一个新型牛樟芝PR-PKS基因的克隆及表达分析

论文摘要

为了解牛樟芝中聚酮化合物的生物合成机理及聚酮合酶基因功能,从牛樟芝基因组挖掘并克隆得到一个部分还原型PKS（PR-PKS）基因（AcPKS3）,并对其进行生物信息学分析及表达谱分析。结果显示,AcPKS3（GenBank登录号:MG988206）DNA全长8 286 bp,有22个内含子,其外显子共编码2 285个氨基酸;结构域依次为KS-AT-KR-ACP-SDR,各结构域的活性保守位点为β-酮基合成酶（DTACSS）、酰基转移酶（GHSAGETA）、酮基还原酶（YLLVGGIG）、酰基转移酶（YGLDSITSA）、短链醇脱氢酶与NAD（P）H结合的N端保守序列（ITGTTGSFG）及活性保守位点（YTESK）;AcPKS3与6-甲基水杨酸合成酶的亲缘关系较近;不同碳源中葡萄糖,不同氮源中牛肉浸粉、酪蛋白胨、土豆蛋白胨可促进AcPKS3基因表达。本研究为牛樟芝聚酮合酶功能研究及牛樟芝基因资源利用提供参考。

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 原晓龙,华梅,陈剑,王娟,杨宇明,王毅

关键词: 牛樟芝,部分还原型,生物信息学分析,基因表达

来源: 微生物学杂志 2019年01期

年度: 2019

分类: 基础科学,农业科技

专业: 生物学,农作物

单位: 云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室

基金: 国家自然科学地区基金项目(31860177),云南省面上基金项目(2016FB055),云南省对外科技合作计划项目(2015IA004)

分类号: S567.3;Q78

页码: 11-19

总页数: 9

文件大小: 1886K

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标签：牛樟芝论文;  部分还原型论文;  生物信息学分析论文;  基因表达论文;