深圳杨梅坑海域造礁石珊瑚共生藻分类和遗传多样性研究

深圳杨梅坑海域造礁石珊瑚共生藻分类和遗传多样性研究

论文摘要

通过核糖体ITS(Internal Transcribed Spacer)的核苷酸序列研究了深圳杨梅坑海域20种47个造礁石珊瑚样本的共生藻。通过ITS序列分析,与GenBank上的4种不同的共生藻构建Neighbor-Joining聚类树,进行石珊瑚共生藻分类和遗传多样性分析。结果表明,该海域的造礁石珊瑚共生藻属于2种不同的种类(亚系群),19个样品属于C1亚系群共生藻,1个样品属于C15亚系群共生藻,C1和C15两个亚系群共生藻之间的遗传距离为0. 01。将深圳杨梅坑海域得到的ITS序列与NCBI数据库上的福建东山海域、广东徐闻地区的C1系共生藻进行比对,只有深圳杨梅坑海域藻类样本平均(A+T)碱基含量为49. 4%,(A+T)含量小于(G+C)含量。构建Neighbor-Joining聚类树表明,深圳杨梅坑海域石珊瑚共生藻与福建东山海域的亲缘关系较近,而与广东徐闻地区的亲缘关系较远,地理隔离是主要的因素。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 实验材料
  •   1.2 实验方法
  •     1.2.1 共生藻的分离
  •     1.2.2 共生藻基因组总DNA的提取
  •     1.2.3 引物设计合成
  •     1.2.4 PCR扩增和DNA测序
  •     1.2.5 数据分析及处理
  • 2 结果与讨论
  •   2.1 石珊瑚共生藻ITS基因碱基组成分析
  •   2.2 基于ITS序列构建的聚类关系分析
  •   2.3 基于ITS序列研究不同海域共生藻的遗传多样性
  •   2.4 讨论
  • 3 结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 陈文静,佟飞,陈丕茂,朱爱意,张露,李丹丹,龙鑫玲

    关键词: 海洋生物学,造礁石珊瑚,共生藻,序列,遗传多样性,深圳杨梅坑海域

    来源: 应用海洋学学报 2019年02期

    年度: 2019

    分类: 基础科学

    专业: 生物学

    单位: 浙江海洋大学,中国水产科学研究院南海水产研究所,中国水产科学研究院南海水产研究所深圳实验基地

    基金: 深科技创新[2016]86号资助项目(JCYJ20160331141759795),国家海洋公益性行业科研专项经费资助项目(201405020-2)

    分类号: Q949.2

    页码: 284-291

    总页数: 8

    文件大小: 817K

    下载量: 129

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