基于网络药理学的雷公藤干预IgAN潜在靶点预测及作用机制分析

基于网络药理学的雷公藤干预IgAN潜在靶点预测及作用机制分析

论文摘要

目的基于网络药理学的理念,运用网络分析的技术,拟探讨雷公藤干预IgAN(immunoglobulin Anephropathy)的潜在靶点预测及其作用机制。方法利用TCMSP平台收集雷公藤的重要活性成分及潜在相关靶点信息,分别从GeneCards数据库、OMIM数据库中获取与IgAN相关联的靶点;采用STRING平台构建PPI作用网络,使用Cytoscape 3.7.0对药物-活性成分-潜在靶点-疾病网络进行构建;通过DAVID数据库对相关疾病-药物靶点基因进行GO生物功能富集分析和KEGG代谢通路分析。结果检索出雷公藤成分共144个,筛选获得重要活性成分共29个;收集到潜在作用靶点基因122个。检索出IgAN相关靶点333个,基因功能GO富集分析及KEGG代谢通路富集结果显示,雷公藤中的9个有效成分干预26个疾病靶点,通过对20个生物过程、12个分子功能、13个细胞成分产生作用。得到通路共50条,通过可视化分析,取靠前的30条通路,其中6条通路可能与IgAN发生及发展密切相关。结论该研究基于网络药理学方法,表明了雷公藤中药多成分、多靶点、多功能、多通路干预IgAN的作用,为后续临床及研究开展相应工作提供了较为可观的信息和理论依据。

论文目录

  • 1 资料与方法
  •   1.1 雷公藤重要活性成分筛选及靶点基因的预测
  •   1.2 构建与分析活性成分-预测靶点网络
  •   1.3 IgAN相关靶点基因的收集
  •   1.4 治疗IgAN靶点的预测及构建与分析药物-活性成分-靶点-疾病网络
  •   1.5 相关靶点基因功能分析及通路分析
  • 2 结果
  •   2.1 雷公藤的重要活性成分及对应的靶点基因
  •   2.2 IgA肾病相关靶点收集
  •   2.3 雷公藤重要活性成分-靶点基因网络构建与分析
  •   2.4 药物活性成分-靶点-疾病(IgAN)的PPI网络构建与分析
  •   2.5 药物-活性成分-靶点-疾病网络的构建与分析
  •   2.6 相关作用靶点基因功能分析及通路分析
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 熊冲,方桂玉,龚彩弟,陈虹彤,赵辉,王梓霞,陈萍,钟建

    关键词: 雷公藤,网络药理学,生物信息学,活性成分,靶点基因

    来源: 世界科学技术-中医药现代化 2019年11期

    年度: 2019

    分类: 医药卫生科技

    专业: 中药学

    单位: 广西中医药大学研究生学院,安徽中医药大学研究生学院,广西中医药大学第一附属医院

    基金: 国家自然科学基金委员会地区科学基金项目(81760807):基于SIRT3调控能量敏感通路AMPKPCG-1CPT1A促进肾纤维化PTCs生成机制研究“益肾活血法”抗肾纤维化效应,负责人:钟建,广西自然科学基金委员会项目(2016JJA140633):从周细胞-内皮细胞cross-talk调控肾纤维化机制研究CKD“久病入络”实质及益肾活血法干预效应,负责人:钟建,广西中医药大学2019年研究生教育创新计划项目立项课题(YCSY20190066):基于数据挖掘的IgA肾病中医证候及用药特点研究,负责人:陈虹彤

    分类号: R285

    页码: 2375-2385

    总页数: 11

    文件大小: 2367K

    下载量: 324

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