胭脂花及小报春钙调素类似蛋白基因CML19的克隆与表达分析

胭脂花及小报春钙调素类似蛋白基因CML19的克隆与表达分析

论文摘要

CML是一类重要的Ca2+响应蛋白,为了研究CML蛋白对报春花自交不亲和性的影响,该研究从胭脂花和小报春转录组数据中分别筛选出PmCML19和PfCML19基因,并对这2个基因进行全长克隆、生物信息学分析以及基因亚细胞定位和表达模式分析。结果发现:(1)PmCML19和PfCML19基因全长均为435 bp,所编码蛋白的氨基酸相似度达80.56%,均为酸性亲水性蛋白,包含4个EF手性结构;同源分析表明, PmCML19和PfCML19的亲缘关系与中华猕猴桃AcCML19最近,而拟南芥家族中的AtCML40与这2个蛋白的氨基酸序列相似度分别为44%和46%。(2)亚细胞定位结果表明,PmCML19和PfCML19基因在细胞核和细胞膜上均表达。(3)实时荧光定量PCR结果表明,PmCML19和PfCML19基因在花药中的表达量均高于雌蕊;在胭脂花和小报春亲和授粉组合的雌蕊中具有较高的表达量,而在不亲和授粉组合的雌蕊中表达量显著降低。研究推测,胭脂花和小报春CML19基因与报春花的自交不亲和性密切相关,为进一步研究异型自交不亲和遗传机制提供了新思路。

论文目录

  • 1 材料和方法
  •   1.1 材 料
  •   1.2 方 法
  •     1.2.1 PmCML19和PfCML19基因克隆
  •     1.2.2 PmCML19和PfCML19基因生物信息学分析
  •     1.2.3 PmCML19和PfCML19基因亚细胞定位
  •     1.2.4 PmCML19和PfCML19基因表达模式分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 PmCML19和PfCML19基因全长克隆
  •   2.2 PmCML19和PfCML19基因理化性质预测和结构分析
  •   2.3 PmCML19和PfCML19编码蛋白氨基酸序列同源性分析
  •   2.4 PmCML19和PfCML19基因亚细胞定位
  •   2.5 PmCML19和PfCML19基因表达模式分析
  • 3 讨 论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 司未佳,卢婉佩,刘颖,王佳,程堂仁,潘会堂

    关键词: 报春花属,钙调素类似蛋白,自交不亲和,生物信息学分析

    来源: 西北植物学报 2019年04期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,农业科技

    专业: 生物学,园艺

    单位: 花卉种质创新与分子育种北京市重点实验室国家花卉工程技术研究中心城乡生态环境北京实验室北京林业大学园林学院

    基金: 中央高校基本科研业务费专项资金(2015ZCQ-YL-03),教育部新世纪优秀人才计划(NCET-10-0231)

    分类号: Q943.2;S682.15

    页码: 603-612

    总页数: 10

    文件大小: 2089K

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