甾体化合物C1,2位高效生物脱氢菌株的构建与应用

甾体化合物C1,2位高效生物脱氢菌株的构建与应用

论文摘要

C1,2位脱氢反应是工业上生产甾体药物的重要反应,简单节杆菌(Arothrobacter simplex)则是研究和应用最广泛的C1,2位脱氢菌株。目前在国内主要是利用简单节杆菌对醋酸可的松(CA)进行脱氢反应,从而实现醋酸泼尼松(PA)的工业化生产,简单节杆菌高效脱氢菌株的改造对甾体药物的生产具有重要意义。本研究以来源于简单节杆菌的3-甾酮-Δ1-脱氢酶(KsdD)为研究对象,构建高表达3-甾酮-Δ 1-脱氢酶基因的工程菌株,并尝试建立简单节杆菌的基因敲除体系。克隆简单节杆菌来源的KsdD基因,构建于表达载体pART2中,以简单节杆菌为表达宿主,成功构建7株过表达工程菌株,分别为pART2-WT、pART2-W299A、pART2-W299G、pART2-KsdD1、pART2-KsdD2、pART2-KsdD3、pART2-KsdD4。通过全细胞转化和HPLC分析方法,使用过表达工程菌株对5种甾体化合物(醋酸可的松、可的松、雄烯二酮、甲睾酮、睾酮)进行全细胞转化分析。结果表明,由色氨酸突变为丙氨酸和甘氨酸的pART2-W299A、pART2-W299G工程菌株转化效率高于pART2-WT、pART2-KsdD3工程菌株和对照菌株;而 pART2-KsdD1、pART2-KsdD2、pART2-KsdD4工程菌株在底物转化中表现出了选择偏好性。基于同源重组策略,采用pK18mobsacB质粒构建携带KsdLD3上下游同源臂的自杀质粒,电转化至简单节杆菌,通过筛选验证并未得到期望的敲除菌,可能是蔗糖果聚糖基因(SacB)不能在简单节杆菌中起到反向筛选的作用。通过CRISPR/Cas9基因编辑技术,构建了携带有Cas9基因、KsdD3 N20的sgRNA、删除pART2质粒sgRNA的敲除载体,电转化简单节杆菌,亦未得到敲除菌株。经过分析,对敲除载体进行了改良及敲除方案的调整,得到4个优化重组敲除质粒(pAS481、pAS482、pAS491、pAS492),但其敲除体系的可行性正在进一步验证。

论文目录

  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 1 前言
  •   1.1 甾体化合物概述
  •     1.1.1 甾体化合物结构
  •     1.1.2 甾体化合物在医药行业的应用
  •     1.1.3 甾体化合物的生产
  •   1.2 微生物对甾体C1,2位脱氢反应的研究进展
  •     1.2.1 甾体化合物C1,2位脱氢反应的机理
  •     1.2.2 具备C1,2位脱氢能力的菌种
  •   1.3 简单节杆菌的概述及研究进展
  •     1.3.1 简单节杆菌遗传背景的简介
  •     1.3.2 简单节杆菌C1,2位脱氢研究概述
  •     1.3.3 简单节杆菌C1,2位脱氢酶(KsdD)及其高效表达
  •   1.4 KsdD的基因敲除体系研究
  •     1.4.1 非依赖自身同源重组的基因敲除体系
  •     1.4.2 依赖自身同源重组的基因敲除系统
  •     1.4.3 CRISPR-Cas9编辑技术的敲除系统
  •   1.5 本课题的立题背景及意义
  •   1.6 本课题研究内容
  • 2 材料与方法
  •   2.1 实验材料
  •     2.1.1 菌株与质粒
  •     2.1.2 主要试剂
  •     2.1.3 主要实验仪器
  •     2.1.4 培养基
  •     2.1.5 相关溶液
  •   2.2 实验方法
  •     2.2.1 简单节杆菌菌体培养
  •     2.2.2 简单节杆菌中EGFP异源表达工程菌的构建
  •     2.2.3 简单节杆菌工程菌株的构建
  •     2.2.4 基因敲除载体的构建
  •   2.3 分析方法
  •     2.3.1 甾体化合物的测定方法
  • 3 结果与讨论
  •   3.1 简单节杆菌中脱氢酶的过表达研究
  •     3.1.1 绿色荧光蛋白异源表达工程菌的构建
  •     3.1.2 简单节杆菌KsdD3过表达工程菌的构建
  •     3.1.3 工程菌A.simplex/pART2-KsdD3(WT/W299A/W299G)甾体化合物的转化水平分析
  •     3.1.4 简单节杆菌KsdD1/KsdD2/KsdD4过表达工程菌的构建
  •     3.1.5 工程菌A.simplex/pART2-KsdD1(KsdD2/KsdD4)甾体化合物的转化水平分析
  •   3.2 简单节杆菌KsdD3基因敲除的初步探索
  •     3.2.1 简单节杆菌pK18mobsacB-KsdD3自杀载体的构建
  •     3.2.2 简单节杆菌KsdD3基因一次重组菌株的筛选和验证
  •     3.2.3 简单节杆菌KsdD3整合片段的构建及菌株筛选验证
  •     3.2.4 简单节杆菌KsdD3基因的CRISPR-Cas9敲除载体构建
  •     3.2.5 简单节杆菌KsdD3基因的CRISPR-Cas9敲除菌株的筛选
  •     3.2.6 简单节杆菌的CRISPR-Cas9敲除载体构建的优化
  • 4 结论
  •   4.1 全文总结
  •   4.2 论文创新点
  •   4.3 论文不足之处
  • 5 展望
  • 6 参考文献
  • 7 攻读硕士学位期间发表论文情况
  • 8 致谢
  • 文章来源

    类型: 硕士论文

    作者: 侯亚利

    导师: 毛淑红

    关键词: 简单节杆菌,脱氢酶,甾酮脱氢酶,过表达,转化效率,基因敲除

    来源: 天津科技大学

    年度: 2019

    分类: 基础科学

    专业: 生物学

    单位: 天津科技大学

    基金: 国家自然科学基金

    分类号: Q78

    DOI: 10.27359/d.cnki.gtqgu.2019.000029

    总页数: 65

    文件大小: 4916K

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