蛋白质磷酸化论文_陈重阳,李影超,余海涛,任晓虎,许本洪

导读:本文包含了蛋白质磷酸化论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:磷酸化,蛋白质,酪氨酸,电泳,肝癌,水稻,双向。

蛋白质磷酸化论文文献综述

陈重阳,李影超,余海涛,任晓虎,许本洪[1](2019)在《低剂量铜暴露改变阿尔茨海默病模型小鼠的海马磷酸化蛋白质谱并扰乱其线粒体功能》一文中研究指出目的阿尔兹海默病(Alzheimer′sdisease,AD)是一种进行性发展的神经系统退行性疾病。过量的铜会导致神经毒性并导致某些神经系统疾病的发展;然而,铜的神经毒性和潜在的机制仍然知之甚少。本文旨在应用磷酸化蛋白质组学技术,初步探讨低剂量铜暴露对AD模型小鼠海马磷蛋白组和线粒体功能的影响,筛选其毒性相关关键分子并分析其潜在的联系。材料叁转基因AD模型小鼠,氯化铜,蛋白质组学试剂。方法选用6月龄叁转基因AD(3xTg-AD)模型小鼠和6月龄的野生型(Wide-type,WT)小鼠,均用0.13ppm氯化铜的饮用水喂养,同时以未暴露铜的3xTg-AD和WT小鼠作为对照组。2个月后,首先应用qPCR、免疫荧光、过氧化氢产量(H_2O_2)、脂质氧化水平(MDA)、细胞色素C氧化酶活性和ATP含量等方法,检测铜暴露对WT小鼠和3xTg-AD小鼠海马组织线粒体功能的损伤;随之利用银染的方法检测铜暴露对3xTg-AD小鼠海马神经元轴突退化的影响;最后采用Q Exactive质谱分析蛋白组学变化,并使用Western blot验证。结果 QPCR、线粒体功能检测和Western blot结果表明,与未暴露WT小鼠相比,低剂量铜暴露降低了WT小鼠海马线粒体DNA拷贝数,线粒体生物发生和扰乱了线粒体动力学,这些变化与H_2O_2产生增加、细胞色素氧化酶活性降低和ATP含量降低有关。磷蛋白组学鉴定了来自1406个磷蛋白的总共3960个独特的磷酸肽(5290个磷酸化位点);铜暴露的WT小鼠与未暴露铜WT小鼠相比有41个差异表达的磷蛋白;铜暴露的3xTg-AD小鼠与未暴露铜3xTg-AD小鼠相比有162个差异表达的磷蛋白;差异表达的磷蛋白涉及神经元和突触功能,转录调节,能量代谢和线粒体功能。此外,银染实验结果显示,与未暴露3xTg-AD小鼠相比,铜暴露加剧了3xTg-AD小鼠海马神经元轴突的变性,这与Camk2α中T286磷酸化的改变和丝裂原活化蛋白激酶(ERK1/2)的磷酸化有关,其涉及长时程增强(LTP)信号。线粒体功能障碍主要与糖原合成酶激酶-3β(GSK3β)和丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶2B催化亚基α同种型(Ppp3ca)的磷酸化水平的变化有关,其涉及线粒体生物发生信号传导。结论低剂量铜暴露可改变参与线粒体、突触和轴突完整性的关键海马蛋白的磷酸化。这些数据表明,铜过量加速了AD早期观察到的一些事件,表明循环铜过量可能干扰野生型小鼠的大脑功能,并加剧AD小鼠模型的神经退行性改变。(本文来源于《中国毒理学会第九次全国毒理学大会论文集》期刊2019-09-17)

余红,严建立,裘劼人,王淑珍,忻雅[2](2019)在《草莓响应炭疽菌侵染的差异磷酸化蛋白质组学分析》一文中研究指出以不同炭疽病抗性的草莓品种‘红颊’和‘甜查理’的茎组织为试验材料,采用非标记定量磷酸化蛋白质组学技术分析其在炭疽菌侵染胁迫后磷酸化蛋白组的变化。结果表明,‘红颊’和‘甜查理’中分别有154个和173个磷酸化蛋白在病菌侵染后发生了1.5倍以上的差异表达。功能注释归类分析发现,大部分差异磷酸化蛋白参与了大分子复合体形成及结构定位、刺激应答和信号转导等生物学过程。生物信息学分析进一步表明,相对于易感品种‘红颊’,高抗品种‘甜查理’差异磷酸化蛋白特异性表现出S*Y和T*F 2种保守结构域类型,且植物激素信号传导途径和碳固定途径都发生了更高程度的磷酸化。本研究结果揭示出,这些信号通路在防御病菌入侵过程中发挥了重要作用,为后续深入揭示草莓-炭疽病菌互作分子机制及草莓抗病新品种选育奠定了宝贵的理论研究基础。(本文来源于《浙江大学学报(农业与生命科学版)》期刊2019年04期)

聂燕芳,邹小桃,王振中,李云锋[3](2019)在《适合于2-DE分析的水稻质膜磷酸化蛋白质富集方法的建立》一文中研究指出细胞质膜(plasma membrane,PM)作为植物细胞与外界的屏障,在细胞壁的合成、离子转运和细胞信号转导过程等方面起着重要的作用。质膜蛋白质的磷酸化也被证实广泛参与了病原菌的信号识别等反应。开展植物细胞质膜蛋白质磷酸化变化的研究,对于了解植物和病原菌的相互识别和信号跨膜转导等具有重要意义。采用双水相分配法和离心法对水稻叶片的细胞质膜进行了纯化,结果表明由6.3/6.3%(w/w) Dextran T 500/PEG 3350组成的双水相体系可以获得高纯度的质膜微囊,其质膜标志酶VO_(43-)-ATPase的相对活性达93%以上。采用Al (OH)3-MOAC法,对水稻质膜磷酸化蛋白质进行了富集;结果表明质膜磷酸化蛋白质的富集得率为3.46%~4.21%。对质膜磷酸化蛋白质进行了2-DE分析,结果表明同一凝胶的Pro-Q Diamond染色和硝酸银染色的2-DE图谱背景清晰,蛋白质点分布均匀,没有明显的纵向拖尾和水平横纹现象;其中Pro-Q Diamond染色图谱中的蛋白质点数为296个,硝酸银染色图谱中的蛋白质点数为316个;表明该技术体系可以获得高分辨率和高重复性的2-DE图谱。采用PDQuest 8.0图像分析软件对2种染色图谱进行迭加分析,结果表明2种图谱中蛋白质点的吻合度高。上述结果表明,应用双水相分配法和Al(OH)_3-MOAC法,并结合2-DE技术和Pro-Q Diamond磷酸化蛋白质特异性染色技术,建立了高效的水稻叶片质膜磷酸化蛋白质的富集和2-DE分析技术体系。(本文来源于《中国植物病理学会2019年学术年会论文集》期刊2019-07-20)

孙冉冉,聂燕芳,张健,王振中,李云锋[4](2019)在《水杨酸诱导水稻叶片的磷酸化蛋白质组学分析》一文中研究指出水杨酸(Salicylic acid,SA)是一种重要的信号分子,能够诱导水稻的抗病性。蛋白质磷酸化是一种重要的蛋白质翻译后修饰,在植物抗性信号转导途径中起着重要的作用。开展SA诱导的水稻磷酸化蛋白质组变化,对于全面了解SA诱导水稻的抗病性机制具有重要的意义。以抗稻瘟病近等基因系水稻C039 (不含已知抗稻瘟病基因)及C101LAC (含Pi-1抗稻瘟病基因)为材料,用SA喷雾接种水稻,于接种后的12 h和24 h取样。经叶片总蛋白质的提取、磷酸化蛋白质的富集、双向电泳(2-DE)和凝胶染色,获得了不同时间段的磷酸化蛋白质ProQ Diamond特异性染色2-DE图谱和硝酸银染色2-DE图谱。用PDQuest 8.0软件进行图像分析,共获得了47个差异表达的磷酸化蛋白质。采用MALDI-TOF/TOF质谱技术对差异表达的磷酸化蛋白质进行了分析,成功鉴定了其中的40个磷酸化蛋白质点;主要参与光合作用、防卫反应、抗氧化作用、蛋白质合成与降解、氨基酸代谢和能量代谢等功能。(本文来源于《中国植物病理学会2019年学术年会论文集》期刊2019-07-20)

杨燃,宋洪波,黄群,刘丽莉,邱宁[5](2019)在《鸡蛋清磷酸化蛋白质组鉴定与分析》一文中研究指出为了系统地阐明鸡蛋清磷酸化蛋白质的结构和功能特性,本研究采用蛋白质组学策略对鸡蛋清的磷酸化修饰蛋白质组进行鉴定与分析。鸡蛋清酶解产物首先经固定化金属螯合亲和层析分离富集磷酸肽,再经纳升液相色谱-串联质谱分析和鉴定。通过数据库检索匹配,共鉴定出33个特异性磷酸化修饰多肽,包含41个磷酸化修饰位点,归属于25种鸡蛋清磷酸化蛋白。基序分析显示,大多数磷酸化修饰位点的序列特征为"S-X-E";基因本体功能注释分析表明,鸡蛋清磷酸化蛋白质主要参与"生物调节"、"刺激反应"、"发育过程"等生物学过程,主要涉及"结合"、"催化"等分子功能。本研究结果将为鸡蛋清蛋白质相关研究提供关键的磷酸化修饰结构信息。(本文来源于《食品科学》期刊2019年11期)

栾秀丽[6](2019)在《沙眼衣原体假定功能蛋白CT036的定位及磷酸化蛋白质组学分析》一文中研究指出目的沙眼衣原体(Chlamydia trachomatis,Ct)是革兰染色阴性的特殊细菌,感染细胞后能在宿主细胞的胞浆内形成包涵体,并通过包涵体膜从宿主细胞获取营养物质以完成自身的发育周期。CT036蛋白是Ct基因组编码的假定功能蛋白,计算机软件预测显示其可能定位于包涵体膜,但其具体定位及生物学功能还不清楚。本实验采用原核表达载体构建了pET28a-ct036的重组表达质粒,在大肠杆菌中诱导His-CT036重组蛋白的表达并进行纯化,免疫小鼠后制备多克隆抗体,对沙眼衣原体感染宿主细胞后CT036蛋白的表达进行定位;同时,构建了CT036慢病毒载体和对照载体,感染HeLa细胞制备CT036基因稳定过表达细胞系与对照细胞系,并利用磷酸化蛋白质组学技术分析了CT036细胞内表达可能影响的细胞通路及生物学功能;最后采用Western Blot和流式细胞术等对蛋白质组学筛查结果进行了初步验证。该研究为揭示沙眼衣原体CT036蛋白的定位及功能提供了重要的实验数据,也为进一步深入研究沙眼衣原体的致病机制奠定了基础。方法1.依据GenBank中CT036的基因序列设计特异性PCR引物,以Ct D型基因组为模板进行PCR扩增CT036基因。构建表达重组质粒pET28a-ct036,鉴定正确后转化大肠杆菌,使用IPTG诱导表达,用SDS-PAGE和Western blot鉴定,用His-琼脂糖树脂纯化重组蛋白,BCA法检测重组蛋白浓度。2.用纯化的pET28a-ct036重组蛋白免疫BALB/c小鼠,使用间接ELISA法检测免疫鼠的多克隆抗体效价,Western blot检测抗体的特异性。3.Ct D型感染HeLa细胞,以兔抗衣原体菌体及鼠抗CT036蛋白为一抗,间接免疫荧光法检测CT036蛋白在衣原体感染细胞的定位。4.构建CT036慢病毒表达载体,与辅助包装原件载体共同包装慢病毒并测定慢病毒滴度,随后用CT036慢病毒与Flag标签对照慢病毒感染HeLa细胞。Western blotting检测CT036蛋白的表达。5.使用磷酸化iTRAQ相对定量蛋白质组学鉴定CT036-HeLa稳转细胞组与对照组的差异磷酸化蛋白。Motif-x软件对鉴定到的所有磷酸化修饰位点进行保守motif分析;对差异表达磷酸化肽段对应的蛋白进行筛选,使用GO、KEGG等生物信息学工具分析,筛选获得CT036胞内表达主要影响的磷酸化蛋白以及细胞通路和功能并进行体外验证。6.将CT036蛋白稳转细胞与慢病毒感染对照细胞进行Hoechst染色,流式细胞仪检测细胞凋亡情况,WB检测Bax和Bcl-2蛋白表达水平。7.将CT036-HeLa稳转细胞,对照组细胞与PI3K抑制剂处理过的CT036-HeLa稳转细胞经TNF-α(20ng/ml)与CHX(2μg/ml)诱导凋亡6h后,使用Hoechst染色,流式细胞仪检测细胞凋亡情况,WB检测GSK 3β蛋白的磷酸化水平,WB检测Bax和Bcl-2蛋白表达水平。结果1.成功扩增目的基因片段与重组表达质粒载体pET28a-ct036,IPTG诱导表达后His-琼脂糖树脂纯化出高浓度的His-CT036重组蛋白。2.pET28a-ct036重组蛋白免疫BALB/c小鼠,免疫4次后产生高效价抗体,经ELISA与WB检测多克隆抗体能识别His-CT036重组蛋白,且效价≥1:52000。3.IFA结果显示假定功能蛋白CT036在感染细胞中的分布与已知的包涵体膜蛋白IncA的分布一致,表明CT036蛋白定位于衣原体感染细胞的包涵体膜。4.成功构建了CT036慢病毒表达载体,慢病毒包装完成后,测定慢病毒滴度较高,CT036慢病毒与Flag标签对照慢病毒感染HeLa细胞获得了相应的稳定过表达细胞系,倒置荧光显微镜观察有明亮的绿色荧光,Western blot检测有目的条带。5.磷酸化iTRAQ相对定量蛋白质组学鉴定CT036-HeLa稳转细胞组与对照组的差异磷酸化蛋白,共鉴定到磷酸化蛋白质3001个、磷酸化肽段7668个。按照表达倍数变化1.2倍以上且P value<0.05的标准筛选得到388个差异表达磷酸化肽段,对应301个蛋白。对这些蛋白进行GO功能富集,可知CT036蛋白主要参与调控了细胞周期、细胞凋亡、免疫进程、囊泡运输等多种生物学过程。将筛选得到的53个参与调亡过程的蛋白和KEGG通路分析富集到的与凋亡相关的PI3K、mTOR、Chemokine等信号通路的蛋白取交集,结果发现GSK3β参与多条信号通路。WB检测结果显示CT036蛋白内源性表达组与对照组相比GSK3β蛋白磷酸化水平明显上升。6.Hoechst染色结果显示:CT036-HeLa稳转细胞组凋亡率较阳性对照组降低4.27%(P<0.001);流式细胞仪检测结果显示:CT036-HeLa稳转细胞组凋亡率较阳性对照组降低4.58%(P<0.001)。WB检测结果显示CT036-HeLa稳转细胞组与对照组相比Bax表达明显下调,Bcl-2表达明显上调。7.经诱导凋亡处理后,Hoechst染色结果显示:CT036-HeLa稳转细胞组凋亡率较阳性对照组降低21.57%(P<0.0001),较CT036-HeLa稳转细胞的PI3K抑制剂处理组降低23.47%(P<0.0001);流式细胞仪检测结果显示:CT036-HeLa稳转细胞组凋亡率较阳性对照组降低21.19%(P<0.0001),较CT036-HeLa稳转细胞的PI3K抑制剂处理组降低21.84%(P<0.0001);WB检测结果显示CT036-HeLa稳转细胞组与对照组相比GSK 3β发生明显磷酸化,Bax表达明显下调,Bcl-2表达明显上调,与CT036-HeLa稳转细胞的PI3K抑制剂处理组相比GSK3β发生明显磷酸化,Bax表达明显下调,Bcl-2表达明显上调。结论1.沙眼衣原体假定功能蛋白CT036定位于衣原体感染细胞的包涵体膜。2.CT036的细胞内表达影响的差异磷酸化肽段所对应的301个蛋白质与衣原体感染相关的主要功能可能有调控细胞周期、细胞凋亡、免疫进程、囊泡运输及内吞等。3.CT036可能通过促进PI3K-Akt信号通路的GSK3β蛋白磷酸化而抑制细胞凋亡。(本文来源于《南华大学》期刊2019-05-01)

任驰[7](2019)在《贮藏温度和时间对宰后羊肉蛋白质磷酸化的影响》一文中研究指出蛋白质磷酸化是生物体内普遍且重要的一种蛋白质翻译后修饰现象,且在宰后肉中也发现存在蛋白质磷酸化修饰,并可对宰后肉的色泽、嫩度和保水性等品质产生影响。但在宰后肉复杂的生物体系中,蛋白质磷酸化水平是如何形成的及其影响因素研究甚少。宰后肉的贮藏温度对肉品质的保持十分重要,同时也对蛋白质磷酸化相关酶活性及反应物质的含量有影响。因此本文从模拟宰后羊肉特定贮藏温度入手,以宰后羊肉背最长肌为试验材料,探究不同贮藏温度和时间对宰后羊肉蛋白质磷酸化水平的影响,以期为明晰宰后羊肉蛋白质磷酸化形成提供理论依据。(1)将宰后羊背最长肌贮藏在25°C、15°C、4°C和-1.5°C下,测定pH值、乳酸含量、ATP含量和蛋白质磷酸化水平,并对相关性强的蛋白条带进行质谱鉴定。结果表明:宰后羊肉贮藏温度高,pH下降速率快,极限pH低且达到极限pH值的时间提前;25°C和15°C时,随着贮藏时间延长宰后羊肉肌原纤维蛋白磷酸化水平逐渐下降,4°C和-1.5°C时,随着贮藏时间延长宰后羊肉肌原纤维蛋白磷酸化水平先上升后下降,且-1.5°C抑制并延滞肌原纤维蛋白磷酸化水平;质谱鉴定发现,糖酵解相关酶及肌肉收缩相关蛋白是两大类主要的磷酸化蛋白质;ATP含量与单个蛋白条带磷酸化水平相关性高于温度和pH值。(2)将宰后羊背最长肌制备成肉糜,向肉糜中添加/不添加ATP作为ATP处理组和对照组,并贮藏在25°C、15°C、4°C和-1.5°C条件下,测定pH值、ATP含量、蛋白质磷酸化水平及蛋白降解情况。结果表明:4°C和-1.5°C贮藏前期ATP处理组高ATP含量抑制糖酵解进程,使得ATP处理组pH高于对照组,而贮藏后期ATP大量水解产生H~+,使得ATP处理组pH低于对照组;ATP处理组肌原纤维蛋白磷酸化水平显着高于对照组肌原纤维蛋白磷酸化水平(P<0.05),ATP除了直接影响蛋白质磷酸化水平,也可作用于糖酵解进程间接影响蛋白质磷酸化水平;ATP含量高抑制μ-钙蛋白酶、肌钙蛋白T和肌间线蛋白的降解。(3)提取羊背最长肌中的肌原纤维蛋白,外源加入碱性磷酸酶作为碱性磷酸酶处理组,不加入碱性磷酸酶作为对照组,分别在25°C、15°C、4°C、-1.5°C和pH 5.2、5.8、6.4条件下孵育,测定蛋白质磷酸化水平和碱性磷酸酶活性。结果表明:对照组中随着孵育时间延长肌原纤维蛋白磷酸化水平无显着变化(P>0.05),碱性磷酸酶处理组肌原纤维蛋白磷酸化水平受孵育温度和pH的影响,-1.5°C条件下或pH 5.2显着抑制碱性磷酸酶活性(P<0.05),不能降低肌原纤维蛋白磷酸化水平;碱性磷酸酶可催化自身发生去磷酸化反应,且当碱性磷酸酶催化自身去磷酸化后对其活性影响较小。(本文来源于《中国农业科学院》期刊2019-05-01)

李素贞,徐锋,徐平[8](2019)在《高转移肝癌细胞HCCLM6的酪氨酸磷酸化蛋白质组学研究》一文中研究指出目的探讨肝癌细胞系HCCLM6细胞的酪氨酸磷酸化(pTyr)肽段富集方法,建立快速、高效和高特异性的酪氨酸磷酸化蛋白质组学实验技术。方法通过基于SH2超亲体材料酪氨酸磷酸化肽段亲和纯化技术,并结合液相色谱-串联质谱联用(LC-MS/MS)实现HCCLM6细胞中酪氨酸磷酸化肽段的大规模富集;通过十二烷基磺酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)检测HCCLM6细胞蛋白的提取质量;LC-MS/MS检测富集得到的酪氨酸磷酸化肽段;采用MaxQuant软件实现对质谱数据的分析。结果实现了对HCCLM6细胞酪氨酸磷酸化肽段的大规模富集,建立了稳定高效的酪氨酸磷酸化蛋白质组学实验技术,共鉴定到1105个酪氨酸磷酸化蛋白,2666个酪氨酸磷酸化肽段,1884个酪氨酸磷酸化位点;酪氨酸磷酸化蛋白主要富集在黏附、细胞内吞、紧密连接等与转移相关的生物学进程;所鉴定的多种酪氨酸磷酸化蛋白质有效补充了已报道的酪氨酸磷酸化数据库,可为肝癌转移机制相关研究提供新的治疗靶点。结论建立了稳定高效的酪氨酸磷酸化蛋白质组学实验技术,实现了对HCCLM6细胞酪氨酸磷酸化肽段的大规模富集。(本文来源于《军事医学》期刊2019年02期)

李素贞[9](2019)在《肝癌转移机制的酪氨酸磷酸化蛋白质组学研究》一文中研究指出肝癌(Hepatocellular Carcinoma,HCC)是我国最常见的一种恶性肿瘤,近年来发病率和死亡率仍持续上升。肝癌的临床治疗手段有肝切除、肝移植、介入疗法等,尽管这些治疗手段为肝癌患者带来了福音,但是肝癌的死亡率并没有明显下降。造成这种局面的最主要原因是肝癌术后极易复发转移,且复发转移的机制未明,亟待研究。有多篇文献报道,蛋白质酪氨酸磷酸化修饰的紊乱跟肿瘤的转移密切相关,而酪氨酸磷酸化修饰是一类非常重要的翻译后修饰,被认为是细胞信号转导的主要载体,其生理功能非常关键。由于技术的限制,无论是基于金属氧化物亲和色谱或者亲和抗体的富集策略,磷酸化蛋白质组数据中酪氨酸磷酸化肽段一般也只有数百个,规模依然较小,从而不利于解析细胞内紊乱的酪氨酸磷酸化蛋白质。中科院大连化物所的边阳阳博士等开发了基于SH2结构域突变体的可以与酪氨酸磷酸化肽段高亲和力结合的超亲体(superbinder),利用该SH2超亲体在9个细胞系中鉴定到了10030个高可信的酪氨酸磷酸化位点。本实验室使用该材料,在原有实验体系上进行了优化,建立了快速、高效和高特异性酪氨酸磷酸化肽段富集技术,并利用该技术开展了肝癌转移机制的大规模酪氨酸磷酸化蛋白质组学研究。以遗传背景相仿的高低转移潜能细胞系MHCC97L和MHCC97H细胞作为研究肝癌转移的研究对象,使用弱转移潜能的Hep3B和HepG2细胞作为阴性对照细胞,以2 mg蛋白作为起始量,通过Ti~(4+)-IMAC一步富集,再通过SH2 superbinder材料二次富集,在四个细胞系中分别鉴定到1140-4691个不等的酪氨酸磷酸化肽段。通过分析不同转移潜能肝癌细胞系的酪氨酸磷酸化蛋白质组数据,发现酪氨酸磷酸化肽段的鉴定量有随着细胞系转移潜能增加而增加的趋势,并验证了高转移潜能细胞系整体的酪氨酸磷酸化水平更高。通过对高低转移潜能细胞系差异蛋白的生物信息学分析,我们发现高转移潜能细胞系(MHCC97L和MHCC97H)中显着上调的酪氨酸磷酸化蛋白质主要与细胞内吞、细胞迁移和侵袭等生物学过程密切相关,而这些生物学过程与肿瘤细胞的转移发生是密切相关的。进一步分析发现β-catenin Y489位点的磷酸化水平在高转移潜能肝癌细胞系中显着上调,推测β-catenin蛋白Y489位点磷酸化与肝癌细胞的转移有关。随后我们首先通过western blot实验证实高转移潜能肝癌细胞系的β-catenin Y489位点的磷酸化水平显着高于低转移潜能肝癌细胞系。随后通过位点突变实验,分别构建β-catenin Y489E和β-catenin Y489F来模拟磷酸化修饰激活和失活的状态,开展细胞划痕、transwell等生物学实验,证实β-catenin Y489位点磷酸化能够促进肝癌细胞的迁移和侵袭。(本文来源于《安徽医科大学》期刊2019-02-01)

石文昊,童梦莎,李恺,王钰珅,丁琛[10](2018)在《基于质谱的磷酸化蛋白质组学:富集、检测、鉴定和定量》一文中研究指出磷酸化是一种调控生命活动的重要翻译后修饰,调控生物的生长发育、信号转导、以及疾病的发生发展.从上世纪80年代开始,质谱应用于蛋白质磷酸化的检测中,极大地推动了磷酸化蛋白质组学的发展.质谱检测拥有高灵敏度、高通量的特点,更重要的是具有位点分辨率,因此基于质谱的磷酸化蛋白质组检测方法得到不断的发展和推广.常见的磷酸化蛋白质组研究,首先对磷酸化肽段进行富集,然后进行串联质谱分析,最后通过搜索引擎对修饰位点进行鉴定和定量.本文从这个叁个基本方面,对磷酸化蛋白质组研究进行综述,并对未来研究发展方向进行讨论.(本文来源于《生物化学与生物物理进展》期刊2018年12期)

蛋白质磷酸化论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

以不同炭疽病抗性的草莓品种‘红颊’和‘甜查理’的茎组织为试验材料,采用非标记定量磷酸化蛋白质组学技术分析其在炭疽菌侵染胁迫后磷酸化蛋白组的变化。结果表明,‘红颊’和‘甜查理’中分别有154个和173个磷酸化蛋白在病菌侵染后发生了1.5倍以上的差异表达。功能注释归类分析发现,大部分差异磷酸化蛋白参与了大分子复合体形成及结构定位、刺激应答和信号转导等生物学过程。生物信息学分析进一步表明,相对于易感品种‘红颊’,高抗品种‘甜查理’差异磷酸化蛋白特异性表现出S*Y和T*F 2种保守结构域类型,且植物激素信号传导途径和碳固定途径都发生了更高程度的磷酸化。本研究结果揭示出,这些信号通路在防御病菌入侵过程中发挥了重要作用,为后续深入揭示草莓-炭疽病菌互作分子机制及草莓抗病新品种选育奠定了宝贵的理论研究基础。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

蛋白质磷酸化论文参考文献

[1].陈重阳,李影超,余海涛,任晓虎,许本洪.低剂量铜暴露改变阿尔茨海默病模型小鼠的海马磷酸化蛋白质谱并扰乱其线粒体功能[C].中国毒理学会第九次全国毒理学大会论文集.2019

[2].余红,严建立,裘劼人,王淑珍,忻雅.草莓响应炭疽菌侵染的差异磷酸化蛋白质组学分析[J].浙江大学学报(农业与生命科学版).2019

[3].聂燕芳,邹小桃,王振中,李云锋.适合于2-DE分析的水稻质膜磷酸化蛋白质富集方法的建立[C].中国植物病理学会2019年学术年会论文集.2019

[4].孙冉冉,聂燕芳,张健,王振中,李云锋.水杨酸诱导水稻叶片的磷酸化蛋白质组学分析[C].中国植物病理学会2019年学术年会论文集.2019

[5].杨燃,宋洪波,黄群,刘丽莉,邱宁.鸡蛋清磷酸化蛋白质组鉴定与分析[J].食品科学.2019

[6].栾秀丽.沙眼衣原体假定功能蛋白CT036的定位及磷酸化蛋白质组学分析[D].南华大学.2019

[7].任驰.贮藏温度和时间对宰后羊肉蛋白质磷酸化的影响[D].中国农业科学院.2019

[8].李素贞,徐锋,徐平.高转移肝癌细胞HCCLM6的酪氨酸磷酸化蛋白质组学研究[J].军事医学.2019

[9].李素贞.肝癌转移机制的酪氨酸磷酸化蛋白质组学研究[D].安徽医科大学.2019

[10].石文昊,童梦莎,李恺,王钰珅,丁琛.基于质谱的磷酸化蛋白质组学:富集、检测、鉴定和定量[J].生物化学与生物物理进展.2018

论文知识图

叁维波浪状聚合物修饰的磷酸锆毛细管...叁批重复实验数据集鉴定磷酸化肽段结...处理后Müller中蛋白质表达率蛋氨酸和赖氨酸对奶牛乳腺上皮细胞核...扁蓿豆Actin基因蛋白的跨膜结构预测结...:Westernblotting免疫印迹检测AOPP...

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蛋白质磷酸化论文_陈重阳,李影超,余海涛,任晓虎,许本洪
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