烟草β-微管蛋白基因NtTubB的克隆及逆境响应分析

烟草β-微管蛋白基因NtTubB的克隆及逆境响应分析

论文摘要

为明确烟草NtTubB在烟草中的生物学功能,在烟草K326中同源克隆到1个TubB蛋白基因NtTubB,并对其基因结构、生物信息学预测、进化关系以及逆境下的表达模式进行分析。结果表明,NtTubB基因cDNA全长为2 783 bp,其中开放阅读框2 475 bp,由3个外显子和2个内含子组成,编码443个氨基酸残基组成的亲水蛋白。NtTubB蛋白序列无信号肽和跨膜结构域,存在多个磷酸化位点,主要定位于细胞质中,序列高度保守,尤其是N端序列,含有2个保守结构域(GTPase domain和C-terminal domain),均属于Tubulin/FtsZ family家族。高级结构以α-螺旋和无规卷曲为主。进化分析表明,普通烟草NtTubB的氨基酸序列与林烟草NsTubB高度同源。逆境响应分析表明,NtTubB基因受脱落酸(ABA)、水杨酸(SA)、赤霉素(GA)、茉莉酸甲酯(MeJA)、过氧化氢(H2O2)、高盐、低温和高温诱导,暗示烟草NtTubB基因参与了多种激素和非生物胁迫的应答反应。

论文目录

  • 1 结果与分析
  •   1.1 NtTubB基因的克隆及结构分析
  •   1.2 NtTubB基因编码蛋白的生物信息学预测
  •     1.2.1 NtTubB蛋白理化性质分析及亚细胞定位分析
  •     1.2.2 NtTubB蛋白跨膜结构域、磷酸化位点及亲/疏水性预测分析
  •     1.2.3 NtTubB蛋白保守域及蛋白结构预测分析
  •   1.3 NtTubB系统进化分析
  •   1.4 NtTubB基因在逆境胁迫下的表达模式分析
  • 2 讨论
  • 3 材料与方法
  •   3.1 实验材料
  •   3.2 植物胁迫处理
  •   3.3 RNA提取及cDNA第一链合成
  •   3.4 烟草NtTubB基因的克隆和CDS全长获得
  •   3.5 生物信息学分析
  •   3.6 烟草NtTubB基因的表达分析
  • 作者贡献
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 李琦瑶,周培禄,王树声,刘光亮,杨银菊,曾文龙,陈志厚,郑璇,陈爱国

    关键词: 烟草,微管蛋白,基因克隆,逆境响应,表达与分析

    来源: 分子植物育种 2019年13期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,农作物

    单位: 中国农业科学院烟草研究所农业部烟草生物学与加工重点实验室,中国农业科学院研究生院,福建省烟草农业科学研究所龙岩分所,福建省烟草农业科学研究所南平分所

    基金: 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(1610232016019),福建省烟草公司龙岩市公司项目(LYK-201302),福建省烟草公司南平市公司项目(NYK2012-08-6)共同资助

    分类号: Q943.2;S572

    DOI: 10.13271/j.mpb.017.004210

    页码: 4210-4219

    总页数: 10

    文件大小: 6503K

    下载量: 96

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