和VMH溶血素蛋白)的免疫优势表位。在此基础上,本论文以OmpU蛋白和VMH蛋白的优势表位设计疫苗靶点,利用Iclp和BGs作为内、外靶向载体,构建拟态弧菌靶向表位基因疫苗并评价其免疫效果。完成的主要研究工作和成果总结如下:1)拟态弧菌基因疫苗靶点的设计。论文使用叁种表位接头分子将VMH蛋白的3个优势B细胞线性表位和2个模拟表位,以及OmpU蛋白的2个优势B细胞线性表位以不同方式进行串联组合,应用DNAstar Protean软件,对各种组合方式的可行性进行分析。结果发现以~(173-192)OmpU-AAY-~(90-98)OmpU-AAY-~(125-137)VMH-AAY-~(238-244)V MH-AAY-~459-47059-470 VMH-GGGGS-~(mimotope1)VMH-GPG-~(mimotope2)VMH方式串联的多表位肽(命名为OVepis)中各表位间相对独立,抗原性参数较好,可以作为疫苗靶点。2)拟态弧菌叁种靶向表位基因疫苗的构建。论文首先采用酶切酶连法构建真核表达重组质粒pcDNA3.1-Ovepis,即裸表位基因疫苗。然后,将OVepis基因嵌合至草鱼Iclp蛋白CLIP区,取代CLIP区261~280 bp基因片段,形成一个长度1 017 bp的嵌合基因(Iclp_(1-261)-OVepis-Iclp_(280-711)),并构建该嵌合基因的真核表达重组质粒pcDNA3.1-Iclp-Ovepis,即内靶向表位基因疫苗。最后,采用膜囊法以大肠杆菌DH5α冻干菌蜕分别装载pcDNA3.1-OVepis和pcDNA3.1-Iclp-OVepis构建外靶向和双靶向表位基因疫苗。测序结果显示OVepis及Iclp-OVepis基因均无任何突变与缺失;荧光定量PCR检测发现每毫克菌蜕可以装载214μg pcDNA3.1-OVepis和166μg pcDNA3.1-Iclp-OVepis。结果表明拟态弧菌叁种靶向表位基因疫苗构建成功。3)拟态弧菌靶向表位基因疫苗的免疫效果评价。论文以叁种靶向表位基因疫苗和“裸”表位基因疫苗分别以肛注方式免疫草鱼,通过检测免疫后不同组织中免疫相关基因的转录表达水平、血清与肠黏液中非特异性免疫因子活性、血清与肠黏液中抗体效价、外周血与肠上皮淋巴细胞的增殖活性以及免疫草鱼的相对免疫保护率,综合评价各疫苗的免疫效果。结果显示,双靶向表位基因疫苗组草鱼的各项免疫指标均优于2个单靶向表位基因疫苗组,2个单靶向表位基因疫苗组草鱼的各项免疫指标均优于“裸”表位基因疫苗组;靶向表位基因疫苗和“裸”表位基因疫苗对免疫草鱼的相对免疫保护率分别为80%(双靶向疫苗)、73.3%(外靶向疫苗)、67.7%(内靶向疫苗)和40%(“裸”表位基因疫苗)。综上所述,本研究成功构建了拟态弧菌靶向表位基因疫苗和“裸”表位基因疫苗,其免疫效果由好至差依次为双靶向表位基因疫苗、外靶向表位基因疫苗、内靶向表位基因疫苗、“裸”表位基因疫苗。(本文来源于《安徽农业大学》期刊2018-05-01）

梁忠祥^[6]（2017）在《小反刍兽疫多表位疫苗抗原的设计及其免疫效力评价》一文中研究指出小反刍兽疫病毒(PPRV)属于麻疹病毒属(Morbillivirus),是引起山羊和绵羊等小反刍动物急性传染病的病原,该病特点是高发病率和高死亡率,被世界动物卫生组织(OIE)列为法定报告动物传染病,我国将其列为I类动物疫病。最初,PPRV仅在山羊和绵羊上有报道,但近几年病毒种间传播的病例被不断出现。尽管该病毒只有一个血清型,但有四个基因型(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ),具有区域性分布的特点,目前该病主要分布于非洲和亚洲,正威胁欧洲。HN和F蛋白是镶嵌在病毒囊膜上的糖蛋白,HN蛋白能够与淋巴细胞上的SLAM受体相互作用介导病毒入侵,这可能是导致机体免疫抑制的主要原因。在病毒侵入过程中,F蛋白能够起到融合细胞膜和病毒囊膜的作用。另外,PPRV能引起机体强烈的细胞免疫和体液免疫应答,而HN和F蛋白则是主要的保护性抗原。本研究希望筛选出HN和F蛋白的B细胞抗原表位,进而设计小反刍兽疫多表位疫苗候选抗原。利用本实验室构建的pET21a-rPPRV-HN-F质粒,经过转化、诱导表达和纯化获得了rPPRV-HN-F蛋白;经过反应原性检测,发现rPPRV-HN-F蛋白与羊源PPRV阳性血清具有明显的反应原性,用该蛋白制备了与PPRV具有良好反应原性的单克隆抗体和多克隆抗体。同时,提取了PPRVVeroE6细胞毒培养基中的糖蛋白(PPRV-Glycoprotein),制备了小鼠多克隆抗体,经过反应原性和特异性检测发现效果良好。对China/Tib/07株和Nigeria 75/1毒株HN蛋白与羊SLAM受体复合物结构进行模拟,确定了相互作用的关键氨基酸。结合模拟的结构,利用免疫信息学工具对HN和F蛋白的B细胞表位进行了预测。将人工合成的表位肽包被在氨基化酶标板上,用间接ELISA方法检测了表位肽与PPRV特异性抗体的反应原性,发现了一批共11条具有反应原性的表位肽。将筛选的具有反应原性的部分表位肽串联,经过生物合成获得了一定纯度的多表位抗原。免疫小鼠检测了抗体水平和T淋巴细胞增殖情况,发现多表位抗原能使小鼠产生特异性的抗体。流式细胞术检测发现CD3~+CD4~+T淋巴细胞和CD3~+CD8~+T淋巴细胞有不同程度的升高,尤其是CD3~+CD8~+T淋巴细胞。本研究为小反刍兽疫表位疫苗研制奠定基础,对小反刍兽疫的预防与控制,甚至对全球消灭计划的实施都具有重大意义。(本文来源于《中国农业科学院》期刊2017-05-01）

李少华,唐康,张春梅,金伯泉,马樱^[7]（2017）在《联合T、B细胞表位设计多肽疫苗的研究进展》一文中研究指出从Adam等~([1])发现针对口蹄疫病毒的多肽疫苗,到Lerner~([2])建立多肽疫苗合成的方法,再到联合T、B细胞表位多肽疫苗设计的出现,新型疫苗的研制快速发展。联合T、B细胞多肽表位是指将已证实或预测得到具有免疫原性的T、B细胞多肽表位通过生物、化学方法连接,或同时串联通用CD4+T细胞表位以增(本文来源于《中国免疫学杂志》期刊2017年01期）

刘祥,孔智翔,殷书平,殴莎莎,刘成艳^[8]（2016）在《奶牛乳房炎重要候选疫苗蛋白的抗原表位分析及叁联重组表位疫苗的氨基酸序列设计》一文中研究指出为设计奶牛乳房炎叁联重组表位多肽疫苗,选取奶牛乳房炎3种主要感染菌的候选疫苗蛋白:金黄色葡萄球菌的Ebps与Clf A,大肠埃希菌的Omp A与Omp C,链球菌的SIP与PGK,通过ABCpred和Bepi Pred方案,预测获得每种蛋白各有2个优势B细胞表位;利用神经网络与量化矩阵法预测蛋白的CTL表位。结果显示,SIP蛋白无CTL表位,其余蛋白均存在1个CTL细胞表位;采用MHC-Ⅱ类分子结合肽在线程序预测蛋白的Th表位,结果发现每种蛋白各有1个Th细胞表位。使用DNASTAR软件分析6个蛋白的二级结构,结果发现,预测获得的B/T细胞表位大多处于蛋白易于产生表位的暴露表面、无规则卷曲与转角等位置。再通过Protean程序重组拼接获得的B/T细胞抗原表位,最终设计获得抗原性较好的叁联表位疫苗氨基酸序列。为新型奶牛乳房炎叁联表位疫苗的研制奠定基础。(本文来源于《浙江农业学报》期刊2016年09期）

孔智翔,刘祥,殴莎莎,刘成艳,同韩虎^[9]（2016）在《奶牛乳房炎链球菌GapC蛋白的生物信息学分析与重组表位疫苗设计》一文中研究指出为设计奶牛乳房炎链球菌GapC蛋白的多表位串联疫苗,进一步提高GapC蛋白的免疫效果,采用DNAMAN、MEGA软件分析GapC的同源性与系统发生,结果显示,不同种类链球菌亲缘关系均较近,尤其是与奶牛乳房炎有关的链球菌亲缘关系更近。利用在线软件预测GapC为亲水性蛋白,存在多个酶切位点;采用Signal P 4.1与TMHMM Server v.2.0软件预测GapC无信号肽和跨膜结构,定位于细胞表面;SOPMA服务器预测GapC二级结构中含无规则卷曲30.36%,α-螺旋33.93%,β-转角12.50%,β-片层23.21%。采用Swiss-Model预测的GapC叁级结构与二级结构相符。利用ABCpred和Bepi Pred方案,预测GapC存在5个B细胞表位。运用神经网络与量化矩阵法预测GapC具有1个CTL表位。使用MHC-Ⅱ类分子结合肽在线程序预测显示GapC具有1个Th表位。采用DNASTAR Protean软件重组GapC抗原表位,设计获得抗原性较好的GapC重组表位多肽。(本文来源于《江苏农业学报》期刊2016年04期）

刘祥^[10]（2016）在《福氏志贺菌2a型外膜蛋白A的生物信息学分析与重组表位疫苗分子的设计》一文中研究指出福氏志贺菌外膜蛋白OmpA(outer membrane protein A)具有较强的免疫原性,在疫苗上有应用前景。采用MEGA(molecular evolutionary genetics analysis)软件对OmpA的系统发生分析显示,福氏志贺菌与肠道细菌间亲缘关系较其它菌属更近。利用在线软件预测OmpA为亲水的分泌型蛋白,存在多个酶切位点;采用TMHMM(transmembrane hidden markov models)Server v.2.0程序预测OmpA无跨膜结构并定位于细胞膜外;SOPMA(self-optimized prediction method with alignment)服务器预测OmpA二级结构中含无规则卷曲41.09%,α-螺旋26.44%,β-转角10.06%,β-片层22.41%。通过Signal P 4.1软件分析显示,OmpA的1~21位氨基酸为信号肽序列。采用SwissModel程序预测的叁维模型显示OmpA为桶装结构。利用ABCpred(artificial neural network based B-cell epitope prediction)和Bepi Pred(B-cell epitopes prediction)方案,预测OmpA存在3个B细胞表位。运用神经网络与量化矩阵法预测OmpA具有1个CTL表位。使用MHC-Ⅱ类分子结合肽在线程序预测显示OmpA具有1个Th表位。设计获得抗原性较好的OmpA蛋白重组表位多肽。为OmpA多表位串联疫苗的研究奠定基础。(本文来源于《生物学杂志》期刊2016年03期）

基于表位设计疫苗论文开题报告

（1）论文研究背景及目的

此处内容要求：

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例：

为了筛选和鉴定猪链球菌3个保护性抗原GAPDH、MRP、DLDH的优势B细胞抗原表位,设计表位串联方案,研究重组串联表位蛋白(简称GMD蛋白)免疫小鼠后对猪链球菌攻击的免疫保护效力。采用生物信息学分析工具对优势B细胞抗原表位进行筛选,并将表位串联并构建重组质粒pET28a-GMD,诱导表达且纯化后将GMD蛋白配合弗氏佐剂免疫BALB/c小鼠,并评价该蛋白对2型猪链球菌的免疫保护效力。发现经SDS-PAGE鉴定该重组蛋白大小为43.3 kDa;小鼠免疫保护实验结果显示,免疫小鼠血清中针对猪链球菌HA9801菌株抗体效价最高可达1∶102 400,GMD蛋白对小鼠的免疫保护率可达90%。上述结果表明面对猪链球菌HA9801菌株的攻击,GMD蛋白可以为机体提供良好的免疫保护,本研究结果为猪链球菌新型表位亚单位疫苗的研制提供了基础数据。

（2）本文研究方法

调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

基于表位设计疫苗论文参考文献

[1].罗建华,夏雪霏,姚文兵,田浤.硝基化通用T细胞表位疫苗CD47-NitraTh的设计与抑瘤活性[J].中国药科大学学报.2019

[2].孔里程,王兆飞,孙建和.猪链球菌保护性抗原表位串联亚单位疫苗设计及小鼠免疫保护效力分析[J].上海交通大学学报(农业科学版).2019

[3].伍娜娜,荣娜,康超,刘祥,陈琛.大肠杆菌免疫蛋白OmpA生物信息学分析及表位多肽疫苗设计[J].河南农业科学.2019

[4].林静,尚翠玲,李小慧,高珂珂,孟佳丽.3种常见致病菌重组表位疫苗设计及重组腺病毒载体的构建[J].中国兽医学报.2018

[5].曹际.拟态弧菌靶向表位基因疫苗的设计、构建及其免疫效果评价[D].安徽农业大学.2018

[6].梁忠祥.小反刍兽疫多表位疫苗抗原的设计及其免疫效力评价[D].中国农业科学院.2017

[7].李少华,唐康,张春梅,金伯泉,马樱.联合T、B细胞表位设计多肽疫苗的研究进展[J].中国免疫学杂志.2017

[8].刘祥,孔智翔,殷书平,殴莎莎,刘成艳.奶牛乳房炎重要候选疫苗蛋白的抗原表位分析及叁联重组表位疫苗的氨基酸序列设计[J].浙江农业学报.2016

[9].孔智翔,刘祥,殴莎莎,刘成艳,同韩虎.奶牛乳房炎链球菌GapC蛋白的生物信息学分析与重组表位疫苗设计[J].江苏农业学报.2016

[10].刘祥.福氏志贺菌2a型外膜蛋白A的生物信息学分析与重组表位疫苗分子的设计[J].生物学杂志.2016

论文知识图

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