新疆首次检测到猪圆环病毒3型及其全基因组进化分析

论文摘要

为了解新疆某规模化猪场猪圆环病毒3型（Porcine circovirus type 3,PCV-3）的流行现状、分子生物学特征和遗传演化规律,试验应用巢式PCR技术对新疆某规模化猪场的45份血液样本进行PCV-3基因检测和测序;利用TempliPhi 100 amplification Kit对检测到的PCV-3阳性样本进行全基因组扩增,将扩增得到的基因组片段克隆到Trans-T1载体中,经测序、拼接获得PCV-3基因组全长序列;利用MEGA 6. 0. 6和MegAlign软件对其全基因组进行遗传进化分析和同源性比较。结果表明:在新疆地区首次检测到PCV-3,且该猪场PCV-3的阳性率为20%（9/45）,并获得PCV-3全基因组序列,长度为2 000 bp,命名为PCV-3/CN/Xinjiang-11/2018;与美国株PCV-3-US-SD 2016处于同一进化分支,属于3b亚群;与国内PCV-3/Pig/CN/Hebei20170320的同源性最高（99. 4%）,与PCV-3-CN/Fujian-820-2016和PCV-3-CN/Fujian-318-2017的同源性最低（97. 8%）,与国外美国株PCV-3-US-SD 2016的同源性最高（99. 1%）。说明新疆地区猪场已经存在PCV-3,应该引起养猪业的重视。

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 任敏,屈勇刚,魏其,宋敏,谷思颖,杨慧敏,吴圆圆,于会举

关键词: 猪圆环病毒型,分离鉴定,全基因组测序,遗传进化分析

来源: 黑龙江畜牧兽医 2019年21期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,畜牧与动物医学

单位: 石河子大学动物科技学院

基金: 国家自然科学基金项目(U1503283)

分类号: S852.651

DOI: 10.13881/j.cnki.hljxmsy.2019.01.0189

页码: 76-80+86

总页数: 6

文件大小: 532K

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标签：猪圆环病毒型论文;  分离鉴定论文;  全基因组测序论文;  遗传进化分析论文;