应用Illumina MiSeq高通量测序技术分析巴东地区豆瓣酱中微生物多样性

应用Illumina MiSeq高通量测序技术分析巴东地区豆瓣酱中微生物多样性

论文摘要

为了解湖北省恩施市巴东地区豆瓣酱中微生物的多样性,采用Illumina MiSeq高通量测序技术,分析豆瓣酱中细菌16S r RNA及真菌18S rRNAV4区基因序列,进而比较豆瓣酱微生物的群落结构组成及多样性差异。结果 3个样品共获得117644条有效序列,867个OTUs数目。多样性分析表明,豆瓣酱中具有高度的微生物群落多样性。微生物群落组成分析表明,样品中子囊菌门(Ascomycota,95.84%)、变形菌门(Proteobacteria,47.13%)、厚壁菌门(Firmicutes,32.37%)、放线菌(Actinobacteria,12.87%)为优势菌门,所占比例都超过了10.0%。在豆瓣酱样品中分别鉴定出311个细菌属和16个真菌属,优势细菌和真菌属平均相对含量分别为8.09%和24.74%,细菌及真菌多样性在属的水平上差异显著(p<0.05)。研究结果加深了对豆瓣酱微生物群落组成和多样性的认识,以期为巴东地区豆瓣酱中微生物菌种资源的发掘与保护提供理论依据。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料与试剂设备
  •   1.2 实验方法
  •     1.2.1 宏基因组提取与检测
  •     1.2.2 细菌16S rRNA序列扩增
  •     1.2.3 真菌18s rRNA序列扩增
  •     1.2.4 PCR产物纯化、定量及Mi Seq高通量测序
  •   1.3 数据分析处理及图表绘制
  •     1.3.1 数据分析
  •     1.3.2 图表绘制
  • 2 结果与分析
  •   2.1 样品序列丰富度和多样性评估
  •   2.2 OTU统计及分类学分析
  •   2.3 基于不同分类地位微生物菌群相对含量分析
  • 3 结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 赵馨馨,崔梦君,董蕴,倪慧,单春会,郭壮

    关键词: 豆瓣酱,高通量测序技术,细菌真菌群落结构,微生物多样性

    来源: 现代食品科技 2019年09期

    年度: 2019

    分类: 工程科技Ⅰ辑,基础科学

    专业: 生物学,轻工业手工业

    单位: 湖北文理学院食品科学技术学院,石河子大学食品学院

    基金: 国家自然科学基金青年科学基金项目(31501455)

    分类号: TS264.24;TS201.3

    DOI: 10.13982/j.mfst.1673-9078.2019.9.039

    页码: 297-303

    总页数: 7

    文件大小: 2405K

    下载量: 277

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